MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_2p

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015377	GCCAG	2	10	2212	2221	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015377	CCGGG	2	10	2771	2780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015377	GACCG	2	10	3763	3772	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015377	TGTCT	2	10	3773	3782	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015377	TCGAT	2	10	14398	14407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015377	TGGAG	2	10	38651	38660	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015377	GGATG	2	10	38793	38802	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015377	CATGC	2	10	44988	44997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015377	GCGCC	2	10	51757	51766	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015377	AGCGG	2	10	64635	64644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015377	CGCGG	2	10	65041	65050	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015377	GCGGA	2	10	67330	67339	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015377	CGCGG	2	10	70283	70292	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015377	TCATT	2	10	73859	73868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015377	AGGGC	2	10	73881	73890	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015377	GAGCG	2	10	75097	75106	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015377	CCCGG	2	10	98364	98373	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015377	ATGCA	2	10	101586	101595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015377	GCCGA	2	10	102568	102577	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015377	GATCG	2	10	116329	116338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015377	ACGTG	2	10	118055	118064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015377	GTTCG	2	10	124233	124242	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015377	GCCCC	2	10	124339	124348	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_015377	GGCCG	2	10	125357	125366	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015377	CGGCG	2	10	127991	128000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015377	CCCGG	2	10	128807	128816	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015377	CGCCA	2	10	128823	128832	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015377	GAGCC	2	10	129272	129281	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.