MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	GACG	2	8	609	616	25 %	0 %	50 %	25 %	330818809
2	NC_015378	AACA	2	8	748	755	75 %	0 %	0 %	25 %	330818809
3	NC_015378	TCGC	2	8	853	860	0 %	25 %	25 %	50 %	330818809
4	NC_015378	TCGA	2	8	1967	1974	25 %	25 %	25 %	25 %	330818810
5	NC_015378	CAAG	2	8	2166	2173	50 %	0 %	25 %	25 %	330818810
6	NC_015378	CCGG	2	8	2204	2211	0 %	0 %	50 %	50 %	330818810
7	NC_015378	TCGC	2	8	2317	2324	0 %	25 %	25 %	50 %	330818810
8	NC_015378	ATGC	2	8	2630	2637	25 %	25 %	25 %	25 %	330818811
9	NC_015378	ATGG	2	8	2674	2681	25 %	25 %	50 %	0 %	330818811
10	NC_015378	TCCC	2	8	2721	2728	0 %	25 %	0 %	75 %	330818811
11	NC_015378	TGCG	2	8	2774	2781	0 %	25 %	50 %	25 %	330818811
12	NC_015378	ACGG	2	8	3552	3559	25 %	0 %	50 %	25 %	330818811
13	NC_015378	GAGC	2	8	3607	3614	25 %	0 %	50 %	25 %	330818811
14	NC_015378	TGGC	2	8	3745	3752	0 %	25 %	50 %	25 %	330818811
15	NC_015378	CGAT	2	8	3790	3797	25 %	25 %	25 %	25 %	330818811
16	NC_015378	CTGG	2	8	4722	4729	0 %	25 %	50 %	25 %	330818812
17	NC_015378	GCTG	2	8	4784	4791	0 %	25 %	50 %	25 %	330818812
18	NC_015378	GGCC	2	8	4858	4865	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
19	NC_015378	GATC	2	8	5011	5018	25 %	25 %	25 %	25 %	330818812
20	NC_015378	CAGC	2	8	5281	5288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015378	GGCC	2	8	5350	5357	0 %	0 %	50 %	50 %	330818813
22	NC_015378	GGAT	2	8	5913	5920	25 %	25 %	50 %	0 %	330818813
23	NC_015378	GAGC	2	8	6350	6357	25 %	0 %	50 %	25 %	330818814
24	NC_015378	GGAC	2	8	6568	6575	25 %	0 %	50 %	25 %	330818815
25	NC_015378	CGGG	2	8	6683	6690	0 %	0 %	75 %	25 %	330818815
26	NC_015378	TACG	2	8	6721	6728	25 %	25 %	25 %	25 %	330818815
27	NC_015378	GCAA	2	8	6938	6945	50 %	0 %	25 %	25 %	330818815
28	NC_015378	CAGC	2	8	6950	6957	25 %	0 %	25 %	50 %	330818815
29	NC_015378	GGCC	2	8	7856	7863	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
30	NC_015378	GTCG	2	8	8337	8344	0 %	25 %	50 %	25 %	330818817
31	NC_015378	CCAG	2	8	8579	8586	25 %	0 %	25 %	50 %	330818817
32	NC_015378	GTCG	2	8	8952	8959	0 %	25 %	50 %	25 %	330818818
33	NC_015378	AGGT	2	8	9002	9009	25 %	25 %	50 %	0 %	330818818
34	NC_015378	GAGC	2	8	9527	9534	25 %	0 %	50 %	25 %	330818819
35	NC_015378	GTGG	2	8	9653	9660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015378	TGCG	2	8	9664	9671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015378	CGCA	2	8	9691	9698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015378	AGCC	2	8	10411	10418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015378	GTTA	2	8	11920	11927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015378	TCGA	2	8	12617	12624	25 %	25 %	25 %	25 %	330818821
41	NC_015378	GCCC	2	8	12968	12975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_015378	CCGC	2	8	13133	13140	0 %	0 %	25 %	75 %	330818822
43	NC_015378	GTGC	2	8	13190	13197	0 %	25 %	50 %	25 %	330818822
44	NC_015378	CGTC	2	8	13278	13285	0 %	25 %	25 %	50 %	330818822
45	NC_015378	CGTT	2	8	13401	13408	0 %	50 %	25 %	25 %	330818822
46	NC_015378	CACG	2	8	13826	13833	25 %	0 %	25 %	50 %	330818822
47	NC_015378	GGTC	2	8	13902	13909	0 %	25 %	50 %	25 %	330818822
48	NC_015378	GTTT	2	8	13985	13992	0 %	75 %	25 %	0 %	330818822
49	NC_015378	TTCG	2	8	14364	14371	0 %	50 %	25 %	25 %	330818823
50	NC_015378	CGAT	2	8	14672	14679	25 %	25 %	25 %	25 %	330818823
51	NC_015378	ACGG	2	8	14851	14858	25 %	0 %	50 %	25 %	330818823
