MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	CG	3	6	284	289	0 %	0 %	50 %	50 %	330818809
2	NC_015378	CG	3	6	305	310	0 %	0 %	50 %	50 %	330818809
3	NC_015378	GT	3	6	434	439	0 %	50 %	50 %	0 %	330818809
4	NC_015378	CT	3	6	982	987	0 %	50 %	0 %	50 %	330818809
5	NC_015378	CA	3	6	1736	1741	50 %	0 %	0 %	50 %	330818810
6	NC_015378	GC	3	6	2787	2792	0 %	0 %	50 %	50 %	330818811
7	NC_015378	GC	3	6	2817	2822	0 %	0 %	50 %	50 %	330818811
8	NC_015378	CG	3	6	3414	3419	0 %	0 %	50 %	50 %	330818811
9	NC_015378	CG	3	6	3800	3805	0 %	0 %	50 %	50 %	330818811
10	NC_015378	CG	4	8	3828	3835	0 %	0 %	50 %	50 %	330818811
11	NC_015378	GC	3	6	4044	4049	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
12	NC_015378	GT	3	6	4184	4189	0 %	50 %	50 %	0 %	330818812
13	NC_015378	GC	3	6	4320	4325	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
14	NC_015378	GC	3	6	4587	4592	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
15	NC_015378	GC	3	6	4951	4956	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
16	NC_015378	GC	3	6	5021	5026	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
17	NC_015378	CG	3	6	5641	5646	0 %	0 %	50 %	50 %	330818813
18	NC_015378	GC	3	6	5742	5747	0 %	0 %	50 %	50 %	330818813
19	NC_015378	GC	3	6	6342	6347	0 %	0 %	50 %	50 %	330818814
20	NC_015378	CG	4	8	6416	6423	0 %	0 %	50 %	50 %	330818814
21	NC_015378	CG	3	6	6788	6793	0 %	0 %	50 %	50 %	330818815
22	NC_015378	CG	3	6	6999	7004	0 %	0 %	50 %	50 %	330818815
23	NC_015378	GC	4	8	7340	7347	0 %	0 %	50 %	50 %	330818815
24	NC_015378	GC	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015378	CG	3	6	7448	7453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015378	CT	3	6	7783	7788	0 %	50 %	0 %	50 %	330818817
27	NC_015378	CG	3	6	8068	8073	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
28	NC_015378	GC	3	6	8294	8299	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
29	NC_015378	CG	3	6	8415	8420	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
30	NC_015378	CG	3	6	8459	8464	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
31	NC_015378	GC	4	8	8748	8755	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
32	NC_015378	GC	4	8	8917	8924	0 %	0 %	50 %	50 %	330818818
33	NC_015378	CG	4	8	8985	8992	0 %	0 %	50 %	50 %	330818818
34	NC_015378	GC	4	8	9105	9112	0 %	0 %	50 %	50 %	330818818
35	NC_015378	TG	3	6	9116	9121	0 %	50 %	50 %	0 %	330818818
36	NC_015378	GC	4	8	9399	9406	0 %	0 %	50 %	50 %	330818819
37	NC_015378	CG	4	8	9467	9474	0 %	0 %	50 %	50 %	330818819
38	NC_015378	GC	5	10	9517	9526	0 %	0 %	50 %	50 %	330818819
39	NC_015378	GA	3	6	9954	9959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015378	CG	3	6	9965	9970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015378	CG	3	6	10369	10374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015378	GA	3	6	10877	10882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015378	GC	3	6	11422	11427	0 %	0 %	50 %	50 %	330818820
44	NC_015378	GC	3	6	11649	11654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015378	CA	3	6	11673	11678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015378	GC	4	8	11866	11873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015378	TG	3	6	13163	13168	0 %	50 %	50 %	0 %	330818822
48	NC_015378	GC	3	6	13485	13490	0 %	0 %	50 %	50 %	330818822
49	NC_015378	TC	3	6	13681	13686	0 %	50 %	0 %	50 %	330818822
50	NC_015378	TC	3	6	14125	14130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015378	CG	3	6	14215	14220	0 %	0 %	50 %	50 %	330818823
52	NC_015378	CA	3	6	14525	14530	50 %	0 %	0 %	50 %	330818823
53	NC_015378	GT	4	8	15111	15118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015378	CT	3	6	15310	15315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015378	AG	4	8	15352	15359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015378	CG	3	6	15417	15422	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
