MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_4p

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015383	TCGAGC	2	12	6515	6526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814459
2	NC_015383	AGCGGA	2	12	7273	7284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814460
3	NC_015383	GTCGCA	2	12	9052	9063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814461
4	NC_015383	CGACGG	2	12	11746	11757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814465
5	NC_015383	CTGCGT	2	12	16013	16024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814468
6	NC_015383	CGCGGC	2	12	18499	18510	0 %	0 %	50 %	50 %	330814470
7	NC_015383	AGGTGA	2	12	18861	18872	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330814470
8	NC_015383	CGAAGT	2	12	21422	21433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814473
9	NC_015383	CGCCAC	2	12	22009	22020	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330814473
10	NC_015383	GCTCGA	2	12	22543	22554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814474
11	NC_015383	CGGCCG	2	12	23120	23131	0 %	0 %	50 %	50 %	330814476
12	NC_015383	ACAAGG	2	12	29868	29879	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814484
13	NC_015383	ATCACC	2	12	33670	33681	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330814491
14	NC_015383	CGTCGA	2	12	37259	37270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814494
15	NC_015383	TCGATC	2	12	38908	38919	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330814496
16	NC_015383	TCTGCC	2	12	40367	40378	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330814498
17	NC_015383	GAGGCG	2	12	45663	45674	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330814502
18	NC_015383	GCCGGC	2	12	50322	50333	0 %	0 %	50 %	50 %	330814509
19	NC_015383	ATCGAG	2	12	56196	56207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814518
20	NC_015383	CTCGCG	2	12	61262	61273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814524
21	NC_015383	TATCAG	2	12	63794	63805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330814525
22	NC_015383	GACACC	2	12	68321	68332	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330814528
23	NC_015383	ACGGAG	2	12	70902	70913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814532
24	NC_015383	CAGATG	2	12	77016	77027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814538
25	NC_015383	TCCAGA	2	12	82208	82219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814542
26	NC_015383	AGGTCG	2	12	87089	87100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814548
27	NC_015383	CGGGCG	2	12	90660	90671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814551
28	NC_015383	TGCGGG	2	12	93572	93583	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330814554
29	NC_015383	CGAGGT	2	12	100593	100604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814558
30	NC_015383	CTGGAT	2	12	101614	101625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814558
31	NC_015383	TTGGAT	2	12	102603	102614	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	330814559
32	NC_015383	AAGCGG	2	12	103062	103073	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814560
33	NC_015383	CGGCAA	2	12	104974	104985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814563
34	NC_015383	AAGCTG	2	12	105734	105745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814563
35	NC_015383	ATGCCC	2	12	106932	106943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814564
36	NC_015383	CGAGAA	2	12	109415	109426	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814565
37	NC_015383	AGCGCG	2	12	109539	109550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814565
38	NC_015383	GAAACA	2	12	110634	110645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330814566
39	NC_015383	CTTCAT	2	12	113456	113467	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330814569
40	NC_015383	TTCCGC	2	12	114075	114086	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330814569
41	NC_015383	GAAACG	2	12	116335	116346	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814571
42	NC_015383	GGCAAA	2	12	120277	120288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330814576
43	NC_015383	TCGCAC	2	12	125135	125146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814579
44	NC_015383	CGAGCG	2	12	127337	127348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814582
45	NC_015383	CCGGAC	2	12	129292	129303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814584
46	NC_015383	ACGGCG	2	12	133468	133479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814588
47	NC_015383	CGTGCG	2	12	138622	138633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814591
48	NC_015383	TCGCGC	2	12	141667	141678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814593
49	NC_015383	CGAAAT	2	12	145081	145092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330814596
50	NC_015383	GAGCGC	2	12	145464	145475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814596
51	NC_015383	CCAGCG	2	12	146757	146768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814597
52	NC_015383	GAGTGC	2	12	146940	146951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814597
53	NC_015383	CGGCAT	2	12	147311	147322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814597
54	NC_015383	GGTCGG	2	12	148843	148854	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330814598
55	NC_015383	GCGCGG	2	12	150537	150548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814599
56	NC_015383	GCCCGC	2	12	156312	156323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330814602
57	NC_015383	CCGACG	2	12	157068	157079	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814603
58	NC_015383	CGCGCC	2	12	159549	159560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330814605
59	NC_015383	TACCGC	2	12	163858	163869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814608
60	NC_015383	GAACAC	2	12	165026	165037	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330814609
61	NC_015383	GTCACA	2	12	166691	166702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814611
62	NC_015383	TCGTCA	2	12	167218	167229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330814612
63	NC_015383	CGCGAT	2	12	168614	168625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814614
64	NC_015383	AAGCGG	2	12	175599	175610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330814618
65	NC_015383	ACTCCA	2	12	181425	181436	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330814624
66	NC_015383	GCACCC	2	12	184768	184779	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330814626
67	NC_015383	GCAACG	2	12	190475	190486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814628
68	NC_015383	TCGGCC	2	12	190766	190777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814628
69	NC_015383	GCCGGC	2	12	192948	192959	0 %	0 %	50 %	50 %	330814630
70	NC_015383	GCCAGC	2	12	192970	192981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814630
71	NC_015383	GCGCCG	2	12	193324	193335	0 %	0 %	50 %	50 %	330814630
