MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_1p

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015382	GCTG	2	8	3938	3945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015382	TCCG	2	8	4401	4408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015382	TGCC	2	8	4758	4765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015382	GCCC	2	8	4811	4818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015382	GTAG	2	8	4848	4855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015382	GCCG	2	8	4931	4938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015382	CCTG	2	8	6322	6329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015382	GGCT	2	8	11943	11950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015382	GGAT	2	8	16316	16323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015382	CCGT	2	8	16334	16341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015382	GATT	2	8	16476	16483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015382	GTCG	2	8	16594	16601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015382	CCCG	2	8	16798	16805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015382	CCGC	2	8	16973	16980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_015382	GATC	2	8	17077	17084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015382	GATC	2	8	17104	17111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015382	GACG	2	8	17188	17195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015382	GTTT	2	8	19588	19595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015382	CGAT	2	8	19815	19822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015382	GGCT	2	8	20195	20202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015382	GCTA	2	8	21572	21579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015382	GCAA	2	8	24210	24217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015382	GGAT	2	8	26265	26272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015382	GGAC	2	8	41594	41601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015382	CGGA	2	8	41632	41639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015382	CAGC	2	8	41674	41681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015382	GCAG	2	8	41841	41848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015382	GCGG	2	8	41875	41882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015382	GTTG	2	8	41986	41993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015382	CTGG	2	8	42189	42196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015382	GGCC	2	8	42234	42241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015382	GGGC	2	8	42299	42306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015382	CTGG	2	8	42360	42367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015382	GTCG	2	8	42725	42732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015382	CGGT	2	8	42811	42818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015382	ATGC	2	8	42857	42864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015382	CTGG	2	8	43111	43118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015382	TTCG	2	8	43881	43888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015382	GTCG	2	8	44243	44250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015382	ACAA	2	8	44334	44341	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015382	AGCG	2	8	44513	44520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015382	TCGG	2	8	45907	45914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015382	GCCG	2	8	45919	45926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015382	CAAG	2	8	45969	45976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015382	CGAC	2	8	48941	48948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015382	GAGG	3	12	49373	49384	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015382	CGGC	2	8	49393	49400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015382	GGCC	2	8	49651	49658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015382	CGGG	2	8	52469	52476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015382	GGCC	2	8	52682	52689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015382	GCCG	2	8	52740	52747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015382	GCCG	2	8	53261	53268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015382	CCGG	2	8	53985	53992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015382	AAAG	2	8	54828	54835	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015382	CGGC	2	8	54999	55006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015382	GCAC	2	8	61614	61621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015382	AGGG	2	8	61781	61788	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015382	AGCT	2	8	61904	61911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015382	GCAA	2	8	62183	62190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015382	ATCC	2	8	62469	62476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015382	TCGA	2	8	62607	62614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015382	GTCA	2	8	70048	70055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015382	ATGG	2	8	73758	73765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015382	GAAA	2	8	73771	73778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015382	GATG	2	8	74171	74178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015382	GGGA	2	8	79921	79928	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015382	GAGG	2	8	91727	91734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015382	CGCC	2	8	96785	96792	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_015382	GGCG	2	8	117565	117572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015382	AAGC	2	8	117808	117815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015382	GCCG	2	8	117968	117975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015382	GCCG	2	8	118019	118026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015382	GGCG	2	8	118307	118314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015382	CTGT	2	8	118553	118560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015382	TCCG	2	8	119792	119799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015382	GGAC	2	8	120017	120024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015382	GCTC	2	8	122058	122065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015382	CGCT	2	8	122140	122147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015382	CGGC	2	8	122630	122637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015382	GCTT	2	8	122868	122875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015382	GACA	2	8	123296	123303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015382	TTCG	2	8	123912	123919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015382	CGAA	2	8	124446	124453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015382	GTGC	2	8	125069	125076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015382	GCGT	2	8	125571	125578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015382	CCCG	2	8	125773	125780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_015382	CGGC	2	8	125791	125798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015382	CATC	2	8	125836	125843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015382	GCAC	2	8	125964	125971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015382	CGGC	2	8	126085	126092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015382	GGCC	2	8	126119	126126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015382	CGAT	2	8	126451	126458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015382	CGGC	2	8	126608	126615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015382	CGCT	2	8	127170	127177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015382	CAGG	2	8	127577	127584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015382	GCCG	2	8	127738	127745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015382	CAGC	2	8	128852	128859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015382	CGGC	2	8	128872	128879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015382	GCCG	2	8	129180	129187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015382	GCCG	2	8	129317	129324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015382	CGGC	2	8	129359	129366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015382	CTGG	2	8	129367	129374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015382	GCCC	2	8	129512	129519	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_015382	CAGC	2	8	129834	129841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015382	AGAC	2	8	130252	130259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015382	ATCC	2	8	130331	130338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015382	GGCG	2	8	132684	132691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015382	GGCT	2	8	133091	133098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015382	TGCT	2	8	133271	133278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015382	CTCG	2	8	136157	136164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015382	CCTG	2	8	136274	136281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015382	CGTG	2	8	136445	136452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015382	TTGA	2	8	136521	136528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015382	ATCA	2	8	137003	137010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015382	GATG	2	8	137295	137302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015382	CCTG	2	8	137360	137367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015382	CTGC	2	8	137500	137507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015382	CCGG	2	8	140675	140682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015382	GTTA	2	8	141806	141813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015382	CAGC	2	8	141832	141839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015382	CGGC	2	8	149011	149018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015382	CGAG	2	8	149114	149121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015382	CCAA	2	8	153835	153842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015382	TTTG	2	8	154646	154653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015382	CAAT	2	8	154709	154716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015382	ATCG	2	8	158122	158129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015382	ATGG	2	8	158219	158226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015382	GCCG	2	8	158530	158537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015382	CGTG	2	8	158877	158884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015382	GACG	2	8	158960	158967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015382	GCTC	2	8	158994	159001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015382	GCGG	2	8	159348	159355	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015382	GTCG	2	8	159513	159520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015382	ACTG	2	8	159555	159562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015382	ATTT	2	8	161189	161196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015382	AGCA	2	8	161359	161366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015382	AAGG	2	8	161629	161636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015382	GCGG	2	8	163080	163087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015382	TCGT	2	8	163484	163491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015382	CGAC	2	8	163681	163688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015382	GCCG	2	8	163991	163998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015382	CTGT	2	8	165573	165580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015382	TTGT	2	8	166003	166010	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015382	TCCC	2	8	166045	166052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_015382	AGAC	2	8	171945	171952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015382	ATCC	2	8	172024	172031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015382	GGCG	2	8	174377	174384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015382	ATCG	2	8	175525	175532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015382	CGTT	2	8	176969	176976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015382	TTAA	2	8	182429	182436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015382	CCAA	2	8	182561	182568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015382	AGCC	2	8	183398	183405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015382	GCCC	2	8	183488	183495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
154	NC_015382	CAGC	2	8	185047	185054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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232	NC_015382	GTGG	2	8	275463	275470	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.