MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	GTGCT	2	10	5311	5320	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015378	GACGA	2	10	6246	6255	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015378	GAAAT	2	10	15166	15175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015378	CCATT	2	10	24972	24981	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015378	AGGCC	2	10	26447	26456	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015378	GGGCT	2	10	28007	28016	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015378	CGGGC	2	10	28029	28038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015378	GCGCC	3	15	28361	28375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015378	GCCGA	2	10	34844	34853	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015378	TTGGC	2	10	42834	42843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015378	CGTGC	2	10	43915	43924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015378	CTTTC	2	10	49844	49853	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015378	GGTTG	2	10	50211	50220	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015378	TCCGA	2	10	51425	51434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015378	ACCGC	2	10	53905	53914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_015378	TTCGC	2	10	55582	55591	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015378	CCCGC	2	10	55599	55608	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_015378	ATCAC	2	10	59130	59139	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015378	GTCGC	2	10	60670	60679	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015378	GTGAT	2	10	62351	62360	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015378	GCGTT	2	10	62643	62652	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015378	GGGGT	2	10	63252	63261	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015378	GAAAT	2	10	79677	79686	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015378	AAAAG	2	10	100780	100789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015378	ACTGA	2	10	104747	104756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015378	TGCGC	2	10	107793	107802	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015378	GCTCA	2	10	121970	121979	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015378	GCCAA	2	10	122561	122570	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015378	GCCGG	2	10	123183	123192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015378	CAATC	2	10	123549	123558	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015378	AGGCG	2	10	124874	124883	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015378	TGCAG	2	10	125015	125024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015378	TCAAT	2	10	128579	128588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.