MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 34656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015387	CAA	2	6	116	121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949541
2	NC_015387	AGG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
3	NC_015387	CCT	2	6	208	213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949541
4	NC_015387	AAG	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949541
5	NC_015387	AGG	2	6	256	261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
6	NC_015387	CAA	3	9	425	433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949541
7	NC_015387	CGC	3	9	443	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949541
8	NC_015387	CGG	2	6	503	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949541
9	NC_015387	CCT	2	6	680	685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949541
10	NC_015387	AGG	2	6	730	735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
11	NC_015387	TTC	2	6	738	743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949541
12	NC_015387	ATC	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949541
13	NC_015387	TCA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949541
14	NC_015387	GGA	2	6	944	949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
15	NC_015387	CCT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949541
16	NC_015387	GGC	2	6	1064	1069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949541
17	NC_015387	GGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
18	NC_015387	GTG	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949541
19	NC_015387	GAG	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
20	NC_015387	AGG	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
21	NC_015387	TTC	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949541
22	NC_015387	ACG	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949541
23	NC_015387	AGC	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949541
24	NC_015387	CAT	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949542
25	NC_015387	GCA	3	9	1731	1739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949542
26	NC_015387	TCC	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949542
27	NC_015387	GGC	2	6	2041	2046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949542
28	NC_015387	GAG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949542
29	NC_015387	AAG	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949542
30	NC_015387	GTG	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949542
31	NC_015387	ATC	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949542
32	NC_015387	GCA	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949542
33	NC_015387	AAC	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949542
34	NC_015387	CTT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949542
35	NC_015387	GTG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949542
36	NC_015387	GAC	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949543
37	NC_015387	CGG	2	6	2950	2955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
38	NC_015387	GTG	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949543
39	NC_015387	AGG	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
40	NC_015387	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949543
41	NC_015387	CGG	2	6	3241	3246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
42	NC_015387	CGG	2	6	3294	3299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
43	NC_015387	CCA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949543
44	NC_015387	ACA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949543
45	NC_015387	GAG	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
46	NC_015387	CTC	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949543
47	NC_015387	AGG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
48	NC_015387	ACC	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949543
49	NC_015387	GAG	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
50	NC_015387	GCG	2	6	3605	3610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
51	NC_015387	GGA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
52	NC_015387	GAC	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949543
53	NC_015387	CTC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949543
54	NC_015387	GAG	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
55	NC_015387	GCC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949543
56	NC_015387	TCG	2	6	4072	4077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
57	NC_015387	CCA	2	6	4078	4083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
58	NC_015387	GTG	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949544
59	NC_015387	ACC	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
60	NC_015387	TGC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
61	NC_015387	ACC	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
62	NC_015387	GAG	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
63	NC_015387	GGA	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
64	NC_015387	CTC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949544
65	NC_015387	GAC	2	6	4425	4430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949544
66	NC_015387	GTC	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
67	NC_015387	CAA	3	9	4508	4516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949544
68	NC_015387	CGA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949544
69	NC_015387	CTC	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949544
70	NC_015387	GGA	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
71	NC_015387	TGG	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949544
72	NC_015387	GCC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949544
73	NC_015387	GAG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
74	NC_015387	CGG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949544
75	NC_015387	CGG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949544
76	NC_015387	CGC	2	6	5012	5017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949544
77	NC_015387	GAT	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949544
78	NC_015387	TCG	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
79	NC_015387	GTC	2	6	5195	5200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
80	NC_015387	GGT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949544
81	NC_015387	CGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949544
82	NC_015387	CAC	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
83	NC_015387	GCT	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949545
84	NC_015387	CTC	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949545
85	NC_015387	GTG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949545
86	NC_015387	GCA	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949545
87	NC_015387	GTG	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949545
88	NC_015387	CAA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949545
89	NC_015387	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949545
90	NC_015387	CCT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949545
91	NC_015387	GCG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949545
92	NC_015387	GTA	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949545
93	NC_015387	CGG	2	6	6244	6249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949546
94	NC_015387	TTC	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949546
95	NC_015387	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
96	NC_015387	CCT	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
97	NC_015387	GAA	2	6	6575	6580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949546
98	NC_015387	CCA	2	6	6634	6639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949546
99	NC_015387	CCG	2	6	6645	6650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949546
100	NC_015387	TCC	2	6	6666	6671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
101	NC_015387	CCT	3	9	6802	6810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
102	NC_015387	TCC	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
103	NC_015387	GGA	2	6	6907	6912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949546
104	NC_015387	GAA	3	9	6950	6958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949546
105	NC_015387	CTG	2	6	6983	6988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949546
106	NC_015387	CTG	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949546
107	NC_015387	TCC	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
108	NC_015387	TCC	2	6	7149	7154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
109	NC_015387	GGC	2	6	7172	7177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949546
110	NC_015387	CCT	2	6	7207	7212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
111	NC_015387	GGT	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949546
112	NC_015387	GCC	2	6	7295	7300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949546
113	NC_015387	CGC	2	6	7396	7401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949546
114	NC_015387	CCG	2	6	7408	7413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949546
115	NC_015387	GCG	2	6	7440	7445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949546
116	NC_015387	CTC	2	6	7448	7453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
117	NC_015387	TCG	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949546
118	NC_015387	CCA	2	6	7501	7506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949546
119	NC_015387	TCC	2	6	7530	7535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
120	NC_015387	CCT	3	9	7576	7584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
121	NC_015387	TTG	2	6	7623	7628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949546
122	NC_015387	TCG	2	6	7650	7655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949546
123	NC_015387	CTG	2	6	7682	7687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949546
124	NC_015387	AAC	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949546
125	NC_015387	TGC	2	6	7893	7898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949546
126	NC_015387	CTT	2	6	7957	7962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949546
127	NC_015387	TGC	2	6	8319	8324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949547
128	NC_015387	GCC	2	6	8363	8368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949547
129	NC_015387	CCT	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949547
130	NC_015387	TGG	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949547
131	NC_015387	TCG	2	6	8475	8480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949547
132	NC_015387	GTG	2	6	8503	8508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949547
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256	NC_015387	GAG	2	6	15954	15959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949556
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