MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_1p

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015382	ACGGC	2	10	1611	1620	20 %	0 %	40 %	40 %	330822220
2	NC_015382	GCTCC	2	10	3477	3486	0 %	20 %	20 %	60 %	330822221
3	NC_015382	CGCTG	2	10	5687	5696	0 %	20 %	40 %	40 %	330822222
4	NC_015382	GCAGG	2	10	5812	5821	20 %	0 %	60 %	20 %	330822222
5	NC_015382	GGTCG	2	10	9505	9514	0 %	20 %	60 %	20 %	330822225
6	NC_015382	AGCGA	2	10	10823	10832	40 %	0 %	40 %	20 %	330822225
7	NC_015382	CGGCT	2	10	13313	13322	0 %	20 %	40 %	40 %	330822227
8	NC_015382	CAGTT	2	10	13832	13841	20 %	40 %	20 %	20 %	330822227
9	NC_015382	ACGAT	2	10	14776	14785	40 %	20 %	20 %	20 %	330822227
10	NC_015382	GCGCC	2	10	22978	22987	0 %	0 %	40 %	60 %	330822233
11	NC_015382	AGCCG	2	10	24651	24660	20 %	0 %	40 %	40 %	330822234
12	NC_015382	ATTCA	2	10	28033	28042	40 %	40 %	0 %	20 %	330822237
13	NC_015382	TGCCC	2	10	28791	28800	0 %	20 %	20 %	60 %	330822237
14	NC_015382	CTGGC	2	10	32218	32227	0 %	20 %	40 %	40 %	330822238
15	NC_015382	GAACC	2	10	32636	32645	40 %	0 %	20 %	40 %	330822238
16	NC_015382	CGAAT	2	10	32901	32910	40 %	20 %	20 %	20 %	330822238
17	NC_015382	TGCCG	2	10	35216	35225	0 %	20 %	40 %	40 %	330822241
18	NC_015382	TCGGC	2	10	36640	36649	0 %	20 %	40 %	40 %	330822241
19	NC_015382	GCGAC	2	10	38971	38980	20 %	0 %	40 %	40 %	330822243
20	NC_015382	GGCGA	2	10	46874	46883	20 %	0 %	60 %	20 %	330822250
21	NC_015382	CGGCT	2	10	47492	47501	0 %	20 %	40 %	40 %	330822250
22	NC_015382	TCAGC	2	10	49001	49010	20 %	20 %	20 %	40 %	330822251
23	NC_015382	CGGCG	2	10	50080	50089	0 %	0 %	60 %	40 %	330822253
24	NC_015382	GATCG	2	10	50113	50122	20 %	20 %	40 %	20 %	330822253
25	NC_015382	TCGGC	2	10	55454	55463	0 %	20 %	40 %	40 %	330822258
26	NC_015382	AACCC	2	10	57703	57712	40 %	0 %	0 %	60 %	330822261
27	NC_015382	GCGTC	2	10	58649	58658	0 %	20 %	40 %	40 %	330822262
28	NC_015382	TCAGC	2	10	60646	60655	20 %	20 %	20 %	40 %	330822263
29	NC_015382	GCATC	2	10	63077	63086	20 %	20 %	20 %	40 %	330822264
30	NC_015382	CTGCG	2	10	63308	63317	0 %	20 %	40 %	40 %	330822264
31	NC_015382	GCCCA	2	10	64126	64135	20 %	0 %	20 %	60 %	330822265
32	NC_015382	CGTTG	2	10	64334	64343	0 %	40 %	40 %	20 %	330822265
33	NC_015382	ACGCG	2	10	64405	64414	20 %	0 %	40 %	40 %	330822265
34	NC_015382	TATGC	2	10	65791	65800	20 %	40 %	20 %	20 %	330822268
35	NC_015382	CCGCC	2	10	67764	67773	0 %	0 %	20 %	80 %	330822269
36	NC_015382	CCTCC	2	10	69320	69329	0 %	20 %	0 %	80 %	330822270
37	NC_015382	GCTCA	2	10	70114	70123	20 %	20 %	20 %	40 %	330822271
38	NC_015382	GACAT	2	10	70368	70377	40 %	20 %	20 %	20 %	330822271
39	NC_015382	CCAGG	2	10	74885	74894	20 %	0 %	40 %	40 %	330822273
40	NC_015382	AGCTC	2	10	75062	75071	20 %	20 %	20 %	40 %	330822274
41	NC_015382	CGGCG	2	10	75593	75602	0 %	0 %	60 %	40 %	330822274
42	NC_015382	CGGCG	2	10	76671	76680	0 %	0 %	60 %	40 %	330822276
