MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 chromosome

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015391	TTGAAA	2	12	7103	7114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	328956388
2	NC_015391	GAAGAT	2	12	7849	7860	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	328956388
3	NC_015391	GTATTG	2	12	11400	11411	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	328956392
4	NC_015391	AGGTAA	2	12	12611	12622	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	328956393
5	NC_015391	TCAAAT	2	12	17553	17564	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956397
6	NC_015391	CACTGG	2	12	18293	18304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328956398
7	NC_015391	TACAGG	2	12	20431	20442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956399
8	NC_015391	TGGACA	3	18	21357	21374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956400
9	NC_015391	TCTTTT	2	12	22906	22917	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	328956403
10	NC_015391	GAAAAT	2	12	23872	23883	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328956404
11	NC_015391	AATAGC	2	12	25443	25454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328956406
12	NC_015391	GAAAAT	2	12	28159	28170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328956408
13	NC_015391	TTAGCT	2	12	29663	29674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	328956409
14	NC_015391	AAAAGA	2	12	29773	29784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956409
15	NC_015391	TGCAAT	2	12	30637	30648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956410
16	NC_015391	AAAGAA	2	12	32583	32594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956412
17	NC_015391	AACTAA	2	12	34560	34571	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	328956414
18	NC_015391	TAGATG	2	12	35448	35459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328956415
19	NC_015391	CAAAGT	2	12	36015	36026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328956416
20	NC_015391	AACTGC	2	12	36893	36904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	328956417
21	NC_015391	ATATTA	2	12	38394	38405	50 %	50 %	0 %	0 %	328956418
22	NC_015391	TTTATC	2	12	42256	42267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	328956422
23	NC_015391	AATGAA	2	12	43114	43125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328956424
24	NC_015391	CTTTAG	2	12	51633	51644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	328956429
25	NC_015391	CTGGAA	2	12	53759	53770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956431
26	NC_015391	AAAGCT	2	12	54499	54510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328956431
27	NC_015391	GGGAAT	2	12	57909	57920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	328956433
28	NC_015391	CAGCTT	2	12	59405	59416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328956434
29	NC_015391	TTTTTC	2	12	61831	61842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	328956436
30	NC_015391	TAAGAT	2	12	62925	62936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	328956437
31	NC_015391	AAATAT	2	12	91576	91587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328956465
32	NC_015391	TTATAT	2	12	93662	93673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328956468
33	NC_015391	GCAGTT	2	12	94168	94179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	328956469
34	NC_015391	TAAAAA	2	12	96914	96925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	328956473
35	NC_015391	GAAATC	2	12	97482	97493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328956473
36	NC_015391	TTTCTG	2	12	97777	97788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	328956473
37	NC_015391	ATCGTA	2	12	107136	107147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956485
38	NC_015391	GTCATT	2	12	107238	107249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	328956485
39	NC_015391	AAAATA	2	12	116891	116902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	328956494
40	NC_015391	AACTGA	2	12	121106	121117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328956497
41	NC_015391	TTAGAA	2	12	121749	121760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	328956497
42	NC_015391	ACCAAA	2	12	125795	125806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328956501
43	NC_015391	TGCAAT	2	12	129716	129727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956504
44	NC_015391	CTTTTT	2	12	131638	131649	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	328956508
45	NC_015391	ATCAAA	2	12	131917	131928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	328956508
46	NC_015391	GATGGA	2	12	135526	135537	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	328956511
47	NC_015391	AAAAGA	2	12	136215	136226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956511
48	NC_015391	TAAACA	2	12	138330	138341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	328956514
49	NC_015391	ATTAGT	2	12	138415	138426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	328956514
50	NC_015391	TGATAT	2	12	140369	140380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	328956516
51	NC_015391	CTATTA	2	12	144120	144131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	328956521
52	NC_015391	ATTTTT	2	12	145822	145833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	328956522
53	NC_015391	TAAAAT	2	12	152831	152842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328956530
54	NC_015391	ATGGTA	2	12	154916	154927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328956533
55	NC_015391	AAAAGA	2	12	155290	155301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956534
56	NC_015391	TGGTTT	2	12	162265	162276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328956543
57	NC_015391	CAATAT	2	12	164423	164434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956545
58	NC_015391	CAAAAA	2	12	166354	166365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	328956547
59	NC_015391	TTCTGG	2	12	167561	167572	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	328956548
60	NC_015391	TTGCTA	2	12	167887	167898	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	328956548
61	NC_015391	TCTAAA	2	12	173563	173574	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956554
62	NC_015391	ATACGC	2	12	174745	174756	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	328956555
63	NC_015391	CAATTG	2	12	174975	174986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956555
64	NC_015391	CAGATG	2	12	179381	179392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956561
65	NC_015391	TACAAG	2	12	183414	183425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328956565
66	NC_015391	GTAGAG	2	12	189634	189645	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	328956570
67	NC_015391	CTTGAA	2	12	191408	191419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956571