52	NC_015378	CGTC	2	8	14867	14874	0 %	25 %	25 %	50 %	330818823
53	NC_015378	CGCC	2	8	15750	15757	0 %	0 %	25 %	75 %	330818824
54	NC_015378	CGGT	2	8	16107	16114	0 %	25 %	50 %	25 %	330818824
55	NC_015378	TCAA	2	8	17031	17038	50 %	25 %	0 %	25 %	330818824
56	NC_015378	TCGC	2	8	17655	17662	0 %	25 %	25 %	50 %	330818824
57	NC_015378	GTCG	2	8	17788	17795	0 %	25 %	50 %	25 %	330818824
58	NC_015378	TGCA	2	8	18246	18253	25 %	25 %	25 %	25 %	330818824
59	NC_015378	CGGC	2	8	18330	18337	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
60	NC_015378	TTCC	2	8	18395	18402	0 %	50 %	0 %	50 %	330818824
61	NC_015378	GACC	2	8	18523	18530	25 %	0 %	25 %	50 %	330818824
62	NC_015378	GCAA	2	8	19102	19109	50 %	0 %	25 %	25 %	330818824
63	NC_015378	CAAT	2	8	19149	19156	50 %	25 %	0 %	25 %	330818824
64	NC_015378	GTTT	2	8	19204	19211	0 %	75 %	25 %	0 %	330818824
65	NC_015378	CGAC	2	8	19212	19219	25 %	0 %	25 %	50 %	330818824
66	NC_015378	CGTC	2	8	19268	19275	0 %	25 %	25 %	50 %	330818824
67	NC_015378	CGGC	2	8	19548	19555	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
68	NC_015378	GTAC	2	8	19610	19617	25 %	25 %	25 %	25 %	330818824
69	NC_015378	CGAC	2	8	20700	20707	25 %	0 %	25 %	50 %	330818824
70	NC_015378	GCAC	2	8	21240	21247	25 %	0 %	25 %	50 %	330818825
71	NC_015378	AGCC	2	8	21643	21650	25 %	0 %	25 %	50 %	330818825
72	NC_015378	CGGC	2	8	22178	22185	0 %	0 %	50 %	50 %	330818825
73	NC_015378	CGCA	2	8	22546	22553	25 %	0 %	25 %	50 %	330818825
74	NC_015378	GACC	2	8	23162	23169	25 %	0 %	25 %	50 %	330818826
75	NC_015378	GATC	2	8	23327	23334	25 %	25 %	25 %	25 %	330818826
76	NC_015378	TCGG	2	8	23409	23416	0 %	25 %	50 %	25 %	330818826
77	NC_015378	AGCG	2	8	24191	24198	25 %	0 %	50 %	25 %	330818826
78	NC_015378	ACGT	2	8	24409	24416	25 %	25 %	25 %	25 %	330818826
79	NC_015378	CCCG	2	8	24661	24668	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_015378	GCAT	2	8	24737	24744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015378	ACGA	2	8	24835	24842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015378	GCAG	2	8	25134	25141	25 %	0 %	50 %	25 %	330818827
83	NC_015378	TCGG	2	8	25298	25305	0 %	25 %	50 %	25 %	330818827
84	NC_015378	TCGC	2	8	25400	25407	0 %	25 %	25 %	50 %	330818827
85	NC_015378	TCGA	2	8	25696	25703	25 %	25 %	25 %	25 %	330818827
86	NC_015378	ACGG	2	8	25817	25824	25 %	0 %	50 %	25 %	330818827
87	NC_015378	ACTC	2	8	26511	26518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015378	GTCG	2	8	26831	26838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015378	CCCG	2	8	27517	27524	0 %	0 %	25 %	75 %	330818828
90	NC_015378	TCAG	2	8	27714	27721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015378	TGAA	2	8	27889	27896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015378	TTGC	2	8	28855	28862	0 %	50 %	25 %	25 %	330818830
93	NC_015378	TCGA	2	8	29628	29635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015378	GTAG	2	8	29654	29661	25 %	25 %	50 %	0 %	330818831
95	NC_015378	CGAA	2	8	29991	29998	50 %	0 %	25 %	25 %	330818831
96	NC_015378	CGGT	2	8	30027	30034	0 %	25 %	50 %	25 %	330818831
97	NC_015378	TTCG	2	8	30073	30080	0 %	50 %	25 %	25 %	330818831
98	NC_015378	AATC	2	8	30322	30329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015378	GGCC	2	8	30330	30337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015378	CATA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	330818833