43	NC_015382	CAGCG	2	10	76709	76718	20 %	0 %	40 %	40 %	330822276
44	NC_015382	CGGCG	2	10	77008	77017	0 %	0 %	60 %	40 %	330822276
45	NC_015382	GCGTC	2	10	77373	77382	0 %	20 %	40 %	40 %	330822276
46	NC_015382	CCCGG	2	10	79834	79843	0 %	0 %	40 %	60 %	330822278
47	NC_015382	CGCGC	2	10	82426	82435	0 %	0 %	40 %	60 %	330822281
48	NC_015382	ACGCA	2	10	83303	83312	40 %	0 %	20 %	40 %	330822281
49	NC_015382	AGGTC	2	10	85331	85340	20 %	20 %	40 %	20 %	330822283
50	NC_015382	TCAGC	2	10	89989	89998	20 %	20 %	20 %	40 %	330822286
51	NC_015382	GGCAC	2	10	93787	93796	20 %	0 %	40 %	40 %	330822290
52	NC_015382	ACGCC	2	10	95033	95042	20 %	0 %	20 %	60 %	330822291
53	NC_015382	CGGCG	2	10	95758	95767	0 %	0 %	60 %	40 %	330822292
54	NC_015382	CCGAT	2	10	95969	95978	20 %	20 %	20 %	40 %	330822292
55	NC_015382	GCTCG	2	10	96258	96267	0 %	20 %	40 %	40 %	330822292
56	NC_015382	CGGGC	2	10	97034	97043	0 %	0 %	60 %	40 %	330822293
57	NC_015382	GCACG	2	10	97852	97861	20 %	0 %	40 %	40 %	330822293
58	NC_015382	GCGCG	2	10	99495	99504	0 %	0 %	60 %	40 %	330822293
59	NC_015382	CTGGA	2	10	99761	99770	20 %	20 %	40 %	20 %	330822294
60	NC_015382	CTGGC	2	10	102396	102405	0 %	20 %	40 %	40 %	330822296
61	NC_015382	GAAGC	2	10	102644	102653	40 %	0 %	40 %	20 %	330822296
62	NC_015382	CGGCG	2	10	102804	102813	0 %	0 %	60 %	40 %	330822296
63	NC_015382	CCGCG	2	10	104867	104876	0 %	0 %	40 %	60 %	330822297
64	NC_015382	GGCCT	2	10	107135	107144	0 %	20 %	40 %	40 %	330822297
65	NC_015382	TCGCG	2	10	107832	107841	0 %	20 %	40 %	40 %	330822297
66	NC_015382	GGCGC	2	10	109583	109592	0 %	0 %	60 %	40 %	330822298
67	NC_015382	GGCGC	2	10	109678	109687	0 %	0 %	60 %	40 %	330822298
68	NC_015382	GACGC	2	10	109754	109763	20 %	0 %	40 %	40 %	330822298
69	NC_015382	TCGCG	2	10	110466	110475	0 %	20 %	40 %	40 %	330822298
70	NC_015382	ACCGG	2	10	111084	111093	20 %	0 %	40 %	40 %	330822298
71	NC_015382	CGACG	2	10	111253	111262	20 %	0 %	40 %	40 %	330822298
72	NC_015382	CGGCG	2	10	111893	111902	0 %	0 %	60 %	40 %	330822298
73	NC_015382	CGGCC	2	10	112269	112278	0 %	0 %	40 %	60 %	330822298
74	NC_015382	CGGCT	2	10	112886	112895	0 %	20 %	40 %	40 %	330822298
75	NC_015382	ACGCA	2	10	113329	113338	40 %	0 %	20 %	40 %	330822298
76	NC_015382	GGTTC	2	10	119300	119309	0 %	40 %	40 %	20 %	330822302
77	NC_015382	CCAAG	2	10	119475	119484	40 %	0 %	20 %	40 %	330822303
78	NC_015382	CTTCG	2	10	121216	121225	0 %	40 %	20 %	40 %	330822304
79	NC_015382	CCGGT	2	10	132141	132150	0 %	20 %	40 %	40 %	330822306
80	NC_015382	TGCCG	2	10	133867	133876	0 %	20 %	40 %	40 %	330822307
81	NC_015382	CGGGC	2	10	135783	135792	0 %	0 %	60 %	40 %	330822308
82	NC_015382	TCGCG	2	10	137718	137727	0 %	20 %	40 %	40 %	330822310
83	NC_015382	CCCTG	2	10	142459	142468	0 %	20 %	20 %	60 %	330822313
84	NC_015382	CGCTG	2	10	144355	144364	0 %	20 %	40 %	40 %	330822314