57	NC_015378	GC	3	6	15729	15734	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
58	NC_015378	TG	3	6	18092	18097	0 %	50 %	50 %	0 %	330818824
59	NC_015378	GT	3	6	19440	19445	0 %	50 %	50 %	0 %	330818824
60	NC_015378	CG	3	6	20268	20273	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
61	NC_015378	GC	3	6	21902	21907	0 %	0 %	50 %	50 %	330818825
62	NC_015378	CG	3	6	22096	22101	0 %	0 %	50 %	50 %	330818825
63	NC_015378	GC	3	6	22143	22148	0 %	0 %	50 %	50 %	330818825
64	NC_015378	GC	4	8	23363	23370	0 %	0 %	50 %	50 %	330818826
65	NC_015378	CG	3	6	23558	23563	0 %	0 %	50 %	50 %	330818826
66	NC_015378	AT	3	6	23819	23824	50 %	50 %	0 %	0 %	330818826
67	NC_015378	TC	3	6	24053	24058	0 %	50 %	0 %	50 %	330818826
68	NC_015378	AC	3	6	24095	24100	50 %	0 %	0 %	50 %	330818826
69	NC_015378	AC	3	6	24561	24566	50 %	0 %	0 %	50 %	330818826
70	NC_015378	CG	3	6	24581	24586	0 %	0 %	50 %	50 %	330818826
71	NC_015378	GC	3	6	24798	24803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015378	TC	3	6	24994	24999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015378	CG	4	8	25576	25583	0 %	0 %	50 %	50 %	330818827
74	NC_015378	GC	3	6	26402	26407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015378	CG	4	8	26726	26733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015378	CG	3	6	27908	27913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015378	GC	3	6	28111	28116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015378	CG	3	6	28188	28193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015378	CG	3	6	28257	28262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015378	CG	3	6	28746	28751	0 %	0 %	50 %	50 %	330818829
81	NC_015378	TC	3	6	28828	28833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015378	GC	4	8	29139	29146	0 %	0 %	50 %	50 %	330818830
83	NC_015378	GC	3	6	29304	29309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015378	GT	3	6	29419	29424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015378	CG	3	6	29532	29537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015378	CG	3	6	29818	29823	0 %	0 %	50 %	50 %	330818831
87	NC_015378	CG	3	6	30175	30180	0 %	0 %	50 %	50 %	330818831
88	NC_015378	CT	3	6	30495	30500	0 %	50 %	0 %	50 %	330818832
89	NC_015378	GC	3	6	30595	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	330818832
90	NC_015378	GC	3	6	31704	31709	0 %	0 %	50 %	50 %	330818834
91	NC_015378	GA	3	6	32025	32030	50 %	0 %	50 %	0 %	330818834
92	NC_015378	CG	3	6	32810	32815	0 %	0 %	50 %	50 %	330818836
93	NC_015378	GC	3	6	33185	33190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015378	AC	3	6	33903	33908	50 %	0 %	0 %	50 %	330818837
95	NC_015378	GC	3	6	35089	35094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015378	TG	3	6	35435	35440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015378	TG	3	6	35611	35616	0 %	50 %	50 %	0 %	330818838
98	NC_015378	GC	3	6	36495	36500	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
99	NC_015378	GC	3	6	36788	36793	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
100	NC_015378	GC	3	6	36957	36962	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
101	NC_015378	CG	3	6	37369	37374	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
102	NC_015378	CG	4	8	37496	37503	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
103	NC_015378	TG	3	6	39042	39047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015378	CG	3	6	39326	39331	0 %	0 %	50 %	50 %	330818842
105	NC_015378	CG	3	6	40065	40070	0 %	0 %	50 %	50 %	330818843
106	NC_015378	CG	3	6	40965	40970	0 %	0 %	50 %	50 %	330818844
107	NC_015378	GC	3	6	41099	41104	0 %	0 %	50 %	50 %	330818845
108	NC_015378	GA	3	6	41882	41887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015378	GA	4	8	41998	42005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015378	AT	3	6	42726	42731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015378	CA	3	6	43149	43154	50 %	0 %	0 %	50 %	330818846
