MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	CAGC	2	8	5281	5288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015378	GTGG	2	8	9653	9660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015378	TGCG	2	8	9664	9671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015378	CGCA	2	8	9691	9698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015378	AGCC	2	8	10411	10418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015378	GTTA	2	8	11920	11927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015378	GCCC	2	8	12968	12975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_015378	CCCG	2	8	24661	24668	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_015378	GCAT	2	8	24737	24744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015378	ACGA	2	8	24835	24842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015378	ACTC	2	8	26511	26518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015378	GTCG	2	8	26831	26838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015378	TCAG	2	8	27714	27721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015378	TGAA	2	8	27889	27896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015378	TCGA	2	8	29628	29635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015378	AATC	2	8	30322	30329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015378	GGCC	2	8	30330	30337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015378	CTAA	2	8	33874	33881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015378	GGCT	2	8	34905	34912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015378	TGAT	2	8	38862	38869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015378	ACCT	2	8	38983	38990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015378	TGAC	2	8	39054	39061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015378	ACGA	2	8	41630	41637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015378	GATT	2	8	42101	42108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015378	TCGC	2	8	42732	42739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015378	CGTG	2	8	43786	43793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015378	ACCC	2	8	44134	44141	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015378	GAAT	2	8	46686	46693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015378	GACC	2	8	48041	48048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015378	CCTG	2	8	49305	49312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015378	CCGG	2	8	49340	49347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015378	ACGC	2	8	49352	49359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015378	CGCC	2	8	49810	49817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015378	GTTT	2	8	53774	53781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015378	TGAA	2	8	55556	55563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015378	TCAC	2	8	58716	58723	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015378	CGGG	2	8	59143	59150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015378	TGCG	2	8	59393	59400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015378	AAAG	2	8	59457	59464	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015378	CATG	2	8	59718	59725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015378	GCGT	2	8	60410	60417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015378	TCGA	2	8	60722	60729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015378	TCGA	2	8	66954	66961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015378	GCAG	2	8	66984	66991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015378	TGCG	2	8	67473	67480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015378	TGTA	2	8	70512	70519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015378	GGCG	2	8	76859	76866	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015378	TTCG	2	8	77084	77091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015378	CGAA	2	8	79577	79584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015378	CGCA	2	8	86109	86116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015378	TGCG	2	8	86171	86178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015378	GCAG	2	8	90437	90444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015378	ACTT	2	8	97404	97411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015378	CGGA	2	8	97611	97618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015378	CGGA	2	8	97692	97699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015378	CGGT	2	8	97714	97721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015378	TTCA	2	8	97829	97836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015378	TGGA	2	8	97966	97973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015378	CTCG	2	8	98459	98466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015378	GCAG	2	8	99745	99752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015378	TCGC	2	8	100260	100267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015378	GCAG	2	8	100322	100329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015378	AGCC	2	8	100759	100766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015378	GACG	2	8	101174	101181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015378	GCGA	2	8	101185	101192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015378	CGAG	2	8	101224	101231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015378	CGGG	2	8	101459	101466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015378	CGAA	2	8	102158	102165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015378	CATA	2	8	105909	105916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015378	GTCG	2	8	107172	107179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015378	CGAG	2	8	107424	107431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015378	GGGC	2	8	107649	107656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015378	GTCG	2	8	107882	107889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015378	GTGC	2	8	110369	110376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015378	ATAA	2	8	118991	118998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015378	ACCT	2	8	119011	119018	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015378	CGGC	2	8	120874	120881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015378	CGTC	2	8	121186	121193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015378	GCCG	2	8	121412	121419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015378	CGAG	2	8	121514	121521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015378	CGCC	2	8	121756	121763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_015378	GACT	2	8	121815	121822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015378	TCCA	2	8	122324	122331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015378	TCCA	2	8	122776	122783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015378	CGAT	2	8	122794	122801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015378	TTCT	2	8	122881	122888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015378	TGGA	2	8	122995	123002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015378	CTGG	2	8	123237	123244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015378	CAGT	2	8	123437	123444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015378	CTGT	2	8	123540	123547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015378	ACTT	2	8	123560	123567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015378	GTAT	2	8	125437	125444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015378	GTTT	2	8	125985	125992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015378	GTTT	2	8	126102	126109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015378	GCCT	2	8	127712	127719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015378	CCGT	2	8	127745	127752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015378	CTTG	2	8	128498	128505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015378	ACCG	2	8	128610	128617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.