MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_4p

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015383	GATGA	2	10	739	748	40 %	20 %	40 %	0 %	330814454
2	NC_015383	GCGCC	2	10	1986	1995	0 %	0 %	40 %	60 %	330814456
3	NC_015383	AGATC	2	10	2709	2718	40 %	20 %	20 %	20 %	330814456
4	NC_015383	GATCA	2	10	5993	6002	40 %	20 %	20 %	20 %	330814458
5	NC_015383	GACGG	2	10	8096	8105	20 %	0 %	60 %	20 %	330814460
6	NC_015383	GACGT	2	10	8651	8660	20 %	20 %	40 %	20 %	330814461
7	NC_015383	CCGAG	2	10	10115	10124	20 %	0 %	40 %	40 %	330814462
8	NC_015383	CGCGG	2	10	13373	13382	0 %	0 %	60 %	40 %	330814466
9	NC_015383	ACGTG	2	10	16831	16840	20 %	20 %	40 %	20 %	330814468
10	NC_015383	GGCGC	2	10	17055	17064	0 %	0 %	60 %	40 %	330814468
11	NC_015383	CGGTC	2	10	17078	17087	0 %	20 %	40 %	40 %	330814468
12	NC_015383	CGATT	2	10	18835	18844	20 %	40 %	20 %	20 %	330814470
13	NC_015383	GCCCG	2	10	19267	19276	0 %	0 %	40 %	60 %	330814471
14	NC_015383	TGGAC	2	10	20851	20860	20 %	20 %	40 %	20 %	330814472
15	NC_015383	ACGCG	2	10	21356	21365	20 %	0 %	40 %	40 %	330814473
16	NC_015383	AGTGA	2	10	24787	24796	40 %	20 %	40 %	0 %	330814478
17	NC_015383	CATCT	2	10	25241	25250	20 %	40 %	0 %	40 %	330814478
18	NC_015383	GGTCG	2	10	26931	26940	0 %	20 %	60 %	20 %	330814480
19	NC_015383	CGGCC	2	10	31060	31069	0 %	0 %	40 %	60 %	330814486
20	NC_015383	TGGCT	2	10	32160	32169	0 %	40 %	40 %	20 %	330814487
21	NC_015383	GGCAA	2	10	33180	33189	40 %	0 %	40 %	20 %	330814491
22	NC_015383	AGGCG	2	10	44414	44423	20 %	0 %	60 %	20 %	330814501
23	NC_015383	ATCGG	2	10	44687	44696	20 %	20 %	40 %	20 %	330814501
24	NC_015383	CCCGG	2	10	45830	45839	0 %	0 %	40 %	60 %	330814503
25	NC_015383	TGCGC	2	10	49177	49186	0 %	20 %	40 %	40 %	330814507
26	NC_015383	CGGTT	2	10	49343	49352	0 %	40 %	40 %	20 %	330814507
27	NC_015383	GATGG	2	10	49523	49532	20 %	20 %	60 %	0 %	330814508
28	NC_015383	TCGAG	2	10	51016	51025	20 %	20 %	40 %	20 %	330814511
29	NC_015383	GCCGG	2	10	54528	54537	0 %	0 %	60 %	40 %	330814516
30	NC_015383	GCTGA	2	10	57538	57547	20 %	20 %	40 %	20 %	330814519
31	NC_015383	GCGCG	2	10	58853	58862	0 %	0 %	60 %	40 %	330814520
32	NC_015383	ATCAC	2	10	61320	61329	40 %	20 %	0 %	40 %	330814524
33	NC_015383	GCGCA	3	15	63303	63317	20 %	0 %	40 %	40 %	330814524
34	NC_015383	GCCGT	2	10	68465	68474	0 %	20 %	40 %	40 %	330814528
35	NC_015383	GAGTC	2	10	74168	74177	20 %	20 %	40 %	20 %	330814535
36	NC_015383	AGGGC	2	10	76508	76517	20 %	0 %	60 %	20 %	330814538
37	NC_015383	CTTCG	2	10	77268	77277	0 %	40 %	20 %	40 %	330814538