112	NC_015378	CA	3	6	43169	43174	50 %	0 %	0 %	50 %	330818846
113	NC_015378	GC	3	6	43192	43197	0 %	0 %	50 %	50 %	330818846
114	NC_015378	AT	3	6	43629	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015378	AG	3	6	43840	43845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015378	CG	3	6	44682	44687	0 %	0 %	50 %	50 %	330818847
117	NC_015378	CG	3	6	44692	44697	0 %	0 %	50 %	50 %	330818847
118	NC_015378	GC	3	6	47214	47219	0 %	0 %	50 %	50 %	330818848
119	NC_015378	GC	3	6	48680	48685	0 %	0 %	50 %	50 %	330818849
120	NC_015378	AC	3	6	48691	48696	50 %	0 %	0 %	50 %	330818849
121	NC_015378	CG	3	6	49643	49648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015378	GT	3	6	49895	49900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015378	GC	3	6	50023	50028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015378	TC	3	6	50741	50746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015378	CG	3	6	51295	51300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015378	GC	3	6	51692	51697	0 %	0 %	50 %	50 %	330818850
127	NC_015378	GC	4	8	52046	52053	0 %	0 %	50 %	50 %	330818850
128	NC_015378	GC	3	6	53048	53053	0 %	0 %	50 %	50 %	330818852
129	NC_015378	CG	3	6	53328	53333	0 %	0 %	50 %	50 %	330818852
130	NC_015378	CG	3	6	53386	53391	0 %	0 %	50 %	50 %	330818852
131	NC_015378	GC	3	6	55402	55407	0 %	0 %	50 %	50 %	330818853
132	NC_015378	GA	3	6	56047	56052	50 %	0 %	50 %	0 %	330818854
133	NC_015378	GA	3	6	56110	56115	50 %	0 %	50 %	0 %	330818854
134	NC_015378	CG	3	6	56752	56757	0 %	0 %	50 %	50 %	330818854
135	NC_015378	TC	4	8	57930	57937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015378	GA	3	6	57975	57980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015378	AG	3	6	58154	58159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015378	GC	3	6	58188	58193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015378	TC	3	6	58627	58632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015378	GA	3	6	58931	58936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015378	CG	3	6	59046	59051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015378	CG	3	6	59177	59182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015378	CG	3	6	59546	59551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015378	CG	3	6	59640	59645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015378	CG	3	6	59996	60001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015378	CA	4	8	60092	60099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015378	GC	3	6	60278	60283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015378	GA	3	6	62428	62433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015378	AC	3	6	62873	62878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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295	NC_015378	GA	3	6	121922	121927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015378	GC	3	6	122608	122613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
297	NC_015378	CG	3	6	123102	123107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
298	NC_015378	CG	3	6	123231	123236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
299	NC_015378	CG	3	6	123492	123497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
300	NC_015378	GC	3	6	123908	123913	0 %	0 %	50 %	50 %	330818900
301	NC_015378	CG	3	6	124378	124383	0 %	0 %	50 %	50 %	330818900
302	NC_015378	CG	3	6	124858	124863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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308	NC_015378	TC	3	6	126880	126885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_015378	GT	3	6	127425	127430	0 %	50 %	50 %	0 %	330818902

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.