MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TCATG	2	10	358	367	20 %	40 %	20 %	20 %	328958804
2	NC_015390	TTTAT	2	10	2588	2597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015390	TTATT	2	10	3418	3427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015390	TCTTA	2	10	3469	3478	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015390	GATAA	2	10	4178	4187	60 %	20 %	20 %	0 %	328958808
6	NC_015390	AAAGA	2	10	5231	5240	80 %	0 %	20 %	0 %	328958808
7	NC_015390	GAATA	2	10	6620	6629	60 %	20 %	20 %	0 %	328958810
8	NC_015390	AAATA	3	15	8961	8975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015390	AGAAA	2	10	9196	9205	80 %	0 %	20 %	0 %	328958812
10	NC_015390	AAGAA	2	10	9716	9725	80 %	0 %	20 %	0 %	328958812
11	NC_015390	AAAAC	2	10	11768	11777	80 %	0 %	0 %	20 %	328958814
12	NC_015390	AATGG	2	10	12119	12128	40 %	20 %	40 %	0 %	328958815
13	NC_015390	TGATT	2	10	12742	12751	20 %	60 %	20 %	0 %	328958815
14	NC_015390	TTTAC	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	328958815
15	NC_015390	TAAAA	2	10	13407	13416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015390	ATTTC	2	10	17819	17828	20 %	60 %	0 %	20 %	328958820
17	NC_015390	AAATT	2	10	17967	17976	60 %	40 %	0 %	0 %	328958820
18	NC_015390	ATTTT	2	10	18470	18479	20 %	80 %	0 %	0 %	328958821
19	NC_015390	CAAAC	2	10	18887	18896	60 %	0 %	0 %	40 %	328958821
20	NC_015390	CCTTT	2	10	25299	25308	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015390	GAACT	2	10	26193	26202	40 %	20 %	20 %	20 %	328958827
22	NC_015390	AAATA	2	10	26244	26253	80 %	20 %	0 %	0 %	328958827
23	NC_015390	TGAAA	2	10	26398	26407	60 %	20 %	20 %	0 %	328958827
24	NC_015390	TAATT	2	10	26664	26673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015390	CCTGA	2	10	27471	27480	20 %	20 %	20 %	40 %	328958829
26	NC_015390	AAATC	2	10	27701	27710	60 %	20 %	0 %	20 %	328958829
27	NC_015390	TAATT	2	10	28894	28903	40 %	60 %	0 %	0 %	328958831
28	NC_015390	CAAAA	2	10	29420	29429	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015390	TTTTC	2	10	29826	29835	0 %	80 %	0 %	20 %	328958833
30	NC_015390	TTTAA	2	10	29876	29885	40 %	60 %	0 %	0 %	328958833
31	NC_015390	CTCTC	2	10	30037	30046	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015390	GCTTA	2	10	30849	30858	20 %	40 %	20 %	20 %	328958835
33	NC_015390	AAGGT	2	10	30923	30932	40 %	20 %	40 %	0 %	328958835
34	NC_015390	TAAAA	2	10	31053	31062	80 %	20 %	0 %	0 %	328958835
35	NC_015390	AATAA	2	10	31357	31366	80 %	20 %	0 %	0 %	328958835
36	NC_015390	AATAA	2	10	32601	32610	80 %	20 %	0 %	0 %	328958836
37	NC_015390	AAATA	2	10	32720	32729	80 %	20 %	0 %	0 %	328958836
38	NC_015390	TATAC	2	10	32843	32852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015390	TCCTA	2	10	34228	34237	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015390	TTTGA	2	10	35270	35279	20 %	60 %	20 %	0 %	328958839
41	NC_015390	TTTCT	2	10	36166	36175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015390	TATTT	2	10	36793	36802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015390	GGTGA	2	10	36936	36945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015390	AAATG	2	10	37198	37207	60 %	20 %	20 %	0 %	328958842
45	NC_015390	AAAAT	2	10	37860	37869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015390	ATTTT	2	10	39623	39632	20 %	80 %	0 %	0 %	328958845
47	NC_015390	AAATA	2	10	40690	40699	80 %	20 %	0 %	0 %	328958847
48	NC_015390	TTTAT	2	10	42277	42286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015390	CACAA	2	10	42617	42626	60 %	0 %	0 %	40 %	328958849
50	NC_015390	TTACC	2	10	42715	42724	20 %	40 %	0 %	40 %	328958849
51	NC_015390	TTTAT	2	10	45270	45279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015390	TAAAA	2	10	45483	45492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015390	TAATT	2	10	46126	46135	40 %	60 %	0 %	0 %	328958854
54	NC_015390	TTCAC	2	10	48299	48308	20 %	40 %	0 %	40 %	328958857
55	NC_015390	AAAAT	2	10	48330	48339	80 %	20 %	0 %	0 %	328958857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.