38	NC_015383	ACTTC	2	10	77403	77412	20 %	40 %	0 %	40 %	330814538
39	NC_015383	GCACG	2	10	78766	78775	20 %	0 %	40 %	40 %	330814540
40	NC_015383	CAGCG	2	10	79433	79442	20 %	0 %	40 %	40 %	330814540
41	NC_015383	CGGGA	2	10	80302	80311	20 %	0 %	60 %	20 %	330814542
42	NC_015383	ACGTG	2	10	81479	81488	20 %	20 %	40 %	20 %	330814542
43	NC_015383	GCGAG	2	10	81783	81792	20 %	0 %	60 %	20 %	330814542
44	NC_015383	GCTGT	2	10	83646	83655	0 %	40 %	40 %	20 %	330814545
45	NC_015383	CGATT	2	10	86435	86444	20 %	40 %	20 %	20 %	330814547
46	NC_015383	GCGCA	2	10	89571	89580	20 %	0 %	40 %	40 %	330814549
47	NC_015383	CGAAA	2	10	90590	90599	60 %	0 %	20 %	20 %	330814551
48	NC_015383	TGCGC	2	10	92868	92877	0 %	20 %	40 %	40 %	330814554
49	NC_015383	TGCCG	2	10	93507	93516	0 %	20 %	40 %	40 %	330814554
50	NC_015383	CACGC	2	10	93733	93742	20 %	0 %	20 %	60 %	330814554
51	NC_015383	GTCCG	2	10	94415	94424	0 %	20 %	40 %	40 %	330814555
52	NC_015383	ATGCA	2	10	94569	94578	40 %	20 %	20 %	20 %	330814555
53	NC_015383	GATCG	2	10	94581	94590	20 %	20 %	40 %	20 %	330814555
54	NC_015383	GGGTC	2	10	94658	94667	0 %	20 %	60 %	20 %	330814555
55	NC_015383	CGCGG	2	10	95715	95724	0 %	0 %	60 %	40 %	330814556
56	NC_015383	CGGCG	2	10	95931	95940	0 %	0 %	60 %	40 %	330814556
57	NC_015383	ACTGA	2	10	97398	97407	40 %	20 %	20 %	20 %	330814557
58	NC_015383	CCCCG	2	10	100238	100247	0 %	0 %	20 %	80 %	330814558
59	NC_015383	CGGCG	2	10	100639	100648	0 %	0 %	60 %	40 %	330814558
60	NC_015383	CAGCC	2	10	102540	102549	20 %	0 %	20 %	60 %	330814559
61	NC_015383	AGCCA	2	10	106565	106574	40 %	0 %	20 %	40 %	330814564
62	NC_015383	TCGAC	2	10	107247	107256	20 %	20 %	20 %	40 %	330814564
63	NC_015383	CGGCG	2	10	108866	108875	0 %	0 %	60 %	40 %	330814565
64	NC_015383	CGTCG	2	10	113670	113679	0 %	20 %	40 %	40 %	330814569
65	NC_015383	GTTCA	2	10	116147	116156	20 %	40 %	20 %	20 %	330814571
66	NC_015383	GGATG	2	10	117693	117702	20 %	20 %	60 %	0 %	330814572
67	NC_015383	AAGCG	2	10	119668	119677	40 %	0 %	40 %	20 %	330814576
68	NC_015383	TGCGC	2	10	120204	120213	0 %	20 %	40 %	40 %	330814576
69	NC_015383	GTGGC	2	10	120405	120414	0 %	20 %	60 %	20 %	330814576
70	NC_015383	AGCCG	2	10	120540	120549	20 %	0 %	40 %	40 %	330814576
71	NC_015383	GGCAG	2	10	122098	122107	20 %	0 %	60 %	20 %	330814577
72	NC_015383	TGCCG	2	10	123608	123617	0 %	20 %	40 %	40 %	330814579
73	NC_015383	CGCGA	2	10	125525	125534	20 %	0 %	40 %	40 %	330814580
74	NC_015383	TCGCG	2	10	126421	126430	0 %	20 %	40 %	40 %	330814581
