MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TGCT	2	8	273	280	0 %	50 %	25 %	25 %	328958804
2	NC_015390	CCAC	2	8	524	531	25 %	0 %	0 %	75 %	328958804
3	NC_015390	CAAG	2	8	740	747	50 %	0 %	25 %	25 %	328958804
4	NC_015390	TAAC	2	8	1316	1323	50 %	25 %	0 %	25 %	328958805
5	NC_015390	CAAG	2	8	1755	1762	50 %	0 %	25 %	25 %	328958806
6	NC_015390	AATT	2	8	1952	1959	50 %	50 %	0 %	0 %	328958806
7	NC_015390	ATTA	2	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	328958806
8	NC_015390	AATC	2	8	2210	2217	50 %	25 %	0 %	25 %	328958806
9	NC_015390	AGAA	2	8	2709	2716	75 %	0 %	25 %	0 %	328958807
10	NC_015390	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	328958807
11	NC_015390	AAAG	2	8	3181	3188	75 %	0 %	25 %	0 %	328958807
12	NC_015390	CAAA	2	8	3195	3202	75 %	0 %	0 %	25 %	328958807
13	NC_015390	AAAT	2	8	3595	3602	75 %	25 %	0 %	0 %	328958808
14	NC_015390	GTAT	2	8	3643	3650	25 %	50 %	25 %	0 %	328958808
15	NC_015390	ACAT	2	8	3795	3802	50 %	25 %	0 %	25 %	328958808
16	NC_015390	AATT	2	8	4026	4033	50 %	50 %	0 %	0 %	328958808
17	NC_015390	AATA	2	8	4264	4271	75 %	25 %	0 %	0 %	328958808
18	NC_015390	TGAA	2	8	4362	4369	50 %	25 %	25 %	0 %	328958808
19	NC_015390	ATTC	2	8	4484	4491	25 %	50 %	0 %	25 %	328958808
20	NC_015390	ATAA	2	8	4961	4968	75 %	25 %	0 %	0 %	328958808
21	NC_015390	GAAA	2	8	5327	5334	75 %	0 %	25 %	0 %	328958808
22	NC_015390	ATTT	2	8	5338	5345	25 %	75 %	0 %	0 %	328958808
23	NC_015390	TTAC	2	8	5483	5490	25 %	50 %	0 %	25 %	328958809
24	NC_015390	ATCT	2	8	6150	6157	25 %	50 %	0 %	25 %	328958809
25	NC_015390	CAAA	2	8	6181	6188	75 %	0 %	0 %	25 %	328958809
26	NC_015390	ATTT	2	8	6288	6295	25 %	75 %	0 %	0 %	328958809
27	NC_015390	TAAT	2	8	6380	6387	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
28	NC_015390	CTAA	2	8	6823	6830	50 %	25 %	0 %	25 %	328958810
29	NC_015390	CAAT	2	8	7100	7107	50 %	25 %	0 %	25 %	328958810
30	NC_015390	AATT	2	8	7118	7125	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
31	NC_015390	ATTA	2	8	7551	7558	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
32	NC_015390	TGGT	2	8	7865	7872	0 %	50 %	50 %	0 %	328958810
33	NC_015390	AAGA	2	8	7937	7944	75 %	0 %	25 %	0 %	328958810
34	NC_015390	ATTT	2	8	10120	10127	25 %	75 %	0 %	0 %	328958813
35	NC_015390	ATCT	2	8	10158	10165	25 %	50 %	0 %	25 %	328958813
36	NC_015390	CAAG	2	8	10577	10584	50 %	0 %	25 %	25 %	328958814
37	NC_015390	ATGG	2	8	10942	10949	25 %	25 %	50 %	0 %	328958814
38	NC_015390	TGGA	2	8	12474	12481	25 %	25 %	50 %	0 %	328958815
39	NC_015390	TGGA	2	8	12979	12986	25 %	25 %	50 %	0 %	328958815
40	NC_015390	ATTG	2	8	13318	13325	25 %	50 %	25 %	0 %	328958815
41	NC_015390	AAAC	2	8	13383	13390	75 %	0 %	0 %	25 %	328958815
42	NC_015390	TTCA	2	8	13997	14004	25 %	50 %	0 %	25 %	328958816
43	NC_015390	ATTG	2	8	14340	14347	25 %	50 %	25 %	0 %	328958816