101	NC_015378	CCGG	2	8	31155	31162	0 %	0 %	50 %	50 %	330818833
102	NC_015378	GCGA	2	8	31292	31299	25 %	0 %	50 %	25 %	330818833
103	NC_015378	CGTC	2	8	31613	31620	0 %	25 %	25 %	50 %	330818834
104	NC_015378	CCTG	2	8	31813	31820	0 %	25 %	25 %	50 %	330818834
105	NC_015378	ATCA	2	8	32054	32061	50 %	25 %	0 %	25 %	330818834
106	NC_015378	ACGC	2	8	32172	32179	25 %	0 %	25 %	50 %	330818835
107	NC_015378	TGGG	2	8	32756	32763	0 %	25 %	75 %	0 %	330818836
108	NC_015378	CTAA	2	8	33874	33881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015378	CGCC	2	8	33966	33973	0 %	0 %	25 %	75 %	330818837
110	NC_015378	GTTG	2	8	34443	34450	0 %	50 %	50 %	0 %	330818837
111	NC_015378	GCCT	2	8	34523	34530	0 %	25 %	25 %	50 %	330818837
112	NC_015378	GGCT	2	8	34905	34912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015378	TGCG	2	8	36131	36138	0 %	25 %	50 %	25 %	330818839
114	NC_015378	TTCG	2	8	36276	36283	0 %	50 %	25 %	25 %	330818839
115	NC_015378	TCGC	2	8	36351	36358	0 %	25 %	25 %	50 %	330818839
116	NC_015378	CAGC	2	8	36616	36623	25 %	0 %	25 %	50 %	330818839
117	NC_015378	TTGC	2	8	36741	36748	0 %	50 %	25 %	25 %	330818839
118	NC_015378	CGCA	2	8	37668	37675	25 %	0 %	25 %	50 %	330818840
119	NC_015378	ATCG	2	8	37923	37930	25 %	25 %	25 %	25 %	330818840
120	NC_015378	GCAG	2	8	38052	38059	25 %	0 %	50 %	25 %	330818841
121	NC_015378	TGAT	2	8	38862	38869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015378	ACCT	2	8	38983	38990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015378	TGAC	2	8	39054	39061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015378	GATC	2	8	39618	39625	25 %	25 %	25 %	25 %	330818843
125	NC_015378	ATCG	2	8	39871	39878	25 %	25 %	25 %	25 %	330818843
126	NC_015378	CGGC	2	8	39995	40002	0 %	0 %	50 %	50 %	330818843
127	NC_015378	AGTC	2	8	40219	40226	25 %	25 %	25 %	25 %	330818843
128	NC_015378	GCTG	2	8	40820	40827	0 %	25 %	50 %	25 %	330818844
129	NC_015378	GCTC	2	8	41356	41363	0 %	25 %	25 %	50 %	330818845
130	NC_015378	ACGA	2	8	41630	41637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015378	GATT	2	8	42101	42108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015378	TCGC	2	8	42732	42739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015378	CGTG	2	8	43786	43793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015378	ACCC	2	8	44134	44141	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_015378	GCCG	2	8	44209	44216	0 %	0 %	50 %	50 %	330818847
136	NC_015378	GCGG	2	8	44489	44496	0 %	0 %	75 %	25 %	330818847
137	NC_015378	CAGC	2	8	44982	44989	25 %	0 %	25 %	50 %	330818847
138	NC_015378	CGAC	2	8	45129	45136	25 %	0 %	25 %	50 %	330818847
139	NC_015378	ATCC	2	8	46338	46345	25 %	25 %	0 %	50 %	330818847
140	NC_015378	GAAT	2	8	46686	46693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015378	CGAA	2	8	47182	47189	50 %	0 %	25 %	25 %	330818848
142	NC_015378	CGGC	2	8	47467	47474	0 %	0 %	50 %	50 %	330818848
143	NC_015378	CGAA	2	8	47497	47504	50 %	0 %	25 %	25 %	330818848
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261	NC_015378	CGGA	2	8	97692	97699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_015378	CGGT	2	8	97714	97721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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275	NC_015378	GCGA	2	8	101185	101192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.