MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015380	TTAA	2	8	40	47	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015380	ATTT	2	8	8505	8512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015380	TTTC	2	8	10510	10517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015380	TTAA	2	8	10583	10590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015380	TTAA	2	8	10597	10604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015380	TAGT	2	8	12093	12100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015380	TAAT	2	8	12220	12227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015380	TTTA	2	8	12290	12297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015380	TTAA	2	8	12329	12336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015380	AATC	2	8	13426	13433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015380	AGGT	2	8	22167	22174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015380	GAAA	2	8	22296	22303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015380	CAAC	2	8	22466	22473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015380	ATAA	2	8	26889	26896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015380	TTAA	2	8	29274	29281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015380	AACA	2	8	34831	34838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015380	ATTA	2	8	52658	52665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015380	TAAA	2	8	52770	52777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015380	TTAT	3	12	53293	53304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015380	TTTG	2	8	58262	58269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015380	AAGA	2	8	62926	62933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015380	GAAT	2	8	70834	70841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015380	TTTA	2	8	76439	76446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015380	TTAA	2	8	76456	76463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015380	TAAA	2	8	76490	76497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015380	ATAC	2	8	98560	98567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015380	CAAA	2	8	98633	98640	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015380	ATTT	2	8	102340	102347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015380	AAAT	2	8	102478	102485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015380	TAAT	2	8	102557	102564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015380	TAAT	2	8	106163	106170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015380	GGCT	2	8	106816	106823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015380	GTCT	2	8	108096	108103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015380	TCGC	2	8	108777	108784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015380	AAAT	2	8	109109	109116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015380	GTAA	2	8	109385	109392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015380	AGGT	2	8	109728	109735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015380	TACC	2	8	109776	109783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015380	AAGA	2	8	111155	111162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015380	TAAA	2	8	117483	117490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015380	AATT	2	8	124699	124706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015380	TAAA	2	8	124743	124750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015380	TATT	2	8	145064	145071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015380	TTTA	2	8	163568	163575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015380	TTAA	2	8	163590	163597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015380	TTAA	2	8	171731	171738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015380	GACC	2	8	179135	179142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015380	TCTG	2	8	186127	186134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015380	GTAT	2	8	201224	201231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015380	TAAT	2	8	201363	201370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015380	TGTA	2	8	216141	216148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015380	AGGA	2	8	216372	216379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015380	CTTT	2	8	219814	219821	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015380	ATAA	2	8	227840	227847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015380	TTAA	2	8	231720	231727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015380	TGAA	2	8	234521	234528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015380	ACCA	2	8	234582	234589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015380	TGAA	2	8	239788	239795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015380	AAAC	2	8	244876	244883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015380	CAAA	2	8	245003	245010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015380	ATAA	2	8	248273	248280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015380	ATAG	2	8	248323	248330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015380	TATT	2	8	250721	250728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015380	ATTT	2	8	255070	255077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015380	GTTT	2	8	256870	256877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015380	TAAA	2	8	264527	264534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015380	ATTT	2	8	268258	268265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015380	TTTA	2	8	272186	272193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015380	ATCT	2	8	276511	276518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015380	AAAG	2	8	285711	285718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015380	TAAC	2	8	285881	285888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015380	TAAA	2	8	288406	288413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015380	CAAT	2	8	327069	327076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015380	ATAA	2	8	339217	339224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015380	TAAA	2	8	339378	339385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015380	AACC	2	8	339420	339427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015380	CTAT	2	8	339474	339481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015380	AAAT	2	8	339484	339491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015380	TTTG	2	8	346596	346603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015380	AGTT	2	8	349286	349293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015380	TTAA	2	8	359272	359279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015380	AACT	2	8	359346	359353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015380	TAGA	2	8	363723	363730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015380	TTTA	2	8	366734	366741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015380	TATT	2	8	366797	366804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015380	GGTT	2	8	385572	385579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015380	TCCT	2	8	385825	385832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015380	CATC	2	8	385873	385880	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015380	TTAA	2	8	392319	392326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015380	ATTA	2	8	392378	392385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015380	ATTA	3	12	393177	393188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015380	GAAA	2	8	393729	393736	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015380	TATT	2	8	412257	412264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015380	ATCA	2	8	423163	423170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015380	CTTT	2	8	426415	426422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015380	TTAA	2	8	428919	428926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015380	ACAA	2	8	437668	437675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015380	CAAG	2	8	437803	437810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015380	ATTA	2	8	439318	439325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015380	TCGC	2	8	454617	454624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015380	CAAT	2	8	454679	454686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015380	GATA	2	8	460969	460976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015380	TTAT	2	8	466058	466065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015380	GAAG	2	8	467207	467214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015380	TATT	2	8	467222	467229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015380	AATC	2	8	470563	470570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015380	TTTA	2	8	473660	473667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015380	AATA	2	8	476339	476346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015380	GAAA	2	8	478649	478656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015380	TTTA	2	8	496314	496321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015380	AATT	2	8	496700	496707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015380	TAAT	2	8	496716	496723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015380	TTAG	2	8	497890	497897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015380	CATA	2	8	501769	501776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015380	TTAA	2	8	502047	502054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015380	TGGT	2	8	502073	502080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015380	AAAT	2	8	502151	502158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015380	AAAT	2	8	502491	502498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015380	AAAG	2	8	502704	502711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015380	TTTA	2	8	502753	502760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015380	TTAA	2	8	504970	504977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015380	ACAA	2	8	504978	504985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015380	TAAC	2	8	505038	505045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015380	ATTT	2	8	505171	505178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015380	AAAT	2	8	505253	505260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015380	AAAC	2	8	505370	505377	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015380	TTAA	2	8	505378	505385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015380	TAAA	2	8	505820	505827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015380	TGGA	2	8	505852	505859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015380	ATAC	2	8	507277	507284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015380	AAAT	2	8	507370	507377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015380	TAAA	2	8	525763	525770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015380	TTTA	2	8	525908	525915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015380	ATTC	2	8	530099	530106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015380	TATT	2	8	530197	530204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015380	TTTA	2	8	530250	530257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015380	TAAA	2	8	530281	530288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015380	GGAA	2	8	564969	564976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015380	AAAT	2	8	565262	565269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015380	TTTG	2	8	565369	565376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015380	TTAA	2	8	569923	569930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015380	AGAA	2	8	591318	591325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015380	CTAT	2	8	600895	600902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015380	CTTA	2	8	602006	602013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015380	AATA	2	8	618831	618838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015380	CAAA	2	8	619110	619117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015380	AATT	2	8	649391	649398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015380	CAAG	2	8	655516	655523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015380	AATT	2	8	662096	662103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015380	GTTG	2	8	662630	662637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015380	GTTG	2	8	662898	662905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015380	ATTT	2	8	685674	685681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.