MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfobacca acetoxidans DSM 11109 chromosome

Total Repeats: 2123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015388	TCAGG	2	10	70	79	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015388	GTTAT	2	10	767	776	20 %	60 %	20 %	0 %	328951747
3	NC_015388	CCCAA	2	10	1444	1453	40 %	0 %	0 %	60 %	328951747
4	NC_015388	GATTC	2	10	2714	2723	20 %	40 %	20 %	20 %	328951748
5	NC_015388	ATGCT	2	10	5066	5075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015388	TCCAT	2	10	8348	8357	20 %	40 %	0 %	40 %	328951754
7	NC_015388	GCCAA	2	10	10341	10350	40 %	0 %	20 %	40 %	328951756
8	NC_015388	TTATG	2	10	10896	10905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015388	GCGGT	2	10	14919	14928	0 %	20 %	60 %	20 %	328951760
10	NC_015388	ATCAG	2	10	15294	15303	40 %	20 %	20 %	20 %	328951760
11	NC_015388	AAAGA	2	10	17002	17011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015388	CCAGA	2	10	22974	22983	40 %	0 %	20 %	40 %	328951766
13	NC_015388	GCTCT	2	10	23774	23783	0 %	40 %	20 %	40 %	328951767
14	NC_015388	GCCGA	2	10	24014	24023	20 %	0 %	40 %	40 %	328951767
15	NC_015388	GGCCC	2	10	24777	24786	0 %	0 %	40 %	60 %	328951767
16	NC_015388	TTAAC	2	10	27716	27725	40 %	40 %	0 %	20 %	328951770
17	NC_015388	AAAGG	2	10	30307	30316	60 %	0 %	40 %	0 %	328951771
18	NC_015388	AATCC	2	10	30410	30419	40 %	20 %	0 %	40 %	328951771
19	NC_015388	CCATT	2	10	33029	33038	20 %	40 %	0 %	40 %	328951774
20	NC_015388	TATAA	2	10	34612	34621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015388	ACTGT	2	10	36152	36161	20 %	40 %	20 %	20 %	328951777
22	NC_015388	ATTGG	2	10	36190	36199	20 %	40 %	40 %	0 %	328951777
23	NC_015388	GGCCC	2	10	37446	37455	0 %	0 %	40 %	60 %	328951778
24	NC_015388	TCTTT	2	10	38578	38587	0 %	80 %	0 %	20 %	328951779
25	NC_015388	CAGAC	2	10	38688	38697	40 %	0 %	20 %	40 %	328951779
26	NC_015388	GGCCT	2	10	39123	39132	0 %	20 %	40 %	40 %	328951779
27	NC_015388	AGATG	2	10	40676	40685	40 %	20 %	40 %	0 %	328951781
28	NC_015388	AGCCG	2	10	41079	41088	20 %	0 %	40 %	40 %	328951781
29	NC_015388	CATAA	2	10	41804	41813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015388	ATACA	2	10	42106	42115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015388	TTAAC	2	10	44697	44706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015388	CCAGG	2	10	45044	45053	20 %	0 %	40 %	40 %	328951785
33	NC_015388	GGGAT	2	10	46241	46250	20 %	20 %	60 %	0 %	328951787
34	NC_015388	CAGGC	2	10	46708	46717	20 %	0 %	40 %	40 %	328951787
35	NC_015388	CCCTG	2	10	51123	51132	0 %	20 %	20 %	60 %	328951790
36	NC_015388	CAATA	2	10	51145	51154	60 %	20 %	0 %	20 %	328951790
37	NC_015388	CGTGC	2	10	55358	55367	0 %	20 %	40 %	40 %	328951794
38	NC_015388	CAAGC	2	10	56054	56063	40 %	0 %	20 %	40 %	328951794
39	NC_015388	CGAAA	2	10	56246	56255	60 %	0 %	20 %	20 %	328951794
40	NC_015388	ACTTA	2	10	56524	56533	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015388	AGGCG	2	10	58373	58382	20 %	0 %	60 %	20 %	328951799
42	NC_015388	ACCGC	2	10	60946	60955	20 %	0 %	20 %	60 %	328951805
43	NC_015388	TCCGC	2	10	61042	61051	0 %	20 %	20 %	60 %	328951805
44	NC_015388	AAATC	2	10	61195	61204	60 %	20 %	0 %	20 %	328951805
45	NC_015388	ATATT	2	10	62804	62813	40 %	60 %	0 %	0 %	328951807
46	NC_015388	ATGGT	2	10	63796	63805	20 %	40 %	40 %	0 %	328951810
47	NC_015388	GGGTG	2	10	65103	65112	0 %	20 %	80 %	0 %	328951810
48	NC_015388	GCCGC	2	10	69989	69998	0 %	0 %	40 %	60 %	328951815
