MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_4p

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015383	CCGCA	2	10	3675	3684	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015383	AAAGG	2	10	35118	35127	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015383	GCCGG	2	10	35449	35458	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015383	TGCAG	2	10	63514	63523	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015383	GTCGC	2	10	73230	73239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015383	TTTTC	2	10	79682	79691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015383	CGGAC	2	10	88409	88418	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015383	GGCCT	2	10	89998	90007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015383	CGGTT	2	10	91020	91029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015383	AGCGA	2	10	94055	94064	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015383	GCGCA	2	10	96754	96763	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015383	GCAGG	2	10	98611	98620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015383	CGCGC	2	10	99746	99755	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015383	AAGCG	2	10	105933	105942	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015383	GCCAG	2	10	107429	107438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015383	TGGGC	2	10	107589	107598	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015383	AGCGG	2	10	112905	112914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015383	TCCGT	2	10	114117	114126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015383	TCCCA	2	10	117850	117859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015383	AAGCG	2	10	132553	132562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015383	CAAAC	2	10	132664	132673	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015383	TGCGT	2	10	137068	137077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015383	TCGAT	2	10	146252	146261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015383	TCGGT	2	10	152284	152293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015383	TGGCG	2	10	161407	161416	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015383	AAAGC	2	10	164323	164332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015383	CTCTC	2	10	164382	164391	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015383	CTTTC	2	10	169578	169587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015383	GGCGC	2	10	169965	169974	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015383	GCGGG	2	10	174004	174013	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015383	TGGGC	2	10	175949	175958	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015383	CAACG	2	10	177333	177342	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015383	GGGCC	2	10	190879	190888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015383	GGGCC	2	10	191416	191425	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015383	CGCGC	2	10	195200	195209	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015383	CGCTC	2	10	218981	218990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_015383	GATCG	2	10	218992	219001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015383	CCTGA	2	10	237236	237245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015383	TGGAC	2	10	258877	258886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015383	TACCT	2	10	261638	261647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015383	TATCA	2	10	273062	273071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015383	CGTGG	2	10	286093	286102	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015383	AGCGG	2	10	287517	287526	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015383	ACGAC	2	10	287601	287610	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015383	GAACC	2	10	290611	290620	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015383	GCATC	2	10	303055	303064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015383	GCCGC	2	10	309937	309946	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_015383	TCCAA	2	10	311433	311442	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015383	TTGAC	2	10	327963	327972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015383	CAATG	2	10	329259	329268	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015383	AGTGT	2	10	330290	330299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015383	AGTAA	2	10	330513	330522	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015383	ACTTG	2	10	336459	336468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015383	CAATG	2	10	338183	338192	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015383	GTCAC	2	10	338701	338710	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015383	ATCGA	2	10	357594	357603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015383	GCGCC	2	10	357750	357759	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_015383	GCACT	2	10	358088	358097	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015383	AACCG	2	10	359926	359935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015383	CTTCT	2	10	360179	360188	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015383	GCCCG	2	10	368573	368582	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_015383	GAGAC	2	10	368913	368922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015383	TTTTC	2	10	371677	371686	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015383	GGAGC	2	10	377738	377747	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015383	CTGTT	2	10	381440	381449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015383	AAAAT	2	10	384194	384203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015383	CATAC	2	10	392285	392294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.