MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 chromosome 1

Total Repeats: 4757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015381	ACGTG	2	10	161	170	20 %	20 %	40 %	20 %	330814957
2	NC_015381	GCGCC	2	10	359	368	0 %	0 %	40 %	60 %	330814957
3	NC_015381	CGCGC	2	10	375	384	0 %	0 %	40 %	60 %	330814957
4	NC_015381	ACCAC	2	10	1577	1586	40 %	0 %	0 %	60 %	330814957
5	NC_015381	AGCGC	2	10	3509	3518	20 %	0 %	40 %	40 %	330814959
6	NC_015381	GACGC	2	10	4455	4464	20 %	0 %	40 %	40 %	330814959
7	NC_015381	GCAGC	2	10	5972	5981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015381	CCGCC	2	10	13717	13726	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_015381	CCGCG	2	10	17258	17267	0 %	0 %	40 %	60 %	330814970
10	NC_015381	GGGCA	2	10	17349	17358	20 %	0 %	60 %	20 %	330814970
11	NC_015381	GGGCA	2	10	17598	17607	20 %	0 %	60 %	20 %	330814970
12	NC_015381	GCGCC	2	10	18046	18055	0 %	0 %	40 %	60 %	330814970
13	NC_015381	CCGGC	2	10	18072	18081	0 %	0 %	40 %	60 %	330814970
14	NC_015381	CGACG	2	10	18329	18338	20 %	0 %	40 %	40 %	330814970
15	NC_015381	GAACG	2	10	18853	18862	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015381	GATCG	2	10	19396	19405	20 %	20 %	40 %	20 %	330814972
17	NC_015381	GACGC	2	10	21911	21920	20 %	0 %	40 %	40 %	330814975
18	NC_015381	TCGCC	2	10	21930	21939	0 %	20 %	20 %	60 %	330814975
19	NC_015381	GGCGC	2	10	22325	22334	0 %	0 %	60 %	40 %	330814975
20	NC_015381	CCTCA	2	10	22377	22386	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015381	GGCGC	2	10	24034	24043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015381	GGCCA	2	10	28194	28203	20 %	0 %	40 %	40 %	330814977
23	NC_015381	TCGCC	2	10	28252	28261	0 %	20 %	20 %	60 %	330814977
24	NC_015381	TGCGC	2	10	28363	28372	0 %	20 %	40 %	40 %	330814977
25	NC_015381	GCCAG	2	10	28981	28990	20 %	0 %	40 %	40 %	330814977
26	NC_015381	CGCCT	2	10	29447	29456	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015381	GCGCC	2	10	29462	29471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015381	CATCG	2	10	30676	30685	20 %	20 %	20 %	40 %	330814979
29	NC_015381	GCGCG	3	15	31490	31504	0 %	0 %	60 %	40 %	330814980
30	NC_015381	AGCCG	2	10	31851	31860	20 %	0 %	40 %	40 %	330814981
31	NC_015381	CGGCG	2	10	34377	34386	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015381	GCTGC	2	10	34747	34756	0 %	20 %	40 %	40 %	330814985
33	NC_015381	CGCGG	2	10	36317	36326	0 %	0 %	60 %	40 %	330814987
34	NC_015381	CCTCG	2	10	39639	39648	0 %	20 %	20 %	60 %	330814991
35	NC_015381	CGTGC	2	10	40200	40209	0 %	20 %	40 %	40 %	330814992
36	NC_015381	CGCGC	2	10	40491	40500	0 %	0 %	40 %	60 %	330814992
37	NC_015381	CCAGC	2	10	41320	41329	20 %	0 %	20 %	60 %	330814993
38	NC_015381	GCCAC	2	10	41581	41590	20 %	0 %	20 %	60 %	330814994
39	NC_015381	TCGCG	2	10	41738	41747	0 %	20 %	40 %	40 %	330814994
40	NC_015381	TCGAT	2	10	42179	42188	20 %	40 %	20 %	20 %	330814994
41	NC_015381	ACGTC	2	10	42935	42944	20 %	20 %	20 %	40 %	330814995
42	NC_015381	GTCGA	2	10	43426	43435	20 %	20 %	40 %	20 %	330814995
43	NC_015381	GCGCG	2	10	44321	44330	0 %	0 %	60 %	40 %	330814996
44	NC_015381	CGGCG	2	10	44416	44425	0 %	0 %	60 %	40 %	330814996
45	NC_015381	CGACG	2	10	44723	44732	20 %	0 %	40 %	40 %	330814997
46	NC_015381	CGATG	2	10	45169	45178	20 %	20 %	40 %	20 %	330814998
47	NC_015381	AGGGA	2	10	45574	45583	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015381	CGAGG	2	10	48032	48041	20 %	0 %	60 %	20 %	330815002
49	NC_015381	AGCGC	2	10	48442	48451	20 %	0 %	40 %	40 %	330815002
