MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TCATG	2	10	358	367	20 %	40 %	20 %	20 %	328958804
2	NC_015390	GATAA	2	10	4178	4187	60 %	20 %	20 %	0 %	328958808
3	NC_015390	AAAGA	2	10	5231	5240	80 %	0 %	20 %	0 %	328958808
4	NC_015390	GAATA	2	10	6620	6629	60 %	20 %	20 %	0 %	328958810
5	NC_015390	AGAAA	2	10	9196	9205	80 %	0 %	20 %	0 %	328958812
6	NC_015390	AAGAA	2	10	9716	9725	80 %	0 %	20 %	0 %	328958812
7	NC_015390	AAAAC	2	10	11768	11777	80 %	0 %	0 %	20 %	328958814
8	NC_015390	AATGG	2	10	12119	12128	40 %	20 %	40 %	0 %	328958815
9	NC_015390	TGATT	2	10	12742	12751	20 %	60 %	20 %	0 %	328958815
10	NC_015390	TTTAC	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	328958815
11	NC_015390	ATTTC	2	10	17819	17828	20 %	60 %	0 %	20 %	328958820
12	NC_015390	AAATT	2	10	17967	17976	60 %	40 %	0 %	0 %	328958820
13	NC_015390	ATTTT	2	10	18470	18479	20 %	80 %	0 %	0 %	328958821
14	NC_015390	CAAAC	2	10	18887	18896	60 %	0 %	0 %	40 %	328958821
15	NC_015390	GAACT	2	10	26193	26202	40 %	20 %	20 %	20 %	328958827
16	NC_015390	AAATA	2	10	26244	26253	80 %	20 %	0 %	0 %	328958827
17	NC_015390	TGAAA	2	10	26398	26407	60 %	20 %	20 %	0 %	328958827
18	NC_015390	CCTGA	2	10	27471	27480	20 %	20 %	20 %	40 %	328958829
19	NC_015390	AAATC	2	10	27701	27710	60 %	20 %	0 %	20 %	328958829
20	NC_015390	TAATT	2	10	28894	28903	40 %	60 %	0 %	0 %	328958831
21	NC_015390	TTTTC	2	10	29826	29835	0 %	80 %	0 %	20 %	328958833
22	NC_015390	TTTAA	2	10	29876	29885	40 %	60 %	0 %	0 %	328958833
23	NC_015390	GCTTA	2	10	30849	30858	20 %	40 %	20 %	20 %	328958835
24	NC_015390	AAGGT	2	10	30923	30932	40 %	20 %	40 %	0 %	328958835
25	NC_015390	TAAAA	2	10	31053	31062	80 %	20 %	0 %	0 %	328958835
26	NC_015390	AATAA	2	10	31357	31366	80 %	20 %	0 %	0 %	328958835
27	NC_015390	AATAA	2	10	32601	32610	80 %	20 %	0 %	0 %	328958836
28	NC_015390	AAATA	2	10	32720	32729	80 %	20 %	0 %	0 %	328958836
29	NC_015390	TTTGA	2	10	35270	35279	20 %	60 %	20 %	0 %	328958839
30	NC_015390	AAATG	2	10	37198	37207	60 %	20 %	20 %	0 %	328958842
31	NC_015390	ATTTT	2	10	39623	39632	20 %	80 %	0 %	0 %	328958845
32	NC_015390	AAATA	2	10	40690	40699	80 %	20 %	0 %	0 %	328958847
33	NC_015390	CACAA	2	10	42617	42626	60 %	0 %	0 %	40 %	328958849
34	NC_015390	TTACC	2	10	42715	42724	20 %	40 %	0 %	40 %	328958849
35	NC_015390	TAATT	2	10	46126	46135	40 %	60 %	0 %	0 %	328958854
36	NC_015390	TTCAC	2	10	48299	48308	20 %	40 %	0 %	40 %	328958857
37	NC_015390	AAAAT	2	10	48330	48339	80 %	20 %	0 %	0 %	328958857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.