68	NC_015391	ACAGAA	2	12	191948	191959	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	328956571
69	NC_015391	TAGCAG	2	12	197542	197553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956576
70	NC_015391	ACGGAA	2	12	199516	199527	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	328956578
71	NC_015391	GGTAAA	2	12	204708	204719	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	328956582
72	NC_015391	AGCTGA	2	12	226684	226695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956589
73	NC_015391	ATCAAT	2	12	238040	238051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956601
74	NC_015391	CAGCCG	2	12	238462	238473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328956601
75	NC_015391	TCAGCA	2	12	242434	242445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	328956604
76	NC_015391	AAAGGC	2	12	243496	243507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	328956605
77	NC_015391	AAAAGA	2	12	245332	245343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956607
78	NC_015391	TAAACT	2	12	246524	246535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956609
79	NC_015391	GATTGA	2	12	247798	247809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328956610
80	NC_015391	TTATTT	2	12	247977	247988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	328956610
81	NC_015391	AGTAGA	2	12	249626	249637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	328956611
82	NC_015391	AAGAAA	2	12	251244	251255	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956614
83	NC_015391	TTTTCA	2	12	255938	255949	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	328956620
84	NC_015391	AATGAA	2	12	258643	258654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328956624
85	NC_015391	CCAAAT	2	12	263249	263260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	328956628
86	NC_015391	TCCGGT	2	12	263710	263721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328956628
87	NC_015391	TCATTT	2	12	264782	264793	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	328956629
88	NC_015391	TGCAAT	2	12	265830	265841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956630
89	NC_015391	AATGGT	2	12	268972	268983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328956631
90	NC_015391	TTATCT	2	12	273866	273877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	328956635
91	NC_015391	CTAATG	2	12	274548	274559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956635
92	NC_015391	TGGTGA	2	12	275349	275360	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	328956637
93	NC_015391	AAGAAA	2	12	281951	281962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956643
94	NC_015391	CATGGA	2	12	291932	291943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328956652
95	NC_015391	ATGGAT	2	12	293046	293057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328956653
96	NC_015391	GAAGAC	3	18	299318	299335	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	328956659
97	NC_015391	TCAACA	2	12	301426	301437	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	328956661
98	NC_015391	GCAGAA	2	12	301470	301481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	328956661
99	NC_015391	GTAGAA	2	12	303569	303580	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	328956662
100	NC_015391	TAAGAA	2	12	308054	308065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328956666
101	NC_015391	GCGGAA	2	12	312292	312303	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	328956669
102	NC_015391	TCAAGT	2	12	326335	326346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328956679
103	NC_015391	TAAATG	2	12	338314	338325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	328956686
104	NC_015391	GATATT	2	12	344480	344491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	328956693
105	NC_015391	GTTGGT	2	12	347596	347607	0 %	50 %	50 %	0 %	328956695
106	NC_015391	ACAAAG	2	12	348805	348816	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	328956696
107	NC_015391	TTTAAA	2	12	351444	351455	50 %	50 %	0 %	0 %	328956698
108	NC_015391	TCAAAT	2	12	361715	361726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956707
109	NC_015391	CTTAAA	2	12	366390	366401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328956712
110	NC_015391	GAAAAA	2	12	372305	372316	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328956716
111	NC_015391	CAACAG	2	12	372492	372503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	328956716
112	NC_015391	TGGAAT	2	12	376630	376641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328956719
113	NC_015391	GGGATT	2	12	376720	376731	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	328956719
114	NC_015391	TTAACT	2	12	377163	377174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	328956720
115	NC_015391	TTAGGC	2	12	377175	377186	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	328956720
116	NC_015391	TCCTTT	2	12	385658	385669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328956729
117	NC_015391	CTTTCA	2	12	385809	385820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	328956729
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340	NC_015391	AAAAGA	2	12	1008996	1009007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	328957302
341	NC_015391	TTTAGT	2	12	1009924	1009935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	328957303
342	NC_015391	TTCCAG	2	12	1011861	1011872	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328957307
343	NC_015391	GTTCAT	2	12	1012625	1012636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	328957307
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345	NC_015391	GGACAA	2	12	1017920	1017931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	328957311
346	NC_015391	GCAAAA	2	12	1019480	1019491	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	328957312
347	NC_015391	CTGCAT	2	12	1025310	1025321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328957315
348	NC_015391	TAAGAA	2	12	1027593	1027604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328957317
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455	NC_015391	ACGTCC	2	12	1288527	1288538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328957564
456	NC_015391	CAAAAG	2	12	1289478	1289489	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	328957565
457	NC_015391	TTTTCC	2	12	1291040	1291051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328957566
458	NC_015391	TTGTCT	2	12	1293031	1293042	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	328957567
459	NC_015391	TCTAAG	2	12	1295216	1295227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328957569
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462	NC_015391	TTTAAA	2	12	1307625	1307636	50 %	50 %	0 %	0 %	328957581
463	NC_015391	ATAAGT	2	12	1309335	1309346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	328957583
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