50	NC_015381	TCGCC	2	10	49285	49294	0 %	20 %	20 %	60 %	330815002
51	NC_015381	CAGGC	2	10	49432	49441	20 %	0 %	40 %	40 %	330815003
52	NC_015381	AGCCG	2	10	50890	50899	20 %	0 %	40 %	40 %	330815003
53	NC_015381	GCGCC	2	10	51025	51034	0 %	0 %	40 %	60 %	330815003
54	NC_015381	GCGTC	2	10	51111	51120	0 %	20 %	40 %	40 %	330815003
55	NC_015381	TGTCG	2	10	52182	52191	0 %	40 %	40 %	20 %	330815004
56	NC_015381	GCCGA	2	10	53221	53230	20 %	0 %	40 %	40 %	330815005
57	NC_015381	CTCGC	2	10	53626	53635	0 %	20 %	20 %	60 %	330815005
58	NC_015381	CCGCG	2	10	54753	54762	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_015381	AGCGC	2	10	54819	54828	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015381	CGCGC	2	10	55768	55777	0 %	0 %	40 %	60 %	330815007
61	NC_015381	CGCGC	2	10	56440	56449	0 %	0 %	40 %	60 %	330815007
62	NC_015381	CGATC	2	10	56617	56626	20 %	20 %	20 %	40 %	330815007
63	NC_015381	ACAGC	2	10	57270	57279	40 %	0 %	20 %	40 %	330815008
64	NC_015381	ATCCG	2	10	57479	57488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015381	GCTCG	2	10	60063	60072	0 %	20 %	40 %	40 %	330815010
66	NC_015381	CGCGC	2	10	60073	60082	0 %	0 %	40 %	60 %	330815010
67	NC_015381	CGCGC	2	10	61364	61373	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015381	TCGGC	2	10	61990	61999	0 %	20 %	40 %	40 %	330815012
69	NC_015381	GCGCC	2	10	62791	62800	0 %	0 %	40 %	60 %	330815013
70	NC_015381	GACGA	2	10	63056	63065	40 %	0 %	40 %	20 %	330815013
71	NC_015381	GCCCG	2	10	64362	64371	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_015381	TGCGC	2	10	65221	65230	0 %	20 %	40 %	40 %	330815015
73	NC_015381	GCCAG	2	10	65830	65839	20 %	0 %	40 %	40 %	330815015
74	NC_015381	TTTTG	2	10	67205	67214	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015381	ATCGC	2	10	67725	67734	20 %	20 %	20 %	40 %	330815018
76	NC_015381	CGGCC	2	10	68346	68355	0 %	0 %	40 %	60 %	330815019
77	NC_015381	GATGC	2	10	70230	70239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015381	TGCGC	2	10	72587	72596	0 %	20 %	40 %	40 %	330815023
79	NC_015381	CGCGC	2	10	73103	73112	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_015381	GCACC	2	10	73290	73299	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_015381	GGCGC	2	10	73711	73720	0 %	0 %	60 %	40 %	330815024
82	NC_015381	CAGGG	2	10	76388	76397	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015381	GCGCC	2	10	76426	76435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_015381	CGGCG	2	10	78118	78127	0 %	0 %	60 %	40 %	330815028
85	NC_015381	CCGAC	2	10	79095	79104	20 %	0 %	20 %	60 %	330815029
86	NC_015381	GCGCG	2	10	79900	79909	0 %	0 %	60 %	40 %	330815029
87	NC_015381	CCGGG	2	10	80334	80343	0 %	0 %	60 %	40 %	330815030
88	NC_015381	CCGGC	2	10	83188	83197	0 %	0 %	40 %	60 %	330815032
89	NC_015381	CGGCG	2	10	84519	84528	0 %	0 %	60 %	40 %	330815033
90	NC_015381	CGCAT	2	10	90026	90035	20 %	20 %	20 %	40 %	330815038
91	NC_015381	CGACG	2	10	92597	92606	20 %	0 %	40 %	40 %	330815040
92	NC_015381	TGGCG	2	10	93030	93039	0 %	20 %	60 %	20 %	330815041
93	NC_015381	AGTCC	2	10	93812	93821	20 %	20 %	20 %	40 %	330815043
94	NC_015381	CACCG	2	10	93942	93951	20 %	0 %	20 %	60 %	330815043
95	NC_015381	CTCGA	2	10	97856	97865	20 %	20 %	20 %	40 %	330815046
96	NC_015381	GAAGC	2	10	98675	98684	40 %	0 %	40 %	20 %	330815047
97	NC_015381	GGCGA	2	10	100575	100584	20 %	0 %	60 %	20 %	330815048
98	NC_015381	CCCGG	2	10	101358	101367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_015381	GCGCA	2	10	101823	101832	20 %	0 %	40 %	40 %	330815050