44	NC_015390	ACCT	2	8	15548	15555	25 %	25 %	0 %	50 %	328958817
45	NC_015390	ATCA	2	8	15608	15615	50 %	25 %	0 %	25 %	328958817
46	NC_015390	CTAG	2	8	15810	15817	25 %	25 %	25 %	25 %	328958817
47	NC_015390	TCCC	2	8	16293	16300	0 %	25 %	0 %	75 %	328958818
48	NC_015390	TAAA	2	8	16457	16464	75 %	25 %	0 %	0 %	328958818
49	NC_015390	ATTA	2	8	16539	16546	50 %	50 %	0 %	0 %	328958818
50	NC_015390	ATGA	2	8	17049	17056	50 %	25 %	25 %	0 %	328958818
51	NC_015390	TATC	2	8	17573	17580	25 %	50 %	0 %	25 %	328958819
52	NC_015390	CTAC	2	8	17602	17609	25 %	25 %	0 %	50 %	328958819
53	NC_015390	GCAT	2	8	17879	17886	25 %	25 %	25 %	25 %	328958820
54	NC_015390	GCTT	2	8	18011	18018	0 %	50 %	25 %	25 %	328958820
55	NC_015390	TTGA	2	8	18323	18330	25 %	50 %	25 %	0 %	328958821
56	NC_015390	ATTT	2	8	18362	18369	25 %	75 %	0 %	0 %	328958821
57	NC_015390	ATTT	2	8	18392	18399	25 %	75 %	0 %	0 %	328958821
58	NC_015390	CTTC	2	8	18419	18426	0 %	50 %	0 %	50 %	328958821
59	NC_015390	TTGA	2	8	18428	18435	25 %	50 %	25 %	0 %	328958821
60	NC_015390	AAAC	2	8	18731	18738	75 %	0 %	0 %	25 %	328958821
61	NC_015390	ACAA	2	8	18762	18769	75 %	0 %	0 %	25 %	328958821
62	NC_015390	ATCA	2	8	19428	19435	50 %	25 %	0 %	25 %	328958821
63	NC_015390	TTTA	2	8	22393	22400	25 %	75 %	0 %	0 %	328958824
64	NC_015390	AACA	2	8	22538	22545	75 %	0 %	0 %	25 %	328958824
65	NC_015390	AAGA	2	8	24736	24743	75 %	0 %	25 %	0 %	328958826
66	NC_015390	ATTG	2	8	24850	24857	25 %	50 %	25 %	0 %	328958826
67	NC_015390	CAGT	2	8	24872	24879	25 %	25 %	25 %	25 %	328958826
68	NC_015390	AATG	2	8	25084	25091	50 %	25 %	25 %	0 %	328958826
69	NC_015390	TTCG	2	8	25135	25142	0 %	50 %	25 %	25 %	328958826
70	NC_015390	GAAT	2	8	26092	26099	50 %	25 %	25 %	0 %	328958827
71	NC_015390	CTTG	2	8	26230	26237	0 %	50 %	25 %	25 %	328958827
72	NC_015390	CAAT	2	8	26266	26273	50 %	25 %	0 %	25 %	328958827
73	NC_015390	ACAA	2	8	26959	26966	75 %	0 %	0 %	25 %	328958828
74	NC_015390	ATTG	2	8	27077	27084	25 %	50 %	25 %	0 %	328958828
75	NC_015390	AAAC	2	8	27183	27190	75 %	0 %	0 %	25 %	328958828
76	NC_015390	AAAT	2	8	27216	27223	75 %	25 %	0 %	0 %	328958828
77	NC_015390	ATTA	2	8	27308	27315	50 %	50 %	0 %	0 %	328958829
78	NC_015390	AGTT	2	8	27430	27437	25 %	50 %	25 %	0 %	328958829
79	NC_015390	AATC	2	8	27519	27526	50 %	25 %	0 %	25 %	328958829
80	NC_015390	ATTT	2	8	27931	27938	25 %	75 %	0 %	0 %	328958830
81	NC_015390	AATT	2	8	28104	28111	50 %	50 %	0 %	0 %	328958830
82	NC_015390	TATC	2	8	28298	28305	25 %	50 %	0 %	25 %	328958830
83	NC_015390	TTCA	2	8	28431	28438	25 %	50 %	0 %	25 %	328958830
84	NC_015390	ATTT	2	8	28749	28756	25 %	75 %	0 %	0 %	328958831
85	NC_015390	TTTA	2	8	28833	28840	25 %	75 %	0 %	0 %	328958831
86	NC_015390	ATCA	2	8	28938	28945	50 %	25 %	0 %	25 %	328958832