75	NC_015383	CGGTT	2	10	127222	127231	0 %	40 %	40 %	20 %	330814582
76	NC_015383	GCGAG	2	10	132850	132859	20 %	0 %	60 %	20 %	330814587
77	NC_015383	GTCGC	2	10	135477	135486	0 %	20 %	40 %	40 %	330814589
78	NC_015383	ATGGA	2	10	136028	136037	40 %	20 %	40 %	0 %	330814589
79	NC_015383	TCACG	2	10	136854	136863	20 %	20 %	20 %	40 %	330814589
80	NC_015383	ACGCA	2	10	139897	139906	40 %	0 %	20 %	40 %	330814592
81	NC_015383	GACTG	2	10	140511	140520	20 %	20 %	40 %	20 %	330814592
82	NC_015383	ATCGC	2	10	140758	140767	20 %	20 %	20 %	40 %	330814592
83	NC_015383	TCGCG	2	10	141014	141023	0 %	20 %	40 %	40 %	330814592
84	NC_015383	GGCCG	2	10	141338	141347	0 %	0 %	60 %	40 %	330814593
85	NC_015383	CGCGG	2	10	141607	141616	0 %	0 %	60 %	40 %	330814593
86	NC_015383	GCGAA	2	10	141748	141757	40 %	0 %	40 %	20 %	330814593
87	NC_015383	GCTGG	2	10	142208	142217	0 %	20 %	60 %	20 %	330814593
88	NC_015383	GTTCG	2	10	144336	144345	0 %	40 %	40 %	20 %	330814595
89	NC_015383	GTCAT	2	10	145060	145069	20 %	40 %	20 %	20 %	330814595
90	NC_015383	TCGAA	2	10	146115	146124	40 %	20 %	20 %	20 %	330814596
91	NC_015383	TCTTT	2	10	146225	146234	0 %	80 %	0 %	20 %	330814596
92	NC_015383	CGTGA	2	10	147358	147367	20 %	20 %	40 %	20 %	330814597
93	NC_015383	CGCAA	2	10	147901	147910	40 %	0 %	20 %	40 %	330814598
94	NC_015383	GGGGC	2	10	148613	148622	0 %	0 %	80 %	20 %	330814598
95	NC_015383	TGCGG	2	10	149348	149357	0 %	20 %	60 %	20 %	330814599
96	NC_015383	CACGC	2	10	151461	151470	20 %	0 %	20 %	60 %	330814600
97	NC_015383	CGGCG	2	10	153108	153117	0 %	0 %	60 %	40 %	330814601
98	NC_015383	GCGCG	2	10	153289	153298	0 %	0 %	60 %	40 %	330814601
99	NC_015383	GCCGA	2	10	154481	154490	20 %	0 %	40 %	40 %	330814602
100	NC_015383	GCGTC	2	10	155022	155031	0 %	20 %	40 %	40 %	330814602
101	NC_015383	CGGCG	2	10	155079	155088	0 %	0 %	60 %	40 %	330814602
102	NC_015383	GTGAC	2	10	155339	155348	20 %	20 %	40 %	20 %	330814602
103	NC_015383	CGAGC	2	10	155704	155713	20 %	0 %	40 %	40 %	330814602
104	NC_015383	GCCGC	2	10	155871	155880	0 %	0 %	40 %	60 %	330814602
105	NC_015383	GATTG	2	10	156932	156941	20 %	40 %	40 %	0 %	330814603
106	NC_015383	TCGCG	2	10	159223	159232	0 %	20 %	40 %	40 %	330814605
107	NC_015383	CGATG	2	10	159528	159537	20 %	20 %	40 %	20 %	330814605
108	NC_015383	ATCGA	2	10	159936	159945	40 %	20 %	20 %	20 %	330814606
109	NC_015383	GCACG	2	10	160606	160615	20 %	0 %	40 %	40 %	330814607
110	NC_015383	TGATG	2	10	165563	165572	20 %	40 %	40 %	0 %	330814610
111	NC_015383	GAAAG	2	10	166238	166247	60 %	0 %	40 %	0 %	330814611
