MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_2p

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015377	CG	3	6	572	577	0 %	0 %	50 %	50 %	330822094
2	NC_015377	GC	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	330822094
3	NC_015377	GC	3	6	792	797	0 %	0 %	50 %	50 %	330822095
4	NC_015377	GA	3	6	1546	1551	50 %	0 %	50 %	0 %	330822095
5	NC_015377	CG	3	6	3010	3015	0 %	0 %	50 %	50 %	330822096
6	NC_015377	CG	3	6	4779	4784	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
7	NC_015377	CG	3	6	4853	4858	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
8	NC_015377	AG	3	6	4886	4891	50 %	0 %	50 %	0 %	330822097
9	NC_015377	GA	3	6	5220	5225	50 %	0 %	50 %	0 %	330822097
10	NC_015377	GC	4	8	5323	5330	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
11	NC_015377	CA	3	6	5339	5344	50 %	0 %	0 %	50 %	330822097
12	NC_015377	CG	3	6	5530	5535	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
13	NC_015377	GC	3	6	5542	5547	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
14	NC_015377	GC	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
15	NC_015377	CG	3	6	6778	6783	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
16	NC_015377	CG	3	6	7261	7266	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
17	NC_015377	CG	3	6	7936	7941	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
18	NC_015377	CG	4	8	7962	7969	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
19	NC_015377	CT	3	6	7970	7975	0 %	50 %	0 %	50 %	330822099
20	NC_015377	GC	3	6	8182	8187	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
21	NC_015377	GC	3	6	8246	8251	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
22	NC_015377	CG	3	6	8388	8393	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
23	NC_015377	GC	3	6	9105	9110	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
24	NC_015377	CG	3	6	9302	9307	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
25	NC_015377	GC	3	6	9537	9542	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
26	NC_015377	GA	3	6	10376	10381	50 %	0 %	50 %	0 %	330822100
27	NC_015377	GC	3	6	10653	10658	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
28	NC_015377	GT	3	6	10688	10693	0 %	50 %	50 %	0 %	330822100
29	NC_015377	GC	3	6	10816	10821	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
30	NC_015377	AG	3	6	11116	11121	50 %	0 %	50 %	0 %	330822100
31	NC_015377	GC	4	8	11401	11408	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
32	NC_015377	GA	3	6	11699	11704	50 %	0 %	50 %	0 %	330822100
33	NC_015377	GA	3	6	11894	11899	50 %	0 %	50 %	0 %	330822100
34	NC_015377	AG	3	6	11959	11964	50 %	0 %	50 %	0 %	330822100
35	NC_015377	GC	3	6	13248	13253	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
36	NC_015377	CG	3	6	13318	13323	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
37	NC_015377	CG	3	6	13699	13704	0 %	0 %	50 %	50 %	330822101
38	NC_015377	CG	3	6	13880	13885	0 %	0 %	50 %	50 %	330822101
39	NC_015377	GA	3	6	14272	14277	50 %	0 %	50 %	0 %	330822102
40	NC_015377	GC	3	6	15005	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	330822103
41	NC_015377	GC	3	6	15063	15068	0 %	0 %	50 %	50 %	330822103
42	NC_015377	CG	3	6	15322	15327	0 %	0 %	50 %	50 %	330822103
43	NC_015377	GC	3	6	15393	15398	0 %	0 %	50 %	50 %	330822103
44	NC_015377	CG	3	6	16145	16150	0 %	0 %	50 %	50 %	330822105
45	NC_015377	CG	3	6	16543	16548	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
46	NC_015377	CG	3	6	16703	16708	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
47	NC_015377	CG	3	6	16775	16780	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
48	NC_015377	CG	3	6	16917	16922	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
49	NC_015377	GC	3	6	16947	16952	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
50	NC_015377	CG	3	6	17192	17197	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
51	NC_015377	GC	3	6	17536	17541	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
52	NC_015377	GC	3	6	17570	17575	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
53	NC_015377	GC	3	6	17626	17631	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
54	NC_015377	CG	4	8	17716	17723	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
55	NC_015377	GC	3	6	17949	17954	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
56	NC_015377	GC	3	6	18023	18028	0 %	0 %	50 %	50 %	330822106
57	NC_015377	CG	3	6	18518	18523	0 %	0 %	50 %	50 %	330822107
58	NC_015377	CG	5	10	18559	18568	0 %	0 %	50 %	50 %	330822107
