MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 1595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015387	GTTCCA	2	12	2166854	2166865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328951647
1502	NC_015387	TCGCCA	2	12	2168130	2168141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328951649
1503	NC_015387	GGATGG	2	12	2169645	2169656	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	328951651
1504	NC_015387	GTACCT	2	12	2173382	2173393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328951655
1505	NC_015387	GGCGCG	2	12	2174316	2174327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951655
1506	NC_015387	GAGGGG	2	12	2177355	2177366	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	328951658
1507	NC_015387	CGCTGT	2	12	2178826	2178837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951660
1508	NC_015387	ATCTTC	2	12	2180458	2180469	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	328951662
1509	NC_015387	CTTCCG	2	12	2180523	2180534	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328951662
1510	NC_015387	GGCCCT	2	12	2180610	2180621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328951662
1511	NC_015387	CGCGGA	2	12	2180709	2180720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328951662
1512	NC_015387	CCCCGC	2	12	2181518	2181529	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	328951662
1513	NC_015387	CGGGCA	2	12	2182139	2182150	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328951663
1514	NC_015387	CGGGGG	2	12	2184198	2184209	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1515	NC_015387	CCCTGG	2	12	2184437	2184448	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328951665
1516	NC_015387	CAGCCC	2	12	2184512	2184523	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	328951665
1517	NC_015387	GTACCG	2	12	2185769	2185780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951666
1518	NC_015387	GACCTT	2	12	2186881	2186892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328951667
1519	NC_015387	ACGCGC	2	12	2186975	2186986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328951667
1520	NC_015387	CGCGGG	2	12	2188255	2188266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328951669
1521	NC_015387	CCGGTG	2	12	2188797	2188808	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	328951670
1522	NC_015387	CGGGTT	2	12	2189614	2189625	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	328951671
1523	NC_015387	CCTTCG	2	12	2191063	2191074	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328951672
1524	NC_015387	CCGCGC	2	12	2191344	2191355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951672
1525	NC_015387	TGCCCG	2	12	2191869	2191880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328951673
1526	NC_015387	TGCACG	2	12	2192067	2192078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951673
1527	NC_015387	GGTGCT	2	12	2194778	2194789	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	328951677
1528	NC_015387	TGGGGC	2	12	2195029	2195040	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	328951677
1529	NC_015387	GTGGGC	2	12	2196330	2196341	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1530	NC_015387	GAAAGC	2	12	2196479	2196490	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1531	NC_015387	CGAGGC	2	12	2196525	2196536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015387	GTCTTC	2	12	2197117	2197128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	328951679
1533	NC_015387	CACGGC	2	12	2198001	2198012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_015387	ATTAAA	2	12	2199094	2199105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328951680
1535	NC_015387	ACGCGG	2	12	2200206	2200217	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328951682
1536	NC_015387	GGGAGG	2	12	2201553	2201564	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	328951683
1537	NC_015387	TGGCCG	2	12	2201955	2201966	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	328951683
1538	NC_015387	GGCGAA	2	12	2202653	2202664	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	328951684
1539	NC_015387	CCTCAC	2	12	2204217	2204228	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	328951685
1540	NC_015387	GGGTGG	2	12	2204907	2204918	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	328951685
1541	NC_015387	GGGTGG	2	12	2205191	2205202	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	328951685
1542	NC_015387	CACGGT	2	12	2205321	2205332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951685
1543	NC_015387	ATCGGG	2	12	2206635	2206646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	328951686
1544	NC_015387	TCCTGG	2	12	2206672	2206683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951686
1545	NC_015387	ATCGCC	2	12	2207685	2207696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328951686
1546	NC_015387	AGGCGT	2	12	2210222	2210233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	328951690
1547	NC_015387	GAGGGG	2	12	2210553	2210564	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	328951690