100	NC_015381	GCGCC	2	10	102145	102154	0 %	0 %	40 %	60 %	330815050
101	NC_015381	TCGGC	2	10	102169	102178	0 %	20 %	40 %	40 %	330815050
102	NC_015381	CTGGA	2	10	103301	103310	20 %	20 %	40 %	20 %	330815051
103	NC_015381	CGGTG	2	10	103345	103354	0 %	20 %	60 %	20 %	330815051
104	NC_015381	TCGAA	2	10	103662	103671	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015381	GACTT	2	10	103764	103773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015381	CGCGC	2	10	105306	105315	0 %	0 %	40 %	60 %	330815052
107	NC_015381	CTCGC	2	10	106595	106604	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_015381	CTGCG	2	10	109592	109601	0 %	20 %	40 %	40 %	330815053
109	NC_015381	CGGCA	2	10	110831	110840	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015381	GACCG	2	10	112066	112075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015381	TCGAA	2	10	113627	113636	40 %	20 %	20 %	20 %	330815056
112	NC_015381	GCCGC	2	10	114330	114339	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_015381	GCCGG	2	10	115759	115768	0 %	0 %	60 %	40 %	330815059
114	NC_015381	CGCGC	2	10	116003	116012	0 %	0 %	40 %	60 %	330815059
115	NC_015381	CGCGG	3	15	117268	117282	0 %	0 %	60 %	40 %	330815059
116	NC_015381	CGACG	2	10	117706	117715	20 %	0 %	40 %	40 %	330815059
117	NC_015381	CAGCG	2	10	118595	118604	20 %	0 %	40 %	40 %	330815060
118	NC_015381	GCGCG	2	10	119577	119586	0 %	0 %	60 %	40 %	330815061
119	NC_015381	CGGCC	2	10	119591	119600	0 %	0 %	40 %	60 %	330815061
120	NC_015381	ACGCG	2	10	122279	122288	20 %	0 %	40 %	40 %	330815063
121	NC_015381	GCCCG	2	10	127230	127239	0 %	0 %	40 %	60 %	330815067
122	NC_015381	GCCAG	2	10	127853	127862	20 %	0 %	40 %	40 %	330815067
123	NC_015381	GCCGC	2	10	127931	127940	0 %	0 %	40 %	60 %	330815067
124	NC_015381	GCCGG	2	10	128709	128718	0 %	0 %	60 %	40 %	330815067
125	NC_015381	CGGGC	2	10	129831	129840	0 %	0 %	60 %	40 %	330815068
126	NC_015381	GCGCG	2	10	130469	130478	0 %	0 %	60 %	40 %	330815068
127	NC_015381	GCCAG	2	10	131359	131368	20 %	0 %	40 %	40 %	330815069
128	NC_015381	CGGCG	2	10	133411	133420	0 %	0 %	60 %	40 %	330815070
129	NC_015381	TCGGC	2	10	134178	134187	0 %	20 %	40 %	40 %	330815070
130	NC_015381	TTGTG	2	10	135260	135269	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015381	GCGCG	2	10	135580	135589	0 %	0 %	60 %	40 %	330815072
132	NC_015381	CCAGG	2	10	135626	135635	20 %	0 %	40 %	40 %	330815072
133	NC_015381	CGCGG	2	10	135976	135985	0 %	0 %	60 %	40 %	330815072
134	NC_015381	AAGCG	2	10	139464	139473	40 %	0 %	40 %	20 %	330815075
135	NC_015381	GGCCG	2	10	140160	140169	0 %	0 %	60 %	40 %	330815075
136	NC_015381	GGCGC	2	10	140219	140228	0 %	0 %	60 %	40 %	330815075
137	NC_015381	GCCGC	2	10	140694	140703	0 %	0 %	40 %	60 %	330815075
138	NC_015381	GGCGC	2	10	141772	141781	0 %	0 %	60 %	40 %	330815076
139	NC_015381	GCGCG	2	10	142349	142358	0 %	0 %	60 %	40 %	330815076
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141	NC_015381	GCGCC	2	10	143705	143714	0 %	0 %	40 %	60 %	330815077
142	NC_015381	GGCGA	2	10	144777	144786	20 %	0 %	60 %	20 %	330815079
143	NC_015381	GCCAG	2	10	145386	145395	20 %	0 %	40 %	40 %	330815080
144	NC_015381	GCCGC	2	10	145696	145705	0 %	0 %	40 %	60 %	330815080
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146	NC_015381	GCCAG	2	10	146160	146169	20 %	0 %	40 %	40 %	330815080
147	NC_015381	GGCGC	2	10	146337	146346	0 %	0 %	60 %	40 %	330815080
