MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_2p

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015377	GACGAA	2	12	262	273	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330822094
2	NC_015377	TGCCCG	2	12	952	963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330822095
3	NC_015377	GCGTGA	2	12	3468	3479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330822096
4	NC_015377	GCTCGA	2	12	3693	3704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822096
5	NC_015377	GCGCCG	2	12	4962	4973	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
6	NC_015377	CGGCAG	2	12	5612	5623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330822097
7	NC_015377	TCGGCT	2	12	7832	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822099
8	NC_015377	CGGCGC	2	12	8509	8520	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
9	NC_015377	TCGCGA	2	12	8532	8543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822100
10	NC_015377	GCGATC	2	12	13460	13471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822100
11	NC_015377	CCGGAT	2	12	15329	15340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822103
12	NC_015377	CCGGAT	2	12	17437	17448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822106
13	NC_015377	CAGCGC	2	12	18466	18477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330822107
14	NC_015377	TGAAGC	2	12	24980	24991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330822111
15	NC_015377	TCGTGC	2	12	26313	26324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822113
16	NC_015377	GGAAAG	2	12	31512	31523	50 %	0 %	50 %	0 %	330822117
17	NC_015377	CGGCCG	2	12	35845	35856	0 %	0 %	50 %	50 %	330822122
18	NC_015377	AAAAAC	2	12	42721	42732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	330822129
19	NC_015377	GCCGAT	2	12	42849	42860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822130
20	NC_015377	ATCTGC	2	12	56741	56752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330822143
21	NC_015377	GTCGAC	2	12	58795	58806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822143
22	NC_015377	AGGTAG	2	12	63069	63080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330822145
23	NC_015377	CAGCGG	2	12	65373	65384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330822147
24	NC_015377	GCCTTC	2	12	67916	67927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330822153
25	NC_015377	GTCCTG	3	18	68003	68020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822153
26	NC_015377	TTCGGC	2	12	68135	68146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822153
27	NC_015377	TGTCCG	2	12	71147	71158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822155
28	NC_015377	GATGCG	2	12	75042	75053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330822159
29	NC_015377	TAGCGG	2	12	84199	84210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330822166
30	NC_015377	CCGGCG	2	12	88081	88092	0 %	0 %	50 %	50 %	330822168
31	NC_015377	GCACTG	2	12	89094	89105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822168
32	NC_015377	CGATCG	2	12	91438	91449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822168
33	NC_015377	CGTCGG	2	12	93170	93181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330822168
34	NC_015377	GGCGTG	2	12	94623	94634	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330822168
35	NC_015377	CGGCGA	2	12	97015	97026	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330822170
36	NC_015377	TCACAA	2	12	101226	101237	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	330822172
37	NC_015377	TCGGGC	2	12	104251	104262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330822176
38	NC_015377	GAACTT	2	12	104511	104522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330822176
39	NC_015377	CGAGGC	2	12	106298	106309	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330822179
40	NC_015377	CGCGAT	2	12	106985	106996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822179
41	NC_015377	GCCGGC	2	12	107135	107146	0 %	0 %	50 %	50 %	330822179
42	NC_015377	GCCGGC	2	12	107210	107221	0 %	0 %	50 %	50 %	330822179
43	NC_015377	GCGATC	2	12	107619	107630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822180
44	NC_015377	GGCCCG	2	12	109366	109377	0 %	0 %	50 %	50 %	330822180
45	NC_015377	GCAGCT	2	12	112847	112858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822185
46	NC_015377	GCCCGG	2	12	120879	120890	0 %	0 %	50 %	50 %	330822190
47	NC_015377	CCGGCG	2	12	121033	121044	0 %	0 %	50 %	50 %	330822190

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.