MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_4p

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015383	TCGAGC	2	12	6515	6526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814459
2	NC_015383	AGCGGA	2	12	7273	7284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814460
3	NC_015383	GTCGCA	2	12	9052	9063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814461
4	NC_015383	CGACGG	2	12	11746	11757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814465
5	NC_015383	CTGCGT	2	12	16013	16024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814468
6	NC_015383	CGCGGC	2	12	18499	18510	0 %	0 %	50 %	50 %	330814470
7	NC_015383	AGGTGA	2	12	18861	18872	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330814470
8	NC_015383	CGAAGT	2	12	21422	21433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814473
9	NC_015383	CGCCAC	2	12	22009	22020	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330814473
10	NC_015383	GCTCGA	2	12	22543	22554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814474
11	NC_015383	CGGCCG	2	12	23120	23131	0 %	0 %	50 %	50 %	330814476
12	NC_015383	ACAAGG	2	12	29868	29879	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814484
13	NC_015383	ATCACC	2	12	33670	33681	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330814491
14	NC_015383	GGCGAT	2	12	35174	35185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015383	CGTCGA	2	12	37259	37270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814494
16	NC_015383	TCGATC	2	12	38908	38919	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330814496
17	NC_015383	TCTGCC	2	12	40367	40378	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330814498
18	NC_015383	GAGGCG	2	12	41875	41886	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015383	GAGGCG	2	12	45663	45674	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330814502
20	NC_015383	GCCGGC	2	12	50322	50333	0 %	0 %	50 %	50 %	330814509
21	NC_015383	ATCGAG	2	12	56196	56207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814518
22	NC_015383	CTCGCG	2	12	61262	61273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814524
23	NC_015383	TATCAG	2	12	63794	63805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330814525
24	NC_015383	GACACC	2	12	68321	68332	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330814528
25	NC_015383	ACGGAG	2	12	70902	70913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814532
26	NC_015383	CAGATG	2	12	77016	77027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814538
27	NC_015383	TCCAGA	2	12	82208	82219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814542
28	NC_015383	AGGTCG	2	12	87089	87100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814548
29	NC_015383	CGGGCG	2	12	90660	90671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814551
30	NC_015383	TGCGGG	2	12	93572	93583	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330814554
31	NC_015383	GGCTCG	2	12	99256	99267	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015383	CCCCGG	2	12	100042	100053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015383	CGAGGT	2	12	100593	100604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814558
34	NC_015383	CTGGAT	2	12	101614	101625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814558
35	NC_015383	TTGGAT	2	12	102603	102614	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	330814559
36	NC_015383	AAGCGG	2	12	103062	103073	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814560
37	NC_015383	CGGCAA	2	12	104974	104985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814563
38	NC_015383	AAGCTG	2	12	105734	105745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814563
39	NC_015383	CCATCA	2	12	105858	105869	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015383	CATAGG	2	12	105962	105973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015383	ATGCCC	2	12	106932	106943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814564
42	NC_015383	CGCGTG	2	12	108192	108203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015383	CGAGAA	2	12	109415	109426	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814565
44	NC_015383	AGCGCG	2	12	109539	109550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814565
45	NC_015383	GAAACA	2	12	110634	110645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330814566
46	NC_015383	CTTCAT	2	12	113456	113467	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330814569
47	NC_015383	TTCCGC	2	12	114075	114086	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330814569
48	NC_015383	GAAACG	2	12	116335	116346	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814571
49	NC_015383	GGCAAA	2	12	120277	120288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814576
50	NC_015383	TCGCAC	2	12	125135	125146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814579
51	NC_015383	CGAGCG	2	12	127337	127348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814582
52	NC_015383	CCGGAC	2	12	129292	129303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814584
53	NC_015383	CCACGA	2	12	130098	130109	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015383	GGCGCC	2	12	132426	132437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015383	TCGCGA	2	12	133275	133286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015383	ACGGCG	2	12	133468	133479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814588
57	NC_015383	CGTGCG	2	12	138622	138633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814591
58	NC_015383	TCGCGC	2	12	141667	141678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814593
59	NC_015383	CGAAAT	2	12	145081	145092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330814596