72	NC_015383	ATCGCG	2	12	193625	193636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814631
73	NC_015383	AGGCCG	2	12	196000	196011	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814632
74	NC_015383	GCAGGC	2	12	199192	199203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814634
75	NC_015383	AGCGGC	2	12	202335	202346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814634
76	NC_015383	GGCGCG	2	12	202976	202987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814634
77	NC_015383	CCTGGT	2	12	203182	203193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814634
78	NC_015383	CATCGA	2	12	203503	203514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814634
79	NC_015383	GGCGTC	2	12	204884	204895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814634
80	NC_015383	GGCCGG	2	12	206885	206896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814635
81	NC_015383	CCTCGA	2	12	207386	207397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814635
82	NC_015383	CGCAGC	2	12	208687	208698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814635
83	NC_015383	CGGCAG	2	12	209616	209627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814635
84	NC_015383	TCGACC	2	12	212332	212343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814635
85	NC_015383	GGTGCC	2	12	215502	215513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814635
86	NC_015383	GGTGCC	2	12	215997	216008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814635
87	NC_015383	TGCCGA	2	12	216071	216082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814635
88	NC_015383	CATCGA	2	12	220491	220502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814636
89	NC_015383	ATCTCG	2	12	220649	220660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330814636
90	NC_015383	CGGCGA	2	12	221277	221288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814636
91	NC_015383	TGACGA	2	12	231973	231984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330814643
92	NC_015383	TTGTTC	2	12	239989	240000	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330814650
93	NC_015383	CGATAC	2	12	240029	240040	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814650
94	NC_015383	CGTAGC	2	12	242057	242068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814650
95	NC_015383	TCGCGC	2	12	246067	246078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814651
96	NC_015383	GTAGTC	2	12	246422	246433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814651
97	NC_015383	AGCTCG	2	12	246849	246860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814651
98	NC_015383	GTCGAG	2	12	247034	247045	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814651
99	NC_015383	GAACGC	2	12	247067	247078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814651
100	NC_015383	ATCGAA	2	12	249021	249032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330814654
101	NC_015383	CCGGTA	2	12	251190	251201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814654
102	NC_015383	TCGTCC	2	12	251539	251550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330814654
103	NC_015383	GCTTGC	2	12	253626	253637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814655
104	NC_015383	CAGGCG	2	12	255136	255147	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814656
105	NC_015383	TGATCG	2	12	258111	258122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814659
106	NC_015383	CGCGAG	2	12	259672	259683	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814661
107	NC_015383	ACGCTC	2	12	263371	263382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814663
108	NC_015383	TGCGGC	2	12	264734	264745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814665
109	NC_015383	GGTTCT	2	12	265043	265054	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330814665
110	NC_015383	TCGCCG	2	12	273215	273226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814669
111	NC_015383	CGACAT	2	12	277864	277875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814674
112	NC_015383	GCGAGC	2	12	279740	279751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814675
113	NC_015383	CGGGCG	2	12	285532	285543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330814680
114	NC_015383	GGCTCG	2	12	287109	287120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330814681
115	NC_015383	TCGCGC	2	12	288163	288174	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814682
116	NC_015383	TCGAGC	2	12	294004	294015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814686
117	NC_015383	CGCCGA	2	12	300807	300818	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814692
118	NC_015383	GCCGTT	2	12	304669	304680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814693
119	NC_015383	CCGAAG	2	12	311719	311730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814697
120	NC_015383	GACGCC	2	12	316253	316264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814704
121	NC_015383	CCTCGC	2	12	321567	321578	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	330814709
122	NC_015383	GGCGCA	2	12	323572	323583	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814711
123	NC_015383	CAGCGC	2	12	325677	325688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814713
124	NC_015383	GCCGGC	2	12	326304	326315	0 %	0 %	50 %	50 %	330814713
125	NC_015383	ACGCTG	2	12	326638	326649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814713
126	NC_015383	GAACCA	2	12	327249	327260	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330814713
127	NC_015383	CGCCGG	2	12	332383	332394	0 %	0 %	50 %	50 %	330814717
128	NC_015383	ACGCTC	2	12	335484	335495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814720
129	NC_015383	TACTTG	2	12	340331	340342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330814724
130	NC_015383	TCGGCC	2	12	342622	342633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330814726
131	NC_015383	CCAGCA	2	12	343114	343125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330814728
132	NC_015383	GCTTCG	2	12	349871	349882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814735
133	NC_015383	CCATTC	2	12	350300	350311	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330814736
134	NC_015383	CGGCCG	2	12	352854	352865	0 %	0 %	50 %	50 %	330814739
135	NC_015383	CGATGG	2	12	356628	356639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330814743
136	NC_015383	GCCGAG	2	12	364545	364556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330814748
137	NC_015383	ACCCTG	2	12	364590	364601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330814748
138	NC_015383	GCCTGA	2	12	377329	377340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330814760
139	NC_015383	ATGTCG	2	12	393835	393846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330814767
140	NC_015383	GCATCA	2	12	394685	394696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330814768
141	NC_015383	GACGCC	2	12	400570	400581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330814772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.