87	NC_015390	GTGC	2	8	29641	29648	0 %	25 %	50 %	25 %	328958833
88	NC_015390	AAAT	2	8	29737	29744	75 %	25 %	0 %	0 %	328958833
89	NC_015390	ATCT	2	8	31807	31814	25 %	50 %	0 %	25 %	328958835
90	NC_015390	AGAA	2	8	32081	32088	75 %	0 %	25 %	0 %	328958836
91	NC_015390	TAGC	2	8	32212	32219	25 %	25 %	25 %	25 %	328958836
92	NC_015390	ATCC	2	8	32481	32488	25 %	25 %	0 %	50 %	328958836
93	NC_015390	AGTT	2	8	33315	33322	25 %	50 %	25 %	0 %	328958837
94	NC_015390	TTCT	2	8	33489	33496	0 %	75 %	0 %	25 %	328958837
95	NC_015390	GGGA	2	8	34443	34450	25 %	0 %	75 %	0 %	328958839
96	NC_015390	CTTT	2	8	34796	34803	0 %	75 %	0 %	25 %	328958839
97	NC_015390	ATCA	2	8	35196	35203	50 %	25 %	0 %	25 %	328958839
98	NC_015390	AAAC	2	8	35258	35265	75 %	0 %	0 %	25 %	328958839
99	NC_015390	AATG	2	8	35280	35287	50 %	25 %	25 %	0 %	328958839
100	NC_015390	TCTT	2	8	37072	37079	0 %	75 %	0 %	25 %	328958841
101	NC_015390	TGGC	2	8	37483	37490	0 %	25 %	50 %	25 %	328958842
102	NC_015390	GAAA	2	8	38220	38227	75 %	0 %	25 %	0 %	328958843
103	NC_015390	GTTT	2	8	38391	38398	0 %	75 %	25 %	0 %	328958844
104	NC_015390	TAAA	2	8	39954	39961	75 %	25 %	0 %	0 %	328958845
105	NC_015390	GGAA	2	8	40272	40279	50 %	0 %	50 %	0 %	328958846
106	NC_015390	ATAA	2	8	40635	40642	75 %	25 %	0 %	0 %	328958847
107	NC_015390	TACA	2	8	40729	40736	50 %	25 %	0 %	25 %	328958847
108	NC_015390	TACC	2	8	40988	40995	25 %	25 %	0 %	50 %	328958848
109	NC_015390	TAAA	2	8	41805	41812	75 %	25 %	0 %	0 %	328958848
110	NC_015390	GAAA	2	8	42338	42345	75 %	0 %	25 %	0 %	328958849
111	NC_015390	AATT	2	8	42999	43006	50 %	50 %	0 %	0 %	328958850
112	NC_015390	TTCA	2	8	43089	43096	25 %	50 %	0 %	25 %	328958850
113	NC_015390	TAAA	2	8	43896	43903	75 %	25 %	0 %	0 %	328958851
114	NC_015390	TAAA	2	8	44161	44168	75 %	25 %	0 %	0 %	328958852
115	NC_015390	TAAG	2	8	44187	44194	50 %	25 %	25 %	0 %	328958852
116	NC_015390	AAGT	2	8	44289	44296	50 %	25 %	25 %	0 %	328958852
117	NC_015390	ATAA	2	8	44860	44867	75 %	25 %	0 %	0 %	328958852
118	NC_015390	CTTC	2	8	44961	44968	0 %	50 %	0 %	50 %	328958853
119	NC_015390	CTTT	2	8	44985	44992	0 %	75 %	0 %	25 %	328958853
120	NC_015390	ATCA	2	8	45529	45536	50 %	25 %	0 %	25 %	328958854
121	NC_015390	ACCA	2	8	45651	45658	50 %	0 %	0 %	50 %	328958854
122	NC_015390	TCTT	2	8	46093	46100	0 %	75 %	0 %	25 %	328958854
123	NC_015390	TTTC	2	8	46181	46188	0 %	75 %	0 %	25 %	328958854
124	NC_015390	AGTA	2	8	47523	47530	50 %	25 %	25 %	0 %	328958855
125	NC_015390	GATT	2	8	47962	47969	25 %	50 %	25 %	0 %	328958856
126	NC_015390	ACTG	2	8	48398	48405	25 %	25 %	25 %	25 %	328958857
127	NC_015390	GAAA	2	8	48407	48414	75 %	0 %	25 %	0 %	328958857
128	NC_015390	CCAA	2	8	48637	48644	50 %	0 %	0 %	50 %	328958857
129	NC_015390	AAGA	2	8	48818	48825	75 %	0 %	25 %	0 %	328958857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.