MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TA	3	6	512	517	50 %	50 %	0 %	0 %	328958804
2	NC_015390	AT	3	6	625	630	50 %	50 %	0 %	0 %	328958804
3	NC_015390	CG	3	6	1308	1313	0 %	0 %	50 %	50 %	328958805
4	NC_015390	AG	3	6	1330	1335	50 %	0 %	50 %	0 %	328958805
5	NC_015390	CA	3	6	1497	1502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015390	GT	3	6	2373	2378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015390	TA	3	6	2608	2613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015390	TC	3	6	3152	3157	0 %	50 %	0 %	50 %	328958807
9	NC_015390	TA	3	6	3167	3172	50 %	50 %	0 %	0 %	328958807
10	NC_015390	GT	3	6	3395	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015390	TA	3	6	4515	4520	50 %	50 %	0 %	0 %	328958808
12	NC_015390	AT	3	6	4610	4615	50 %	50 %	0 %	0 %	328958808
13	NC_015390	TA	3	6	6318	6323	50 %	50 %	0 %	0 %	328958809
14	NC_015390	AT	3	6	7691	7696	50 %	50 %	0 %	0 %	328958810
15	NC_015390	AC	3	6	8758	8763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015390	AG	3	6	9017	9022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015390	TA	3	6	9680	9685	50 %	50 %	0 %	0 %	328958812
18	NC_015390	AT	3	6	10307	10312	50 %	50 %	0 %	0 %	328958813
19	NC_015390	AG	3	6	11550	11555	50 %	0 %	50 %	0 %	328958814
20	NC_015390	GA	3	6	12480	12485	50 %	0 %	50 %	0 %	328958815
21	NC_015390	TG	3	6	13487	13492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015390	GA	3	6	13673	13678	50 %	0 %	50 %	0 %	328958816
23	NC_015390	TC	3	6	14246	14251	0 %	50 %	0 %	50 %	328958816
24	NC_015390	TA	3	6	15342	15347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015390	AT	3	6	16089	16094	50 %	50 %	0 %	0 %	328958817
26	NC_015390	TC	3	6	16709	16714	0 %	50 %	0 %	50 %	328958818
27	NC_015390	GC	3	6	17034	17039	0 %	0 %	50 %	50 %	328958818
28	NC_015390	AT	3	6	17416	17421	50 %	50 %	0 %	0 %	328958819
29	NC_015390	AT	3	6	18345	18350	50 %	50 %	0 %	0 %	328958821
30	NC_015390	AT	3	6	18449	18454	50 %	50 %	0 %	0 %	328958821
31	NC_015390	GA	3	6	18460	18465	50 %	0 %	50 %	0 %	328958821
32	NC_015390	TC	3	6	18562	18567	0 %	50 %	0 %	50 %	328958821
33	NC_015390	TA	3	6	19761	19766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015390	TA	3	6	20289	20294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015390	AT	4	8	20314	20321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015390	AT	3	6	20397	20402	50 %	50 %	0 %	0 %	328958822
37	NC_015390	AT	3	6	20999	21004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015390	TA	4	8	21582	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015390	TG	3	6	21665	21670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015390	GT	3	6	21678	21683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015390	AG	3	6	22151	22156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015390	AC	3	6	22177	22182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015390	TA	3	6	24246	24251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015390	AC	3	6	24893	24898	50 %	0 %	0 %	50 %	328958826
45	NC_015390	AT	3	6	25509	25514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015390	TA	3	6	25539	25544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015390	AT	3	6	26131	26136	50 %	50 %	0 %	0 %	328958827
48	NC_015390	TA	3	6	26689	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015390	AC	3	6	26734	26739	50 %	0 %	0 %	50 %	328958828
50	NC_015390	AG	3	6	26833	26838	50 %	0 %	50 %	0 %	328958828
51	NC_015390	AT	3	6	27386	27391	50 %	50 %	0 %	0 %	328958829
52	NC_015390	AT	3	6	27580	27585	50 %	50 %	0 %	0 %	328958829
53	NC_015390	AT	4	8	27832	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015390	AT	3	6	28162	28167	50 %	50 %	0 %	0 %	328958830
55	NC_015390	AT	3	6	28578	28583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015390	TA	3	6	30181	30186	50 %	50 %	0 %	0 %	328958834
57	NC_015390	TA	4	8	30362	30369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015390	TA	3	6	31831	31836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015390	AT	3	6	32581	32586	50 %	50 %	0 %	0 %	328958836
60	NC_015390	CT	3	6	32807	32812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015390	AG	3	6	33002	33007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015390	AC	3	6	33657	33662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015390	AT	3	6	33681	33686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015390	AT	3	6	33746	33751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015390	TA	3	6	34195	34200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015390	AG	3	6	34452	34457	50 %	0 %	50 %	0 %	328958839
67	NC_015390	AG	3	6	35499	35504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015390	TA	3	6	35841	35846	50 %	50 %	0 %	0 %	328958840
69	NC_015390	TA	3	6	36547	36552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015390	TA	3	6	36767	36772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015390	AT	4	8	37505	37512	50 %	50 %	0 %	0 %	328958842
72	NC_015390	AT	4	8	37965	37972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015390	GT	3	6	38724	38729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015390	TC	3	6	38836	38841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015390	AG	3	6	39132	39137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015390	AT	3	6	39435	39440	50 %	50 %	0 %	0 %	328958845
77	NC_015390	AT	3	6	39870	39875	50 %	50 %	0 %	0 %	328958845
78	NC_015390	AT	3	6	39989	39994	50 %	50 %	0 %	0 %	328958845
79	NC_015390	AT	3	6	40012	40017	50 %	50 %	0 %	0 %	328958845
80	NC_015390	AT	3	6	40395	40400	50 %	50 %	0 %	0 %	328958846
81	NC_015390	AT	4	8	41733	41740	50 %	50 %	0 %	0 %	328958848
82	NC_015390	AT	3	6	42117	42122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015390	AT	3	6	42194	42199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015390	TA	3	6	42420	42425	50 %	50 %	0 %	0 %	328958849
85	NC_015390	AT	3	6	42784	42789	50 %	50 %	0 %	0 %	328958849
86	NC_015390	TA	3	6	43430	43435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015390	AT	4	8	46317	46324	50 %	50 %	0 %	0 %	328958854
88	NC_015390	AT	3	6	49019	49024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015390	AT	3	6	49105	49110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015390	AT	3	6	49146	49151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015390	GA	3	6	49221	49226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015390	CA	3	6	49584	49589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.