1548	NC_015387	GGCCGC	2	12	2211886	2211897	0 %	0 %	50 %	50 %	328951691
1549	NC_015387	CGTACT	2	12	2214900	2214911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	328951695
1550	NC_015387	CCCCAA	2	12	2215039	2215050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951695
1551	NC_015387	CGCAGG	2	12	2215777	2215788	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328951697
1552	NC_015387	CACGGC	2	12	2219037	2219048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_015387	GTACCC	2	12	2220658	2220669	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328951700
1554	NC_015387	TGGCCC	2	12	2220759	2220770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328951700
1555	NC_015387	CGCACC	2	12	2221422	2221433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	328951702
1556	NC_015387	GTACCC	2	12	2222498	2222509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328951702
1557	NC_015387	CTCCGC	2	12	2223160	2223171	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328951703
1558	NC_015387	TGGCGG	2	12	2227141	2227152	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	328951707
1559	NC_015387	GGAAGG	2	12	2228333	2228344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328951708
1560	NC_015387	GCCCTC	2	12	2228555	2228566	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328951709
1561	NC_015387	AGCTCG	2	12	2230320	2230331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951711
1562	NC_015387	CCACCC	2	12	2231207	2231218	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	328951712
1563	NC_015387	GCCCGC	2	12	2232567	2232578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951713
1564	NC_015387	GTAGGC	2	12	2232629	2232640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	328951713
1565	NC_015387	CCCGTC	2	12	2232767	2232778	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328951713
1566	NC_015387	AGCGGA	2	12	2233435	2233446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	328951713
1567	NC_015387	CGCGCC	2	12	2234646	2234657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328951714
1568	NC_015387	GCACCT	2	12	2237557	2237568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328951716
1569	NC_015387	TCGTGC	2	12	2238303	2238314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951717
1570	NC_015387	CCCAAC	2	12	2240368	2240379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328951720
1571	NC_015387	CCAACA	2	12	2240753	2240764	50 %	0 %	0 %	50 %	328951720
1572	NC_015387	TCCCGC	2	12	2240885	2240896	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328951720
1573	NC_015387	TACGCC	2	12	2241092	2241103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328951721
1574	NC_015387	TCGCGC	2	12	2243606	2243617	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328951722
1575	NC_015387	CTCCAC	2	12	2244237	2244248	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	328951723
1576	NC_015387	GCCCAG	2	12	2247608	2247619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328951725
1577	NC_015387	CCGCCC	2	12	2251294	2251305	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	328951728
1578	NC_015387	TTGGCC	2	12	2252124	2252135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328951729
1579	NC_015387	GGCCAG	2	12	2252595	2252606	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328951729
1580	NC_015387	ACAGGT	2	12	2252611	2252622	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328951729
1581	NC_015387	GCTCGA	2	12	2254247	2254258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951731
1582	NC_015387	ATGGCC	2	12	2254933	2254944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951731
1583	NC_015387	AGGGGT	2	12	2255060	2255071	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	328951731
1584	NC_015387	ACCGCG	2	12	2256392	2256403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328951733
1585	NC_015387	GATCGC	2	12	2257134	2257145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951734
1586	NC_015387	CGCGAG	2	12	2257359	2257370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328951734
1587	NC_015387	ACTTCA	2	12	2257533	2257544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328951735
1588	NC_015387	GAAGAT	2	12	2257789	2257800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	328951735
1589	NC_015387	AAGGTC	2	12	2258335	2258346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	328951735
1590	NC_015387	CAGGGT	2	12	2258776	2258787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	328951735
1591	NC_015387	CCGTCT	2	12	2260482	2260493	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328951737
1592	NC_015387	TCGCCT	2	12	2263933	2263944	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328951741
1593	NC_015387	GAGCTG	2	12	2264637	2264648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	328951741
1594	NC_015387	GCACCC	2	12	2265107	2265118	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	328951741
1595	NC_015387	GCGTAC	2	12	2268108	2268119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328951745

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.