85	NC_015382	CCAGC	2	10	146770	146779	20 %	0 %	20 %	60 %	330822316
86	NC_015382	CGCTG	2	10	148088	148097	0 %	20 %	40 %	40 %	330822318
87	NC_015382	GGCGA	2	10	149662	149671	20 %	0 %	60 %	20 %	330822320
88	NC_015382	AGGCC	2	10	151097	151106	20 %	0 %	40 %	40 %	330822322
89	NC_015382	GCTGC	2	10	151642	151651	0 %	20 %	40 %	40 %	330822322
90	NC_015382	TCAAC	2	10	152854	152863	40 %	20 %	0 %	40 %	330822324
91	NC_015382	TTCAG	2	10	155121	155130	20 %	40 %	20 %	20 %	330822326
92	NC_015382	CTACC	2	10	155699	155708	20 %	20 %	0 %	60 %	330822326
93	NC_015382	CAAAC	2	10	156736	156745	60 %	0 %	0 %	40 %	330822327
94	NC_015382	AGGCA	2	10	156866	156875	40 %	0 %	40 %	20 %	330822327
95	NC_015382	ACGCC	2	10	165456	165465	20 %	0 %	20 %	60 %	330822331
96	NC_015382	CGGCC	2	10	165485	165494	0 %	0 %	40 %	60 %	330822331
97	NC_015382	TCACG	2	10	166432	166441	20 %	20 %	20 %	40 %	330822332
98	NC_015382	GTCGA	2	10	168218	168227	20 %	20 %	40 %	20 %	330822335
99	NC_015382	CCGAG	2	10	168422	168431	20 %	0 %	40 %	40 %	330822335
100	NC_015382	TGGCG	2	10	170072	170081	0 %	20 %	60 %	20 %	330822339
101	NC_015382	ACGCC	2	10	170098	170107	20 %	0 %	20 %	60 %	330822339
102	NC_015382	CGGCG	2	10	171538	171547	0 %	0 %	60 %	40 %	330822341
103	NC_015382	CCGGT	2	10	173834	173843	0 %	20 %	40 %	40 %	330822343
104	NC_015382	GCGCG	2	10	175696	175705	0 %	0 %	60 %	40 %	330822345
105	NC_015382	CGTTG	2	10	176653	176662	0 %	40 %	40 %	20 %	330822345
106	NC_015382	GCAGG	2	10	181622	181631	20 %	0 %	60 %	20 %	330822348
107	NC_015382	AGCGC	2	10	181909	181918	20 %	0 %	40 %	40 %	330822348
108	NC_015382	CCGTC	2	10	185623	185632	0 %	20 %	20 %	60 %	330822351
109	NC_015382	CACCC	2	10	186617	186626	20 %	0 %	0 %	80 %	330822351
110	NC_015382	ATCGC	2	10	186750	186759	20 %	20 %	20 %	40 %	330822351
111	NC_015382	CACCC	2	10	188738	188747	20 %	0 %	0 %	80 %	330822351
112	NC_015382	ATCGC	2	10	188871	188880	20 %	20 %	20 %	40 %	330822351
113	NC_015382	CGGTC	2	10	189694	189703	0 %	20 %	40 %	40 %	330822351
114	NC_015382	CTTCG	2	10	190317	190326	0 %	40 %	20 %	40 %	330822351
115	NC_015382	TCATG	2	10	194953	194962	20 %	40 %	20 %	20 %	330822353
116	NC_015382	CGGCT	2	10	200187	200196	0 %	20 %	40 %	40 %	330822356
117	NC_015382	GCGCG	2	10	205927	205936	0 %	0 %	60 %	40 %	330822359
118	NC_015382	AACAG	2	10	205978	205987	60 %	0 %	20 %	20 %	330822359
119	NC_015382	CGGCA	2	10	206743	206752	20 %	0 %	40 %	40 %	330822361
120	NC_015382	GGCGC	2	10	210238	210247	0 %	0 %	60 %	40 %	330822363
121	NC_015382	CGTGG	2	10	210413	210422	0 %	20 %	60 %	20 %	330822363
122	NC_015382	CGGCC	2	10	210824	210833	0 %	0 %	40 %	60 %	330822364
123	NC_015382	GGCGA	2	10	213223	213232	20 %	0 %	60 %	20 %	330822366
124	NC_015382	GGCGC	2	10	213596	213605	0 %	0 %	60 %	40 %	330822366
125	NC_015382	CGGCG	2	10	217475	217484	0 %	0 %	60 %	40 %	330822367
126	NC_015382	GCGCG	2	10	218838	218847	0 %	0 %	60 %	40 %	330822367