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149	NC_015381	GCCGC	2	10	146672	146681	0 %	0 %	40 %	60 %	330815080
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152	NC_015381	AGCGC	2	10	147438	147447	20 %	0 %	40 %	40 %	330815080
153	NC_015381	GGGGC	2	10	147702	147711	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015381	GCGGG	2	10	147941	147950	0 %	0 %	80 %	20 %	330815081
155	NC_015381	GCCGC	2	10	148301	148310	0 %	0 %	40 %	60 %	330815081
156	NC_015381	CACGC	2	10	148415	148424	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
157	NC_015381	AGGGC	2	10	150036	150045	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
158	NC_015381	CGCGC	2	10	150211	150220	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
159	NC_015381	GCGCC	2	10	150897	150906	0 %	0 %	40 %	60 %	330815085
160	NC_015381	GGCGC	2	10	151239	151248	0 %	0 %	60 %	40 %	330815085
161	NC_015381	GCCGC	2	10	152706	152715	0 %	0 %	40 %	60 %	330815087
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165	NC_015381	AGCGA	2	10	159815	159824	40 %	0 %	40 %	20 %	330815093
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172	NC_015381	CGGCG	2	10	166606	166615	0 %	0 %	60 %	40 %	330815105
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174	NC_015381	CGGGG	2	10	168044	168053	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_015381	GCTGG	2	10	179579	179588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_015381	GGCGA	2	10	181228	181237	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
183	NC_015381	CCAAG	2	10	181716	181725	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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187	NC_015381	TGGCC	2	10	183962	183971	0 %	20 %	40 %	40 %	330815113
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191	NC_015381	GCGCC	2	10	186049	186058	0 %	0 %	40 %	60 %	330815115
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198	NC_015381	CTGGT	2	10	190166	190175	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_015381	GCTCG	2	10	190233	190242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
200	NC_015381	TGCCG	2	10	190247	190256	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
201	NC_015381	GGCGG	2	10	190531	190540	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
202	NC_015381	ATCGA	2	10	191022	191031	40 %	20 %	20 %	20 %	330815120
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205	NC_015381	GCCTC	2	10	192488	192497	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
206	NC_015381	TGCCC	2	10	193554	193563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
207	NC_015381	CGAAC	2	10	194885	194894	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
208	NC_015381	CGACC	2	10	194945	194954	20 %	0 %	20 %	60 %	330815124
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222	NC_015381	GCCGC	2	10	213036	213045	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
223	NC_015381	GACGC	2	10	213392	213401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
224	NC_015381	AATCC	2	10	213423	213432	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
225	NC_015381	CGGAA	2	10	213577	213586	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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245	NC_015381	CCGGC	2	10	228519	228528	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
246	NC_015381	CCTCG	2	10	229173	229182	0 %	20 %	20 %	60 %	330815156
247	NC_015381	CGGCG	2	10	230775	230784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