49	NC_015388	GCAGA	2	10	70243	70252	40 %	0 %	40 %	20 %	328951815
50	NC_015388	TTTGG	2	10	73005	73014	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015388	GGGCC	2	10	73463	73472	0 %	0 %	60 %	40 %	328951820
52	NC_015388	CGCGG	2	10	73644	73653	0 %	0 %	60 %	40 %	328951820
53	NC_015388	CCGGC	2	10	73727	73736	0 %	0 %	40 %	60 %	328951820
54	NC_015388	TGAAA	2	10	74316	74325	60 %	20 %	20 %	0 %	328951821
55	NC_015388	CGGCC	2	10	75961	75970	0 %	0 %	40 %	60 %	328951821
56	NC_015388	TGCGC	2	10	77919	77928	0 %	20 %	40 %	40 %	328951822
57	NC_015388	ATTTC	2	10	80795	80804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015388	ATCCC	2	10	81551	81560	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_015388	ATATT	2	10	83550	83559	40 %	60 %	0 %	0 %	328951826
60	NC_015388	AGTCC	2	10	88294	88303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015388	CATGG	2	10	89180	89189	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015388	CTTGC	2	10	89261	89270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015388	CATGG	2	10	90860	90869	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015388	AGTTA	2	10	94319	94328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015388	GATCA	2	10	94355	94364	40 %	20 %	20 %	20 %	328951831
66	NC_015388	ATGTT	2	10	96017	96026	20 %	60 %	20 %	0 %	328951833
67	NC_015388	GGGGA	2	10	96370	96379	20 %	0 %	80 %	0 %	328951833
68	NC_015388	GGTAA	2	10	98275	98284	40 %	20 %	40 %	0 %	328951835
69	NC_015388	CCGTA	2	10	99118	99127	20 %	20 %	20 %	40 %	328951836
70	NC_015388	CGATA	2	10	99749	99758	40 %	20 %	20 %	20 %	328951837
71	NC_015388	TCTGA	2	10	101056	101065	20 %	40 %	20 %	20 %	328951837
72	NC_015388	TCAGA	2	10	102349	102358	40 %	20 %	20 %	20 %	328951839
73	NC_015388	AGCCG	2	10	104883	104892	20 %	0 %	40 %	40 %	328951841
74	NC_015388	AATCC	2	10	106374	106383	40 %	20 %	0 %	40 %	328951841
75	NC_015388	GATAA	2	10	106795	106804	60 %	20 %	20 %	0 %	328951841
76	NC_015388	CCTTC	2	10	107037	107046	0 %	40 %	0 %	60 %	328951841
77	NC_015388	CAGGA	2	10	107659	107668	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015388	ACTCC	2	10	108780	108789	20 %	20 %	0 %	60 %	328951842
79	NC_015388	CCTCG	2	10	112558	112567	0 %	20 %	20 %	60 %	328951845
80	NC_015388	CAGAC	2	10	112662	112671	40 %	0 %	20 %	40 %	328951845
81	NC_015388	GTTGC	2	10	113186	113195	0 %	40 %	40 %	20 %	328951845
82	NC_015388	GGCCG	2	10	113759	113768	0 %	0 %	60 %	40 %	328951846
83	NC_015388	GTTCG	2	10	113867	113876	0 %	40 %	40 %	20 %	328951846
84	NC_015388	GATTT	2	10	115076	115085	20 %	60 %	20 %	0 %	328951846
85	NC_015388	CCAGG	2	10	115164	115173	20 %	0 %	40 %	40 %	328951846
86	NC_015388	AAATG	2	10	116309	116318	60 %	20 %	20 %	0 %	328951846
87	NC_015388	CTTCC	2	10	117302	117311	0 %	40 %	0 %	60 %	328951846
88	NC_015388	CGGGA	2	10	118814	118823	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015388	ATGGC	2	10	120887	120896	20 %	20 %	40 %	20 %	328951848
90	NC_015388	CTTAA	2	10	123610	123619	40 %	40 %	0 %	20 %	328951848
91	NC_015388	GATCA	2	10	123769	123778	40 %	20 %	20 %	20 %	328951848
92	NC_015388	ACCAG	2	10	123953	123962	40 %	0 %	20 %	40 %	328951848
93	NC_015388	GTCTT	2	10	127313	127322	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015388	GAACG	2	10	130323	130332	40 %	0 %	40 %	20 %	328951852
95	NC_015388	CGGAA	2	10	130575	130584	40 %	0 %	40 %	20 %	328951852
96	NC_015388	TATCA	2	10	133203	133212	40 %	40 %	0 %	20 %	328951855
97	NC_015388	CTACG	2	10	134217	134226	20 %	20 %	20 %	40 %	328951855