60	NC_015383	GAGCGC	2	12	145464	145475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814596
61	NC_015383	CCAGCG	2	12	146757	146768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814597
62	NC_015383	GAGTGC	2	12	146940	146951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814597
63	NC_015383	CGGCAT	2	12	147311	147322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814597
64	NC_015383	GGTCGG	2	12	148843	148854	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330814598
65	NC_015383	GCGCGG	2	12	150537	150548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814599
66	NC_015383	CGGTGC	2	12	151639	151650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015383	ACGCGG	2	12	151708	151719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015383	GTTCGA	2	12	152435	152446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015383	GCCCGC	2	12	156312	156323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330814602
70	NC_015383	CCGACG	2	12	157068	157079	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814603
71	NC_015383	CGCGCC	2	12	159549	159560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330814605
72	NC_015383	TACCGC	2	12	163858	163869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814608
73	NC_015383	TGCTTG	2	12	164079	164090	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015383	GAACAC	2	12	165026	165037	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330814609
75	NC_015383	TTCGAT	2	12	165238	165249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015383	GTCACA	2	12	166691	166702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814611
77	NC_015383	TCGCGC	2	12	166978	166989	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015383	TCGTCA	2	12	167218	167229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330814612
79	NC_015383	CGCGAT	2	12	168614	168625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814614
80	NC_015383	CTGGAT	2	12	174152	174163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015383	CGGCCG	2	12	174426	174437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015383	AAGCGG	2	12	175599	175610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814618
83	NC_015383	CGCGTG	2	12	176552	176563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015383	GCGCCC	2	12	178207	178218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015383	ACTCCA	2	12	181425	181436	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330814624
86	NC_015383	GCACCC	2	12	184768	184779	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330814626
87	NC_015383	TCGCGA	2	12	185718	185729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015383	TCGCGC	2	12	186962	186973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015383	GCAACG	2	12	190475	190486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814628
90	NC_015383	TCGGCC	2	12	190766	190777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814628
91	NC_015383	GCCGGC	2	12	192948	192959	0 %	0 %	50 %	50 %	330814630
92	NC_015383	GCCAGC	2	12	192970	192981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814630
93	NC_015383	GCGCCG	2	12	193324	193335	0 %	0 %	50 %	50 %	330814630
94	NC_015383	ATCGCG	2	12	193625	193636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814631
95	NC_015383	AGGCCG	2	12	196000	196011	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814632
96	NC_015383	GCAGGC	2	12	199192	199203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814634
97	NC_015383	AGCGGC	2	12	202335	202346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814634
98	NC_015383	GGCGCG	2	12	202976	202987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814634
99	NC_015383	CCTGGT	2	12	203182	203193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814634
100	NC_015383	CATCGA	2	12	203503	203514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814634
101	NC_015383	GGCGTC	2	12	204884	204895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814634
102	NC_015383	GGCCGG	2	12	206885	206896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814635
103	NC_015383	CCTCGA	2	12	207386	207397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814635
104	NC_015383	CGCAGC	2	12	208687	208698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814635
105	NC_015383	CGGCAG	2	12	209616	209627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814635
106	NC_015383	TCGACC	2	12	212332	212343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814635
107	NC_015383	GGTGCC	2	12	215502	215513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814635
108	NC_015383	GGTGCC	2	12	215997	216008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814635
109	NC_015383	TGCCGA	2	12	216071	216082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814635
110	NC_015383	GGCCAT	2	12	219052	219063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015383	CATCGA	2	12	220491	220502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814636
112	NC_015383	ATCTCG	2	12	220649	220660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330814636
113	NC_015383	CGGCGA	2	12	221277	221288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814636
114	NC_015383	ATATCA	2	12	228740	228751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015383	TGACGA	2	12	231973	231984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814643
116	NC_015383	TTGTTC	2	12	239989	240000	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330814650
117	NC_015383	CGATAC	2	12	240029	240040	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814650
118	NC_015383	CGTAGC	2	12	242057	242068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814650
