MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TGCT	2	8	273	280	0 %	50 %	25 %	25 %	328958804
2	NC_015390	CCAC	2	8	524	531	25 %	0 %	0 %	75 %	328958804
3	NC_015390	CAAG	2	8	740	747	50 %	0 %	25 %	25 %	328958804
4	NC_015390	TAAC	2	8	1316	1323	50 %	25 %	0 %	25 %	328958805
5	NC_015390	CAAG	2	8	1755	1762	50 %	0 %	25 %	25 %	328958806
6	NC_015390	AATT	2	8	1952	1959	50 %	50 %	0 %	0 %	328958806
7	NC_015390	ATTA	2	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	328958806
8	NC_015390	AATC	2	8	2210	2217	50 %	25 %	0 %	25 %	328958806
9	NC_015390	AGAA	2	8	2709	2716	75 %	0 %	25 %	0 %	328958807
10	NC_015390	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	328958807
11	NC_015390	AAAG	2	8	3181	3188	75 %	0 %	25 %	0 %	328958807
12	NC_015390	CAAA	2	8	3195	3202	75 %	0 %	0 %	25 %	328958807
13	NC_015390	TTAA	2	8	3292	3299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015390	GTTG	2	8	3336	3343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015390	AAAT	2	8	3595	3602	75 %	25 %	0 %	0 %	328958808
16	NC_015390	GTAT	2	8	3643	3650	25 %	50 %	25 %	0 %	328958808
17	NC_015390	ACAT	2	8	3795	3802	50 %	25 %	0 %	25 %	328958808
18	NC_015390	AATT	2	8	4026	4033	50 %	50 %	0 %	0 %	328958808
19	NC_015390	AATA	2	8	4264	4271	75 %	25 %	0 %	0 %	328958808
20	NC_015390	TGAA	2	8	4362	4369	50 %	25 %	25 %	0 %	328958808
21	NC_015390	ATTC	2	8	4484	4491	25 %	50 %	0 %	25 %	328958808
22	NC_015390	ATAA	2	8	4961	4968	75 %	25 %	0 %	0 %	328958808
23	NC_015390	GAAA	2	8	5327	5334	75 %	0 %	25 %	0 %	328958808
24	NC_015390	ATTT	2	8	5338	5345	25 %	75 %	0 %	0 %	328958808
25	NC_015390	TTAC	2	8	5483	5490	25 %	50 %	0 %	25 %	328958809
26	NC_015390	ATCT	2	8	6150	6157	25 %	50 %	0 %	25 %	328958809
27	NC_015390	CAAA	2	8	6181	6188	75 %	0 %	0 %	25 %	328958809
28	NC_015390	ATTT	2	8	6288	6295	25 %	75 %	0 %	0 %	328958809
29	NC_015390	TAAT	2	8	6380	6387	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
30	NC_015390	CTAA	2	8	6823	6830	50 %	25 %	0 %	25 %	328958810
31	NC_015390	CAAT	2	8	7100	7107	50 %	25 %	0 %	25 %	328958810
32	NC_015390	AATT	2	8	7118	7125	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
33	NC_015390	ATTA	2	8	7551	7558	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
34	NC_015390	TGGT	2	8	7865	7872	0 %	50 %	50 %	0 %	328958810
35	NC_015390	AAGA	2	8	7937	7944	75 %	0 %	25 %	0 %	328958810
36	NC_015390	TAAA	2	8	8531	8538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015390	CATT	2	8	8607	8614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015390	CTTT	2	8	8636	8643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015390	TAAA	2	8	8953	8960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015390	ATTT	2	8	10120	10127	25 %	75 %	0 %	0 %	328958813
41	NC_015390	ATCT	2	8	10158	10165	25 %	50 %	0 %	25 %	328958813
42	NC_015390	AGGA	2	8	10505	10512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015390	CAAG	2	8	10577	10584	50 %	0 %	25 %	25 %	328958814
44	NC_015390	ATGG	2	8	10942	10949	25 %	25 %	50 %	0 %	328958814
45	NC_015390	TGGA	2	8	12474	12481	25 %	25 %	50 %	0 %	328958815
46	NC_015390	TGGA	2	8	12979	12986	25 %	25 %	50 %	0 %	328958815
47	NC_015390	ATTG	2	8	13318	13325	25 %	50 %	25 %	0 %	328958815
48	NC_015390	AAAC	2	8	13383	13390	75 %	0 %	0 %	25 %	328958815
49	NC_015390	AAAC	2	8	13399	13406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015390	ATAA	2	8	13498	13505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015390	TTCA	2	8	13997	14004	25 %	50 %	0 %	25 %	328958816