112	NC_015383	TCGGC	2	10	168266	168275	0 %	20 %	40 %	40 %	330814614
113	NC_015383	GTGCA	2	10	171200	171209	20 %	20 %	40 %	20 %	330814615
114	NC_015383	CAGCC	2	10	175077	175086	20 %	0 %	20 %	60 %	330814617
115	NC_015383	CGTGG	2	10	177720	177729	0 %	20 %	60 %	20 %	330814620
116	NC_015383	CGCTG	2	10	179065	179074	0 %	20 %	40 %	40 %	330814621
117	NC_015383	TCGAT	2	10	181947	181956	20 %	40 %	20 %	20 %	330814625
118	NC_015383	CGCGT	2	10	185265	185274	0 %	20 %	40 %	40 %	330814626
119	NC_015383	TGCGC	2	10	187820	187829	0 %	20 %	40 %	40 %	330814627
120	NC_015383	ATCCG	2	10	188787	188796	20 %	20 %	20 %	40 %	330814628
121	NC_015383	CGGCG	2	10	188883	188892	0 %	0 %	60 %	40 %	330814628
122	NC_015383	GGGCC	2	10	190239	190248	0 %	0 %	60 %	40 %	330814628
123	NC_015383	GCCGC	2	10	190665	190674	0 %	0 %	40 %	60 %	330814628
124	NC_015383	GCGCC	2	10	191275	191284	0 %	0 %	40 %	60 %	330814629
125	NC_015383	CGAGC	2	10	191301	191310	20 %	0 %	40 %	40 %	330814629
126	NC_015383	GGGCC	2	10	192215	192224	0 %	0 %	60 %	40 %	330814630
127	NC_015383	GCCTG	2	10	192407	192416	0 %	20 %	40 %	40 %	330814630
128	NC_015383	GCGCA	2	10	193643	193652	20 %	0 %	40 %	40 %	330814631
129	NC_015383	GGCAC	2	10	195013	195022	20 %	0 %	40 %	40 %	330814631
130	NC_015383	AAGGC	2	10	195943	195952	40 %	0 %	40 %	20 %	330814632
131	NC_015383	CGGCT	2	10	195975	195984	0 %	20 %	40 %	40 %	330814632
132	NC_015383	GCCGG	2	10	196074	196083	0 %	0 %	60 %	40 %	330814632
133	NC_015383	GTGCG	2	10	196114	196123	0 %	20 %	60 %	20 %	330814632
134	NC_015383	CGGCG	2	10	197590	197599	0 %	0 %	60 %	40 %	330814633
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258	NC_015383	GCGTG	2	10	324135	324144	0 %	20 %	60 %	20 %	330814712
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261	NC_015383	CGGTA	2	10	326533	326542	20 %	20 %	40 %	20 %	330814713
262	NC_015383	GCGCG	2	10	327677	327686	0 %	0 %	60 %	40 %	330814713
263	NC_015383	CCGGC	2	10	328591	328600	0 %	0 %	40 %	60 %	330814714
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294	NC_015383	TTTCC	2	10	387797	387806	0 %	60 %	0 %	40 %	330814766
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297	NC_015383	GGCCG	2	10	393641	393650	0 %	0 %	60 %	40 %	330814767
298	NC_015383	GGCGT	2	10	393670	393679	0 %	20 %	60 %	20 %	330814767
299	NC_015383	GGCCG	2	10	397258	397267	0 %	0 %	60 %	40 %	330814770
300	NC_015383	AGCGT	2	10	398879	398888	20 %	20 %	40 %	20 %	330814770
301	NC_015383	CCGCG	2	10	401270	401279	0 %	0 %	40 %	60 %	330814772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.