59	NC_015377	GC	3	6	18767	18772	0 %	0 %	50 %	50 %	330822108
60	NC_015377	GC	3	6	19098	19103	0 %	0 %	50 %	50 %	330822108
61	NC_015377	CG	3	6	19168	19173	0 %	0 %	50 %	50 %	330822108
62	NC_015377	CT	3	6	19813	19818	0 %	50 %	0 %	50 %	330822109
63	NC_015377	GC	3	6	20136	20141	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
64	NC_015377	AG	3	6	20737	20742	50 %	0 %	50 %	0 %	330822110
65	NC_015377	GC	3	6	21268	21273	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
66	NC_015377	GC	3	6	21748	21753	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
67	NC_015377	GC	3	6	22225	22230	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
68	NC_015377	AC	3	6	22777	22782	50 %	0 %	0 %	50 %	330822110
69	NC_015377	CG	3	6	22917	22922	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
70	NC_015377	GA	3	6	23490	23495	50 %	0 %	50 %	0 %	330822110
71	NC_015377	GC	3	6	23973	23978	0 %	0 %	50 %	50 %	330822111
72	NC_015377	CG	3	6	24069	24074	0 %	0 %	50 %	50 %	330822111
73	NC_015377	CG	4	8	24845	24852	0 %	0 %	50 %	50 %	330822111
74	NC_015377	GC	3	6	25129	25134	0 %	0 %	50 %	50 %	330822111
75	NC_015377	GC	3	6	25196	25201	0 %	0 %	50 %	50 %	330822111
76	NC_015377	GC	4	8	25591	25598	0 %	0 %	50 %	50 %	330822112
77	NC_015377	GC	3	6	25888	25893	0 %	0 %	50 %	50 %	330822112
78	NC_015377	CG	3	6	26343	26348	0 %	0 %	50 %	50 %	330822113
79	NC_015377	TC	3	6	26379	26384	0 %	50 %	0 %	50 %	330822113
80	NC_015377	CG	3	6	27006	27011	0 %	0 %	50 %	50 %	330822113
81	NC_015377	GC	3	6	27984	27989	0 %	0 %	50 %	50 %	330822114
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87	NC_015377	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	330822117
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91	NC_015377	GC	3	6	33376	33381	0 %	0 %	50 %	50 %	330822119
92	NC_015377	GC	3	6	33384	33389	0 %	0 %	50 %	50 %	330822119
93	NC_015377	GC	3	6	34039	34044	0 %	0 %	50 %	50 %	330822120
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95	NC_015377	GC	3	6	35260	35265	0 %	0 %	50 %	50 %	330822122
96	NC_015377	GC	3	6	35303	35308	0 %	0 %	50 %	50 %	330822122
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101	NC_015377	CG	3	6	37464	37469	0 %	0 %	50 %	50 %	330822123
102	NC_015377	GC	3	6	37470	37475	0 %	0 %	50 %	50 %	330822123
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104	NC_015377	GC	3	6	38511	38516	0 %	0 %	50 %	50 %	330822124
105	NC_015377	CG	3	6	38828	38833	0 %	0 %	50 %	50 %	330822125
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108	NC_015377	GC	3	6	39401	39406	0 %	0 %	50 %	50 %	330822125
109	NC_015377	TC	3	6	39494	39499	0 %	50 %	0 %	50 %	330822125
110	NC_015377	GC	3	6	39625	39630	0 %	0 %	50 %	50 %	330822125
111	NC_015377	CG	3	6	39980	39985	0 %	0 %	50 %	50 %	330822126
112	NC_015377	GC	3	6	40476	40481	0 %	0 %	50 %	50 %	330822126
113	NC_015377	GC	3	6	40729	40734	0 %	0 %	50 %	50 %	330822126
114	NC_015377	GC	3	6	40798	40803	0 %	0 %	50 %	50 %	330822126
115	NC_015377	GC	4	8	40951	40958	0 %	0 %	50 %	50 %	330822126
116	NC_015377	CG	3	6	41454	41459	0 %	0 %	50 %	50 %	330822127
117	NC_015377	CG	3	6	42176	42181	0 %	0 %	50 %	50 %	330822128
118	NC_015377	CG	3	6	42306	42311	0 %	0 %	50 %	50 %	330822128
119	NC_015377	GC	3	6	42450	42455	0 %	0 %	50 %	50 %	330822128
120	NC_015377	CG	3	6	42907	42912	0 %	0 %	50 %	50 %	330822130
121	NC_015377	GC	3	6	42935	42940	0 %	0 %	50 %	50 %	330822130
122	NC_015377	TG	3	6	42991	42996	0 %	50 %	50 %	0 %	330822130
123	NC_015377	CG	4	8	43477	43484	0 %	0 %	50 %	50 %	330822131
124	NC_015377	GC	3	6	44127	44132	0 %	0 %	50 %	50 %	330822132
125	NC_015377	AG	3	6	44155	44160	50 %	0 %	50 %	0 %	330822132
126	NC_015377	CA	3	6	45042	45047	50 %	0 %	0 %	50 %	330822133
127	NC_015377	CT	3	6	45612	45617	0 %	50 %	0 %	50 %	330822133
128	NC_015377	CG	3	6	46820	46825	0 %	0 %	50 %	50 %	330822135
129	NC_015377	GA	3	6	47212	47217	50 %	0 %	50 %	0 %	330822135
130	NC_015377	TC	3	6	47378	47383	0 %	50 %	0 %	50 %	330822135
131	NC_015377	CG	3	6	47789	47794	0 %	0 %	50 %	50 %	330822135
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138	NC_015377	CG	3	6	52084	52089	0 %	0 %	50 %	50 %	330822138
139	NC_015377	CG	3	6	52577	52582	0 %	0 %	50 %	50 %	330822138
140	NC_015377	CG	3	6	53503	53508	0 %	0 %	50 %	50 %	330822138
141	NC_015377	AG	3	6	56293	56298	50 %	0 %	50 %	0 %	330822141
142	NC_015377	GT	3	6	56306	56311	0 %	50 %	50 %	0 %	330822141
143	NC_015377	AT	3	6	56404	56409	50 %	50 %	0 %	0 %	330822141
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.