52	NC_015390	ATTG	2	8	14340	14347	25 %	50 %	25 %	0 %	328958816
53	NC_015390	TCTT	2	8	14700	14707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015390	TAAA	2	8	14931	14938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015390	TAAA	2	8	15117	15124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015390	TAAC	2	8	15141	15148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015390	ATTT	2	8	15230	15237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015390	TAAA	2	8	15280	15287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015390	ACCT	2	8	15548	15555	25 %	25 %	0 %	50 %	328958817
60	NC_015390	ATCA	2	8	15608	15615	50 %	25 %	0 %	25 %	328958817
61	NC_015390	CTAG	2	8	15810	15817	25 %	25 %	25 %	25 %	328958817
62	NC_015390	TCCC	2	8	16293	16300	0 %	25 %	0 %	75 %	328958818
63	NC_015390	TAAA	2	8	16457	16464	75 %	25 %	0 %	0 %	328958818
64	NC_015390	ATTA	2	8	16539	16546	50 %	50 %	0 %	0 %	328958818
65	NC_015390	ATGA	2	8	17049	17056	50 %	25 %	25 %	0 %	328958818
66	NC_015390	TATC	2	8	17573	17580	25 %	50 %	0 %	25 %	328958819
67	NC_015390	CTAC	2	8	17602	17609	25 %	25 %	0 %	50 %	328958819
68	NC_015390	GCAT	2	8	17879	17886	25 %	25 %	25 %	25 %	328958820
69	NC_015390	GCTT	2	8	18011	18018	0 %	50 %	25 %	25 %	328958820
70	NC_015390	TTGA	2	8	18323	18330	25 %	50 %	25 %	0 %	328958821
71	NC_015390	ATTT	2	8	18362	18369	25 %	75 %	0 %	0 %	328958821
72	NC_015390	ATTT	2	8	18392	18399	25 %	75 %	0 %	0 %	328958821
73	NC_015390	CTTC	2	8	18419	18426	0 %	50 %	0 %	50 %	328958821
74	NC_015390	TTGA	2	8	18428	18435	25 %	50 %	25 %	0 %	328958821
75	NC_015390	AAAC	2	8	18731	18738	75 %	0 %	0 %	25 %	328958821
76	NC_015390	ACAA	2	8	18762	18769	75 %	0 %	0 %	25 %	328958821
77	NC_015390	ATCA	2	8	19428	19435	50 %	25 %	0 %	25 %	328958821
78	NC_015390	TAAC	2	8	19679	19686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015390	TAAT	2	8	19780	19787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015390	TAGT	2	8	20024	20031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015390	TTTA	2	8	20077	20084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015390	ATTT	2	8	20981	20988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015390	AACA	2	8	21203	21210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015390	TTTG	2	8	21659	21666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015390	TACA	2	8	21934	21941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015390	GTCT	2	8	22140	22147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015390	TTTA	2	8	22393	22400	25 %	75 %	0 %	0 %	328958824
88	NC_015390	AACA	2	8	22538	22545	75 %	0 %	0 %	25 %	328958824
89	NC_015390	AATT	2	8	23509	23516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015390	GTTC	2	8	23588	23595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015390	ACAG	2	8	23999	24006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015390	TTAT	2	8	24007	24014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015390	ACAG	2	8	24031	24038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015390	TAAA	2	8	24104	24111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015390	TAAA	2	8	24188	24195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015390	CAAC	2	8	24206	24213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015390	TAGA	2	8	24296	24303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015390	AAGA	2	8	24736	24743	75 %	0 %	25 %	0 %	328958826
