MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_1p

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015382	ATCGA	2	10	1	10	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015382	AGGGG	2	10	1881	1890	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015382	AAAGC	2	10	2683	2692	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015382	CTCGC	2	10	12024	12033	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015382	AAAAT	2	10	21449	21458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015382	GTTTC	2	10	26792	26801	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015382	CTCTT	2	10	27803	27812	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015382	GCGCC	2	10	30368	30377	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015382	GCCCG	2	10	46072	46081	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015382	TCATT	2	10	52248	52257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015382	AGGGC	2	10	52270	52279	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015382	TCACC	2	10	53117	53126	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015382	GAGCG	2	10	53975	53984	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015382	CAGGA	2	10	63764	63773	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015382	TGCGG	2	10	74140	74149	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015382	CGACG	2	10	96678	96687	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015382	CCGGC	2	10	108372	108381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015382	TCGCC	2	10	117412	117421	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_015382	GGCTG	2	10	118243	118252	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015382	ACCTC	2	10	123335	123344	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015382	GCGCA	2	10	125079	125088	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015382	GCGCC	2	10	125182	125191	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_015382	CGGCG	2	10	125510	125519	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015382	GCGCC	2	10	125693	125702	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015382	CGGCG	2	10	126136	126145	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015382	GGCGG	2	10	128008	128017	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015382	GATGC	2	10	129382	129391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015382	CGGCG	2	10	129845	129854	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015382	AAAAC	2	10	130493	130502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015382	AACCG	2	10	140718	140727	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015382	GCTCG	2	10	146038	146047	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015382	GCGAA	2	10	147911	147920	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015382	CGGAT	2	10	152652	152661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015382	CGTGG	2	10	153190	153199	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015382	CGGGG	2	10	157831	157840	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015382	GACAG	2	10	158029	158038	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015382	CCCCA	2	10	158105	158114	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
38	NC_015382	CTGCC	2	10	159259	159268	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015382	TCGCG	2	10	159309	159318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015382	TCGAC	2	10	161309	161318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015382	CGCGC	2	10	162062	162071	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_015382	GAAAC	2	10	162594	162603	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015382	CGATG	2	10	163329	163338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015382	AAAAC	2	10	172186	172195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015382	GCACG	2	10	175468	175477	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015382	CACGC	2	10	182116	182125	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015382	GCACT	2	10	184882	184891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015382	AGCGG	2	10	185102	185111	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015382	CATAC	2	10	191478	191487	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015382	ATTTT	2	10	192066	192075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015382	CGGGC	2	10	193694	193703	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015382	CGATC	2	10	197745	197754	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015382	GGCCC	2	10	200503	200512	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_015382	TCGAT	2	10	200622	200631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015382	GTTCG	2	10	202019	202028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015382	GCTCG	2	10	202562	202571	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015382	GCCAC	2	10	203104	203113	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_015382	GCTTC	2	10	234712	234721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015382	CCCGC	2	10	245252	245261	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_015382	GCCTA	2	10	245461	245470	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015382	GGGCA	2	10	246437	246446	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015382	CGGCG	2	10	252785	252794	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015382	AAAAC	2	10	253433	253442	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015382	CGTTG	2	10	265699	265708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015382	CGGCG	2	10	266618	266627	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015382	GCCCA	2	10	267112	267121	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015382	CGCAC	2	10	271254	271263	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015382	CTCTC	2	10	271686	271695	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_015382	GCCCG	2	10	274351	274360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.