119	NC_015383	TCGCGC	2	12	246067	246078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814651
120	NC_015383	GTAGTC	2	12	246422	246433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814651
121	NC_015383	AGCTCG	2	12	246849	246860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814651
122	NC_015383	GTCGAG	2	12	247034	247045	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814651
123	NC_015383	GAACGC	2	12	247067	247078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814651
124	NC_015383	ATCGAA	2	12	249021	249032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330814654
125	NC_015383	CCGGTA	2	12	251190	251201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814654
126	NC_015383	TCGTCC	2	12	251539	251550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330814654
127	NC_015383	GCTTGC	2	12	253626	253637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814655
128	NC_015383	CAGGCG	2	12	255136	255147	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814656
129	NC_015383	TGATCG	2	12	258111	258122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814659
130	NC_015383	CGCGAG	2	12	259672	259683	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814661
131	NC_015383	GTTATT	2	12	261884	261895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015383	ACGCTC	2	12	263371	263382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814663
133	NC_015383	TGCGGC	2	12	264734	264745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814665
134	NC_015383	GGTTCT	2	12	265043	265054	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330814665
135	NC_015383	GCCGTT	2	12	268700	268711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015383	TCGCCG	2	12	273215	273226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814669
137	NC_015383	CGACAT	2	12	277864	277875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814674
138	NC_015383	GCGAGC	2	12	279740	279751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814675
139	NC_015383	TCGCTA	2	12	283752	283763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015383	CGGGCG	2	12	285532	285543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814680
141	NC_015383	GGCTCG	2	12	287109	287120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814681
142	NC_015383	TCGCGC	2	12	288163	288174	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814682
143	NC_015383	TCGAGC	2	12	294004	294015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814686
144	NC_015383	CGCCGA	2	12	300807	300818	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814692
145	NC_015383	CTTCTG	2	12	303478	303489	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015383	GCCGTT	2	12	304669	304680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814693
147	NC_015383	CCGAAG	2	12	311719	311730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814697
148	NC_015383	CGAGCG	2	12	314029	314040	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015383	TTCCGT	2	12	314914	314925	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015383	CCGTCA	2	12	315152	315163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015383	GACGCC	2	12	316253	316264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814704
152	NC_015383	CCTCGC	2	12	321567	321578	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	330814709
153	NC_015383	GGCGCA	2	12	323572	323583	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814711
154	NC_015383	CAGCGC	2	12	325677	325688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814713
155	NC_015383	GCCGGC	2	12	326304	326315	0 %	0 %	50 %	50 %	330814713
156	NC_015383	ACGCTG	2	12	326638	326649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814713
157	NC_015383	GAACCA	2	12	327249	327260	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330814713
158	NC_015383	CGCCGG	2	12	332383	332394	0 %	0 %	50 %	50 %	330814717
159	NC_015383	ACGCTC	2	12	335484	335495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814720
160	NC_015383	TACTTG	2	12	340331	340342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330814724
161	NC_015383	TCGGCC	2	12	342622	342633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814726
162	NC_015383	TGCCCC	2	12	343035	343046	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_015383	CCAGCA	2	12	343114	343125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330814728
164	NC_015383	GCTTCG	2	12	349871	349882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814735
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166	NC_015383	CGGCCG	2	12	352854	352865	0 %	0 %	50 %	50 %	330814739
167	NC_015383	CGATGG	2	12	356628	356639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814743
168	NC_015383	CCTGAA	2	12	358832	358843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015383	GCCGAG	2	12	364545	364556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814748
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171	NC_015383	CCTCGC	2	12	366566	366577	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_015383	TTGAGC	2	12	371271	371282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_015383	GCCTGA	2	12	377329	377340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814760
174	NC_015383	GTAGGT	2	12	392006	392017	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015383	ACGGGA	2	12	392299	392310	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
176	NC_015383	ATGTCG	2	12	393835	393846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814767
177	NC_015383	GCATCA	2	12	394685	394696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814768
178	NC_015383	GACGCC	2	12	400570	400581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.