99	NC_015390	ATTG	2	8	24850	24857	25 %	50 %	25 %	0 %	328958826
100	NC_015390	CAGT	2	8	24872	24879	25 %	25 %	25 %	25 %	328958826
101	NC_015390	AATG	2	8	25084	25091	50 %	25 %	25 %	0 %	328958826
102	NC_015390	TTCG	2	8	25135	25142	0 %	50 %	25 %	25 %	328958826
103	NC_015390	TGCA	2	8	25227	25234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015390	GAAA	2	8	25277	25284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015390	AATT	2	8	25328	25335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015390	TTAT	2	8	25529	25536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015390	TATT	2	8	25676	25683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015390	TAAT	2	8	25853	25860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015390	GAAT	2	8	26092	26099	50 %	25 %	25 %	0 %	328958827
110	NC_015390	CTTG	2	8	26230	26237	0 %	50 %	25 %	25 %	328958827
111	NC_015390	CAAT	2	8	26266	26273	50 %	25 %	0 %	25 %	328958827
112	NC_015390	ACAA	2	8	26959	26966	75 %	0 %	0 %	25 %	328958828
113	NC_015390	ATTG	2	8	27077	27084	25 %	50 %	25 %	0 %	328958828
114	NC_015390	AAAC	2	8	27183	27190	75 %	0 %	0 %	25 %	328958828
115	NC_015390	AAAT	2	8	27216	27223	75 %	25 %	0 %	0 %	328958828
116	NC_015390	ATTA	2	8	27308	27315	50 %	50 %	0 %	0 %	328958829
117	NC_015390	AGTT	2	8	27430	27437	25 %	50 %	25 %	0 %	328958829
118	NC_015390	AATC	2	8	27519	27526	50 %	25 %	0 %	25 %	328958829
119	NC_015390	ATTA	2	8	27912	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015390	ATTT	2	8	27931	27938	25 %	75 %	0 %	0 %	328958830
121	NC_015390	AATT	2	8	28104	28111	50 %	50 %	0 %	0 %	328958830
122	NC_015390	TATC	2	8	28298	28305	25 %	50 %	0 %	25 %	328958830
123	NC_015390	TTCA	2	8	28431	28438	25 %	50 %	0 %	25 %	328958830
124	NC_015390	AATA	2	8	28471	28478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015390	ATTT	2	8	28749	28756	25 %	75 %	0 %	0 %	328958831
126	NC_015390	TTTA	2	8	28833	28840	25 %	75 %	0 %	0 %	328958831
127	NC_015390	ATCA	2	8	28938	28945	50 %	25 %	0 %	25 %	328958832
128	NC_015390	TTAC	2	8	29114	29121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015390	TTTA	2	8	29281	29288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015390	GTGC	2	8	29641	29648	0 %	25 %	50 %	25 %	328958833
131	NC_015390	AAAT	2	8	29737	29744	75 %	25 %	0 %	0 %	328958833
132	NC_015390	TAAA	2	8	30267	30274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015390	ATTA	2	8	30384	30391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015390	ATTT	2	8	30419	30426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015390	ATCT	2	8	31807	31814	25 %	50 %	0 %	25 %	328958835
136	NC_015390	AGAA	2	8	32081	32088	75 %	0 %	25 %	0 %	328958836
137	NC_015390	TAGC	2	8	32212	32219	25 %	25 %	25 %	25 %	328958836
138	NC_015390	ATCC	2	8	32481	32488	25 %	25 %	0 %	50 %	328958836
139	NC_015390	AGTT	2	8	33315	33322	25 %	50 %	25 %	0 %	328958837
140	NC_015390	TTCT	2	8	33489	33496	0 %	75 %	0 %	25 %	328958837
141	NC_015390	CATA	2	8	33770	33777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015390	ATCT	2	8	34026	34033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015390	GGGA	2	8	34443	34450	25 %	0 %	75 %	0 %	328958839
144	NC_015390	CTTT	2	8	34796	34803	0 %	75 %	0 %	25 %	328958839
145	NC_015390	ATCA	2	8	35196	35203	50 %	25 %	0 %	25 %	328958839
146	NC_015390	AAAC	2	8	35258	35265	75 %	0 %	0 %	25 %	328958839
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.