127	NC_015382	CGCGG	2	10	219969	219978	0 %	0 %	60 %	40 %	330822368
128	NC_015382	CGGCG	2	10	220102	220111	0 %	0 %	60 %	40 %	330822369
129	NC_015382	CGATG	2	10	220234	220243	20 %	20 %	40 %	20 %	330822369
130	NC_015382	GCGCG	2	10	220484	220493	0 %	0 %	60 %	40 %	330822369
131	NC_015382	TGCGG	2	10	221437	221446	0 %	20 %	60 %	20 %	330822370
132	NC_015382	ATCGC	2	10	221974	221983	20 %	20 %	20 %	40 %	330822370
133	NC_015382	CCGCG	2	10	222776	222785	0 %	0 %	40 %	60 %	330822370
134	NC_015382	GATCG	2	10	222816	222825	20 %	20 %	40 %	20 %	330822370
135	NC_015382	CCGGC	2	10	224051	224060	0 %	0 %	40 %	60 %	330822371
136	NC_015382	CCCGC	2	10	224695	224704	0 %	0 %	20 %	80 %	330822371
137	NC_015382	TGGAA	2	10	226927	226936	40 %	20 %	40 %	0 %	330822371
138	NC_015382	TCGCC	2	10	227953	227962	0 %	20 %	20 %	60 %	330822371
139	NC_015382	GCCGT	2	10	228681	228690	0 %	20 %	40 %	40 %	330822371
140	NC_015382	AGCTG	2	10	228757	228766	20 %	20 %	40 %	20 %	330822371
141	NC_015382	GCGAG	2	10	229657	229666	20 %	0 %	60 %	20 %	330822371
142	NC_015382	CCGGT	2	10	230832	230841	0 %	20 %	40 %	40 %	330822371
143	NC_015382	ATCGG	2	10	232788	232797	20 %	20 %	40 %	20 %	330822371
144	NC_015382	TCGCG	2	10	233646	233655	0 %	20 %	40 %	40 %	330822372
145	NC_015382	CAGCG	2	10	234587	234596	20 %	0 %	40 %	40 %	330822372
146	NC_015382	GGCTG	2	10	234753	234762	0 %	20 %	60 %	20 %	330822373
147	NC_015382	CGCAC	2	10	235907	235916	20 %	0 %	20 %	60 %	330822373
148	NC_015382	CGCGC	2	10	236228	236237	0 %	0 %	40 %	60 %	330822374
149	NC_015382	ATCCG	2	10	237328	237337	20 %	20 %	20 %	40 %	330822375
150	NC_015382	GCTAC	2	10	238173	238182	20 %	20 %	20 %	40 %	330822376
151	NC_015382	CGGGC	2	10	239543	239552	0 %	0 %	60 %	40 %	330822377
152	NC_015382	GCGCC	2	10	249061	249070	0 %	0 %	40 %	60 %	330822390
153	NC_015382	GCCGG	2	10	249169	249178	0 %	0 %	60 %	40 %	330822390
154	NC_015382	TCCGG	2	10	249382	249391	0 %	20 %	40 %	40 %	330822390
155	NC_015382	CCCCG	2	10	249646	249655	0 %	0 %	20 %	80 %	330822390
156	NC_015382	CGAGC	2	10	250046	250055	20 %	0 %	40 %	40 %	330822390
157	NC_015382	TCCAG	2	10	251854	251863	20 %	20 %	20 %	40 %	330822392
158	NC_015382	CAGCG	2	10	252221	252230	20 %	0 %	40 %	40 %	330822392
159	NC_015382	GCGCG	2	10	259096	259105	0 %	0 %	60 %	40 %	330822396
160	NC_015382	CGGGC	2	10	259499	259508	0 %	0 %	60 %	40 %	330822396
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162	NC_015382	CGATG	2	10	260007	260016	20 %	20 %	40 %	20 %	330822396
163	NC_015382	GAGCG	2	10	261681	261690	20 %	0 %	60 %	20 %	330822397
164	NC_015382	GGCTG	2	10	267985	267994	0 %	20 %	60 %	20 %	330822403
165	NC_015382	CGGGG	2	10	270287	270296	0 %	0 %	80 %	20 %	330822404
166	NC_015382	CTGCA	2	10	272901	272910	20 %	20 %	20 %	40 %	330822405
167	NC_015382	GATGC	2	10	273036	273045	20 %	20 %	40 %	20 %	330822405

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.