MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	AGAGGC	2	12	3228	3239	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330818811
2	NC_015378	GCGTGA	2	12	17244	17255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330818824
3	NC_015378	TCACCG	2	12	17553	17564	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330818824
4	NC_015378	ACCTCA	2	12	18675	18686	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330818824
5	NC_015378	CACGTA	2	12	19291	19302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330818824
6	NC_015378	CGGTCT	2	12	21508	21519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818825
7	NC_015378	CGGTCA	2	12	23513	23524	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330818826
8	NC_015378	CAAATT	2	12	29935	29946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	330818831
9	NC_015378	TCGCGA	2	12	31959	31970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330818834
10	NC_015378	GCGTTT	2	12	32245	32256	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330818835
11	NC_015378	AACACA	2	12	37858	37869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818840
12	NC_015378	TCGCGC	2	12	45776	45787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330818847
13	NC_015378	ACGCGA	2	12	52598	52609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818851
14	NC_015378	CTCGGC	2	12	54189	54200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015378	CGGTGA	2	12	55767	55778	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330818854
16	NC_015378	GTCCTT	2	12	67778	67789	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015378	GATACG	2	12	70236	70247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330818860
18	NC_015378	CTGGAT	2	12	70614	70625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330818861
19	NC_015378	GCGTCG	2	12	72833	72844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330818861
20	NC_015378	ACTGAC	2	12	73176	73187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330818861
21	NC_015378	CCCAGC	2	12	76090	76101	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330818864
22	NC_015378	CGAGCG	2	12	76897	76908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015378	TCGACT	2	12	81403	81414	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330818868
24	NC_015378	GCGCTT	2	12	82635	82646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818868
25	NC_015378	GTAGAT	2	12	82883	82894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818869
26	NC_015378	TGGCCG	3	18	83611	83628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330818869
27	NC_015378	CGGCTT	2	12	84181	84192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818870
28	NC_015378	GCAGGC	2	12	84730	84741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330818870
29	NC_015378	TTCGTT	2	12	91936	91947	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330818878
30	NC_015378	GGCGTA	2	12	101638	101649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330818883
31	NC_015378	GATCCG	2	12	116337	116348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330818898
32	NC_015378	TCAGCG	2	12	118865	118876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015378	CGGCTG	2	12	120960	120971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.