MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 16687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015380	CTT	2	6	56	61	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015380	GCT	2	6	259	264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015380	TCT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015380	GTG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015380	ATA	2	6	388	393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015380	TAA	2	6	421	426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015380	TAT	2	6	464	469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015380	AAT	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812976
9	NC_015380	CAT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812976
10	NC_015380	CTT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812976
11	NC_015380	GAT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812976
12	NC_015380	CAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812976
13	NC_015380	CCA	2	6	931	936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812976
14	NC_015380	AGT	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812976
15	NC_015380	TCC	3	9	1011	1019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812976
16	NC_015380	CTC	3	9	1097	1105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812976
17	NC_015380	GCA	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812976
18	NC_015380	AGA	2	6	1380	1385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812976
19	NC_015380	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812976
20	NC_015380	TGT	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812977
21	NC_015380	TAA	2	6	1636	1641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
22	NC_015380	ATT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812977
23	NC_015380	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812977
24	NC_015380	AAT	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
25	NC_015380	TTC	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812977
26	NC_015380	TAA	2	6	1853	1858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
27	NC_015380	CAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812977
28	NC_015380	TAA	2	6	2038	2043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
29	NC_015380	TCT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812977
30	NC_015380	ATC	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812978
31	NC_015380	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812978
32	NC_015380	TTA	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812978
33	NC_015380	AAT	2	6	2361	2366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812978
34	NC_015380	CCA	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812978
35	NC_015380	TGT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812978
36	NC_015380	GTA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812978
37	NC_015380	ATC	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812978
38	NC_015380	CCA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812978
39	NC_015380	AAC	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812978
40	NC_015380	AGA	2	6	2926	2931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812978
41	NC_015380	TCA	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812978
42	NC_015380	TCT	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812978
43	NC_015380	TAA	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812978
44	NC_015380	CTC	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812978
45	NC_015380	TTG	2	6	3275	3280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812978
46	NC_015380	CTC	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812978
47	NC_015380	TGA	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812978
48	NC_015380	AAT	2	6	3933	3938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
49	NC_015380	AAT	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
50	NC_015380	AAT	2	6	4100	4105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
51	NC_015380	TAA	2	6	4198	4203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
52	NC_015380	TAA	2	6	4246	4251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
53	NC_015380	CTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812979
54	NC_015380	ATG	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812979
55	NC_015380	ATT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812979
56	NC_015380	ATT	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812980
57	NC_015380	CAA	2	6	4844	4849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812980
58	NC_015380	TAA	2	6	4881	4886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
59	NC_015380	AAT	3	9	4971	4979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
60	NC_015380	AAC	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812980
61	NC_015380	AGT	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812980
62	NC_015380	TAA	2	6	5121	5126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
63	NC_015380	TCT	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812980
64	NC_015380	TCT	2	6	5188	5193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812980
65	NC_015380	ACT	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812980
66	NC_015380	AAT	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
67	NC_015380	CTT	2	6	5450	5455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812980
68	NC_015380	GTT	2	6	5504	5509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
69	NC_015380	CCT	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812980
70	NC_015380	ACT	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812980
71	NC_015380	CTG	2	6	5723	5728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812980
72	NC_015380	ACC	2	6	5736	5741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812980
73	NC_015380	GTT	2	6	5949	5954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
74	NC_015380	TGT	2	6	6031	6036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
75	NC_015380	TGG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812980
76	NC_015380	TGT	2	6	6100	6105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
77	NC_015380	CTA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812980
78	NC_015380	AAT	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
79	NC_015380	TAA	2	6	6323	6328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812981
80	NC_015380	TAA	2	6	6333	6338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812981
81	NC_015380	AAT	2	6	6433	6438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812981
82	NC_015380	ATA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
83	NC_015380	CAC	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812982
84	NC_015380	CTT	2	6	6737	6742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812982
85	NC_015380	TTC	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812982
86	NC_015380	TTG	2	6	6852	6857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812982
87	NC_015380	AAT	2	6	6888	6893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
88	NC_015380	TTC	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812982
89	NC_015380	TAA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
90	NC_015380	AAT	2	6	7143	7148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
91	NC_015380	TTC	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812982
92	NC_015380	AAT	2	6	7272	7277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
93	NC_015380	TTG	2	6	7281	7286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812982
94	NC_015380	TCG	2	6	7307	7312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812982
95	NC_015380	TAA	2	6	7319	7324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
96	NC_015380	ATA	2	6	7339	7344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812982
97	NC_015380	ATT	2	6	7375	7380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812982
98	NC_015380	TAA	2	6	7456	7461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812983
99	NC_015380	ACT	2	6	7590	7595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812983
100	NC_015380	CAT	2	6	7660	7665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812983
101	NC_015380	AGC	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812983
102	NC_015380	CTT	2	6	7744	7749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812983
103	NC_015380	ACT	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812983
104	NC_015380	TCT	2	6	7938	7943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812983
105	NC_015380	TCT	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812983
106	NC_015380	AAT	2	6	8292	8297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812983
107	NC_015380	CTC	2	6	8329	8334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812983
108	NC_015380	ATC	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812983
109	NC_015380	CCA	2	6	8403	8408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812983
110	NC_015380	ATT	2	6	8661	8666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812984
111	NC_015380	CCA	2	6	8701	8706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812984
112	NC_015380	TCA	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812984
113	NC_015380	CAC	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812984
114	NC_015380	CCT	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812984
115	NC_015380	AGT	2	6	9062	9067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812984
116	NC_015380	ATT	2	6	9153	9158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812984
117	NC_015380	GAT	2	6	9183	9188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812984
118	NC_015380	TTC	2	6	9457	9462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812985
119	NC_015380	GCT	2	6	9527	9532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812985
120	NC_015380	TCA	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812985
121	NC_015380	GTT	2	6	9918	9923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812985
122	NC_015380	ATC	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812985
123	NC_015380	CAT	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812985
124	NC_015380	TTG	2	6	10315	10320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812985
125	NC_015380	TAT	2	6	10373	10378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015380	TAA	2	6	10418	10423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015380	CCA	2	6	10457	10462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015380	TGC	2	6	10577	10582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015380	TAT	2	6	10819	10824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812986
130	NC_015380	CCA	2	6	10838	10843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812986
131	NC_015380	TAA	2	6	11002	11007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812986
132	NC_015380	CAA	2	6	11062	11067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812986
133	NC_015380	ATT	2	6	11099	11104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812986
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143	NC_015380	TAA	2	6	11932	11937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_015380	AAT	2	6	12391	12396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015380	GCA	2	6	12520	12525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812987
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159	NC_015380	ATT	2	6	13327	13332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_015380	TCA	2	6	21279	21284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812999
260	NC_015380	TTA	2	6	21461	21466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812999
261	NC_015380	ATA	2	6	21742	21747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812999
262	NC_015380	GAT	2	6	21788	21793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812999
263	NC_015380	AAT	2	6	21862	21867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812999
264	NC_015380	ATT	3	9	21868	21876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812999
265	NC_015380	ATA	2	6	21944	21949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812999
266	NC_015380	CTA	2	6	22260	22265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_015380	GAA	2	6	22337	22342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015380	TGG	2	6	22492	22497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_015380	TGG	2	6	22501	22506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015380	TAT	2	6	22634	22639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813000
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333	NC_015380	AAT	2	6	26704	26709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_015380	TTA	2	6	26785	26790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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