MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	CAATGT	2	12	7676	7687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328958810
2	NC_015390	GATGCA	2	12	10701	10712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328958814
3	NC_015390	TAAAAT	2	12	13369	13380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328958815
4	NC_015390	ATTTAA	2	12	14356	14367	50 %	50 %	0 %	0 %	328958816
5	NC_015390	CTAATA	2	12	18242	18253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328958821
6	NC_015390	AACAGA	2	12	24991	25002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	328958826
7	NC_015390	GATTTA	2	12	25034	25045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	328958826
8	NC_015390	AAAGGA	2	12	26473	26484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328958827
9	NC_015390	CTCCAG	2	12	32527	32538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328958836
10	NC_015390	ATTTTT	2	12	40105	40116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	328958845
11	NC_015390	GATAAT	2	12	40715	40726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	328958847
12	NC_015390	ATTTTC	2	12	41117	41128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	328958848
13	NC_015390	AGATTC	2	12	41314	41325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328958848
14	NC_015390	ATGAAA	2	12	42372	42383	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328958849
15	NC_015390	GAAATA	2	12	43959	43970	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328958851
16	NC_015390	AAAGTA	2	12	45220	45231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328958853
17	NC_015390	CTAGAA	2	12	45905	45916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	328958854

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.