MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TTTAT	2	10	2588	2597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015390	TTATT	2	10	3418	3427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015390	TCTTA	2	10	3469	3478	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015390	AAATA	3	15	8961	8975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015390	TAAAA	2	10	13407	13416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015390	CCTTT	2	10	25299	25308	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015390	TAATT	2	10	26664	26673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015390	CAAAA	2	10	29420	29429	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015390	CTCTC	2	10	30037	30046	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015390	TATAC	2	10	32843	32852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015390	TCCTA	2	10	34228	34237	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015390	TTTCT	2	10	36166	36175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015390	TATTT	2	10	36793	36802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015390	GGTGA	2	10	36936	36945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015390	AAAAT	2	10	37860	37869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015390	TTTAT	2	10	42277	42286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015390	TTTAT	2	10	45270	45279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015390	TAAAA	2	10	45483	45492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.