98	NC_015388	CCGAT	2	10	136640	136649	20 %	20 %	20 %	40 %	328951856
99	NC_015388	TTCAT	2	10	136809	136818	20 %	60 %	0 %	20 %	328951857
100	NC_015388	GCATC	2	10	137986	137995	20 %	20 %	20 %	40 %	328951858
101	NC_015388	TGCCG	2	10	138509	138518	0 %	20 %	40 %	40 %	328951858
102	NC_015388	GCGGT	2	10	141705	141714	0 %	20 %	60 %	20 %	328951860
103	NC_015388	CTGGC	2	10	143109	143118	0 %	20 %	40 %	40 %	328951862
104	NC_015388	CAGGA	2	10	148009	148018	40 %	0 %	40 %	20 %	328951866
105	NC_015388	CAGCT	2	10	148614	148623	20 %	20 %	20 %	40 %	328951867
106	NC_015388	CCAGG	2	10	149171	149180	20 %	0 %	40 %	40 %	328951867
107	NC_015388	CGGGG	2	10	150703	150712	0 %	0 %	80 %	20 %	328951868
108	NC_015388	GCCGA	2	10	152089	152098	20 %	0 %	40 %	40 %	328951869
109	NC_015388	GACCG	2	10	153102	153111	20 %	0 %	40 %	40 %	328951870
110	NC_015388	TCGTA	2	10	156637	156646	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015388	GGGCA	2	10	157145	157154	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015388	GCTAT	2	10	157175	157184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015388	GGTCT	2	10	159620	159629	0 %	40 %	40 %	20 %	328951875
114	NC_015388	CAGAA	2	10	161499	161508	60 %	0 %	20 %	20 %	328951877
115	NC_015388	CAAGC	2	10	163536	163545	40 %	0 %	20 %	40 %	328951880
116	NC_015388	TTGAC	2	10	164547	164556	20 %	40 %	20 %	20 %	328951882
117	NC_015388	CCTGG	2	10	165346	165355	0 %	20 %	40 %	40 %	328951882
118	NC_015388	GGTGG	2	10	166182	166191	0 %	20 %	80 %	0 %	328951883
119	NC_015388	ATTAA	2	10	166734	166743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015388	GGGAT	2	10	169406	169415	20 %	20 %	60 %	0 %	328951885
121	NC_015388	CGATC	2	10	172218	172227	20 %	20 %	20 %	40 %	328951886
122	NC_015388	GAGCC	2	10	173185	173194	20 %	0 %	40 %	40 %	328951887
123	NC_015388	AAGCG	2	10	178748	178757	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015388	TTCAA	2	10	179007	179016	40 %	40 %	0 %	20 %	328951896
125	NC_015388	CCTTT	2	10	179958	179967	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015388	GGCCT	2	10	181947	181956	0 %	20 %	40 %	40 %	328951899
127	NC_015388	GCTCT	2	10	182460	182469	0 %	40 %	20 %	40 %	328951899
128	NC_015388	ACCGG	2	10	184041	184050	20 %	0 %	40 %	40 %	328951899
129	NC_015388	AAGAT	2	10	187032	187041	60 %	20 %	20 %	0 %	328951902
130	NC_015388	TATAT	2	10	187183	187192	40 %	60 %	0 %	0 %	328951902
131	NC_015388	GGTTG	2	10	188080	188089	0 %	40 %	60 %	0 %	328951904
132	NC_015388	GGTTT	2	10	190517	190526	0 %	60 %	40 %	0 %	328951905
133	NC_015388	ATGCT	2	10	195214	195223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015388	TCTTA	2	10	195709	195718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015388	CCCTT	2	10	195761	195770	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_015388	AATAT	2	10	196865	196874	60 %	40 %	0 %	0 %	328951910
137	NC_015388	CGATT	2	10	196958	196967	20 %	40 %	20 %	20 %	328951910
138	NC_015388	CGCGG	2	10	197623	197632	0 %	0 %	60 %	40 %	328951910
139	NC_015388	CTACC	2	10	200368	200377	20 %	20 %	0 %	60 %	328951913
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159	NC_015388	CCTGG	2	10	236515	236524	0 %	20 %	40 %	40 %	328951938
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241	NC_015388	AAGGA	2	10	377332	377341	60 %	0 %	40 %	0 %	328952047
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247	NC_015388	TGACC	2	10	388612	388621	20 %	20 %	20 %	40 %	328952056