248	NC_015381	CGCGG	2	10	230810	230819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
249	NC_015381	GCGCT	2	10	232486	232495	0 %	20 %	40 %	40 %	330815159
250	NC_015381	GCCGA	2	10	232744	232753	20 %	0 %	40 %	40 %	330815159
251	NC_015381	CGCCC	2	10	233903	233912	0 %	0 %	20 %	80 %	330815160
252	NC_015381	GACGC	2	10	234436	234445	20 %	0 %	40 %	40 %	330815160
253	NC_015381	GCCGC	2	10	235208	235217	0 %	0 %	40 %	60 %	330815161
254	NC_015381	CGCGC	2	10	235628	235637	0 %	0 %	40 %	60 %	330815161
255	NC_015381	CGCGG	2	10	236456	236465	0 %	0 %	60 %	40 %	330815161
256	NC_015381	CGGCC	2	10	236831	236840	0 %	0 %	40 %	60 %	330815162
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258	NC_015381	CGATC	2	10	239512	239521	20 %	20 %	20 %	40 %	330815164
259	NC_015381	TCGTG	2	10	240527	240536	0 %	40 %	40 %	20 %	330815165
260	NC_015381	CGATG	2	10	245004	245013	20 %	20 %	40 %	20 %	330815169
261	NC_015381	TTCGA	2	10	245098	245107	20 %	40 %	20 %	20 %	330815169
262	NC_015381	CTTTT	2	10	245238	245247	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_015381	GCGCA	2	10	246988	246997	20 %	0 %	40 %	40 %	330815171
264	NC_015381	AATTG	2	10	247608	247617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015381	GGTCG	2	10	248026	248035	0 %	20 %	60 %	20 %	330815172
266	NC_015381	TCGCT	2	10	248614	248623	0 %	40 %	20 %	40 %	330815173
267	NC_015381	GGCGC	2	10	253968	253977	0 %	0 %	60 %	40 %	330815179
268	NC_015381	CGGCG	2	10	255147	255156	0 %	0 %	60 %	40 %	330815181
269	NC_015381	TTCCG	2	10	257010	257019	0 %	40 %	20 %	40 %	330815183
270	NC_015381	GTGAA	2	10	259549	259558	40 %	20 %	40 %	0 %	330815183
271	NC_015381	TCGAT	2	10	260997	261006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NC_015381	CCTCT	2	10	263432	263441	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
273	NC_015381	GGGCG	2	10	263709	263718	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_015381	GCCGG	2	10	298172	298181	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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321	NC_015381	TGCCT	2	10	331105	331114	0 %	40 %	20 %	40 %	330815232
322	NC_015381	CGTTC	2	10	332603	332612	0 %	40 %	20 %	40 %	330815232
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372	NC_015381	CGGCG	2	10	394854	394863	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
373	NC_015381	CGTTT	2	10	394865	394874	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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389	NC_015381	TGCGC	2	10	413531	413540	0 %	20 %	40 %	40 %	330815310
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391	NC_015381	CCGAG	2	10	413995	414004	20 %	0 %	40 %	40 %	330815310
392	NC_015381	CGCGC	2	10	414523	414532	0 %	0 %	40 %	60 %	330815311
393	NC_015381	CGGCG	2	10	416216	416225	0 %	0 %	60 %	40 %	330815313
394	NC_015381	CCGCC	2	10	417460	417469	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
395	NC_015381	ATCGC	2	10	418180	418189	20 %	20 %	20 %	40 %	330815316
396	NC_015381	TCGGC	2	10	418932	418941	0 %	20 %	40 %	40 %	330815317
397	NC_015381	ACGCG	2	10	419556	419565	20 %	0 %	40 %	40 %	330815319
398	NC_015381	CGGAA	2	10	421570	421579	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
399	NC_015381	GCGCG	2	10	422520	422529	0 %	0 %	60 %	40 %	330815321
400	NC_015381	CGATG	2	10	423158	423167	20 %	20 %	40 %	20 %	330815322
401	NC_015381	CGGCT	2	10	423741	423750	0 %	20 %	40 %	40 %	330815322
402	NC_015381	GCCGA	2	10	425374	425383	20 %	0 %	40 %	40 %	330815324
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