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254	NC_015388	TCCTG	2	10	394767	394776	0 %	40 %	20 %	40 %	328952060
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260	NC_015388	ACCGG	2	10	400066	400075	20 %	0 %	40 %	40 %	328952065
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262	NC_015388	CATGC	2	10	409833	409842	20 %	20 %	20 %	40 %	328952071
263	NC_015388	TGCAG	2	10	410366	410375	20 %	20 %	40 %	20 %	328952072
264	NC_015388	CATGG	2	10	413140	413149	20 %	20 %	40 %	20 %	328952074
265	NC_015388	CGGAT	2	10	413870	413879	20 %	20 %	40 %	20 %	328952075
266	NC_015388	TTGGG	2	10	420669	420678	0 %	40 %	60 %	0 %	328952081
267	NC_015388	CTGTT	2	10	421959	421968	0 %	60 %	20 %	20 %	328952084
268	NC_015388	CGGAT	2	10	423028	423037	20 %	20 %	40 %	20 %	328952084
269	NC_015388	GAGCA	2	10	423498	423507	40 %	0 %	40 %	20 %	328952084
270	NC_015388	TCCAA	2	10	424921	424930	40 %	20 %	0 %	40 %	328952084
271	NC_015388	TCGTT	2	10	426218	426227	0 %	60 %	20 %	20 %	328952085
272	NC_015388	ACCAA	2	10	428149	428158	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
273	NC_015388	ATACA	2	10	428307	428316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_015388	AAGGC	2	10	428898	428907	40 %	0 %	40 %	20 %	328952088
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276	NC_015388	CGGTT	2	10	433884	433893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
277	NC_015388	TCTAC	2	10	434447	434456	20 %	40 %	0 %	40 %	328952094
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279	NC_015388	GCCGG	2	10	437288	437297	0 %	0 %	60 %	40 %	328952096
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282	NC_015388	CTAAC	2	10	438340	438349	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015388	TTGAT	2	10	441449	441458	20 %	60 %	20 %	0 %	328952099
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289	NC_015388	AGGCG	2	10	448344	448353	20 %	0 %	60 %	20 %	328952106
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291	NC_015388	GGGAT	2	10	454075	454084	20 %	20 %	60 %	0 %	328952111
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295	NC_015388	TCGGT	2	10	462831	462840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_015388	TTGCA	2	10	475248	475257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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381	NC_015388	TGGAA	2	10	603794	603803	40 %	20 %	40 %	0 %	328952234
382	NC_015388	ATTGA	2	10	605078	605087	40 %	40 %	20 %	0 %	328952234
383	NC_015388	CCCGG	2	10	607341	607350	0 %	0 %	40 %	60 %	328952235
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391	NC_015388	TTTGG	2	10	615477	615486	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
392	NC_015388	ACTTC	2	10	616626	616635	20 %	40 %	0 %	40 %	328952243
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401	NC_015388	TCCAA	2	10	622296	622305	40 %	20 %	0 %	40 %	328952247
402	NC_015388	GACCA	2	10	624712	624721	40 %	0 %	20 %	40 %	328952249
403	NC_015388	ATTAT	2	10	625649	625658	40 %	60 %	0 %	0 %	328952249
404	NC_015388	GAACT	2	10	626254	626263	40 %	20 %	20 %	20 %	328952249
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497	NC_015388	CCGAC	2	10	746865	746874	20 %	0 %	20 %	60 %	328952369
498	NC_015388	CGGAA	2	10	747928	747937	40 %	0 %	40 %	20 %	328952369
499	NC_015388	GGCCT	2	10	748643	748652	0 %	20 %	40 %	40 %	328952369
500	NC_015388	CCTAT	2	10	749050	749059	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

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