MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 chromosome 2

Total Repeats: 857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015376	TCGGA	2	10	3629	3638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015376	TCACC	2	10	3866	3875	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015376	ACCTC	2	10	4835	4844	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015376	CCTCA	2	10	4976	4985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015376	CCTCA	2	10	5076	5085	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015376	CGATG	2	10	11803	11812	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015376	TTCGC	2	10	14782	14791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015376	TGCGT	2	10	14807	14816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015376	TGAGG	2	10	15078	15087	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015376	AGGAC	2	10	15191	15200	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015376	TCGAT	2	10	17383	17392	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015376	GGCCG	2	10	22249	22258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015376	CGAAC	2	10	22273	22282	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015376	GCCGC	2	10	30487	30496	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015376	GTGGC	2	10	33604	33613	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015376	GCGAG	2	10	34058	34067	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015376	TCCCC	2	10	34204	34213	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_015376	ATCAG	2	10	35779	35788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015376	GGACG	2	10	36697	36706	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015376	TTCGT	2	10	39698	39707	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015376	TGGAT	2	10	55983	55992	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015376	AAAGG	2	10	82596	82605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015376	GCGTG	2	10	85209	85218	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015376	GCCTG	2	10	86318	86327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015376	CAAGC	2	10	86703	86712	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015376	CGCGG	2	10	87592	87601	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015376	GGCTC	2	10	89995	90004	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015376	AGCGA	2	10	92497	92506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015376	CCGTG	2	10	94845	94854	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015376	GCATG	2	10	101526	101535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015376	ATCCG	2	10	101633	101642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015376	GCGCG	2	10	102710	102719	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015376	ATCGA	2	10	108324	108333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015376	TCGCG	2	10	108348	108357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015376	GGCCG	2	10	108915	108924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015376	CCGGC	2	10	110254	110263	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_015376	TTTCT	2	10	113867	113876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015376	CGGCC	2	10	122965	122974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015376	GGCCG	2	10	122989	122998	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015376	TGAGC	2	10	131067	131076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015376	GGCAA	2	10	131118	131127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015376	GGCGC	2	10	131898	131907	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015376	CGGCG	2	10	131987	131996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015376	GGCGC	2	10	137661	137670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015376	TTCAT	2	10	145945	145954	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015376	CCGCG	2	10	148107	148116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015376	ACTGG	2	10	153299	153308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015376	GCCGC	2	10	155382	155391	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_015376	TCGGC	2	10	155636	155645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015376	CGGCG	2	10	155884	155893	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015376	TCGCA	2	10	155928	155937	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015376	CATCG	2	10	156437	156446	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015376	ACCAT	2	10	164537	164546	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015376	GATGC	2	10	176703	176712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015376	GCCGC	2	10	184833	184842	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_015376	GCTTT	2	10	195565	195574	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015376	CCGCG	2	10	195738	195747	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_015376	GCATG	2	10	200899	200908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015376	AACGG	2	10	204257	204266	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015376	GCCGC	2	10	206640	206649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_015376	ATGAC	2	10	212635	212644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015376	CACGG	2	10	213414	213423	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015376	CGCGG	2	10	217559	217568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015376	GGCGC	2	10	219002	219011	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015376	CTTGA	2	10	221598	221607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015376	CTTTT	2	10	223931	223940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015376	GGCGC	2	10	227946	227955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015376	CGAGC	2	10	233073	233082	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015376	GATGC	2	10	237500	237509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015376	CGGTT	2	10	248934	248943	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015376	TCGCG	2	10	249112	249121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015376	GACCC	2	10	252004	252013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015376	TGAAT	2	10	258393	258402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015376	AGGCA	2	10	258475	258484	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015376	CGGCT	2	10	258687	258696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015376	GATCG	2	10	262000	262009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015376	TTGCC	2	10	262186	262195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015376	CCGGG	2	10	315100	315109	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015376	GCCCG	2	10	325004	325013	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_015376	GGGCG	2	10	325628	325637	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015376	ACGCC	2	10	341882	341891	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015376	GGGGT	2	10	368031	368040	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015376	CCGCG	2	10	368139	368148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_015376	GCGCC	2	10	375088	375097	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_015376	TTCGC	2	10	378481	378490	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015376	AATGT	2	10	380716	380725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015376	GTGAC	2	10	381891	381900	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015376	TCGAC	2	10	388590	388599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015376	CTTGC	2	10	395711	395720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015376	CATTT	2	10	395749	395758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015376	CGACA	2	10	403256	403265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015376	CGACA	2	10	412818	412827	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015376	CGTGG	2	10	416944	416953	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015376	CGGCG	2	10	425049	425058	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015376	GCGCC	2	10	425064	425073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_015376	CGGCG	2	10	434900	434909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015376	GCGCC	2	10	436444	436453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_015376	TCGCG	2	10	468043	468052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015376	GCCCG	2	10	469245	469254	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_015376	CCTTC	2	10	471913	471922	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_015376	GCCGA	2	10	472052	472061	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015376	CTGCC	2	10	478875	478884	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_015376	AGGAA	2	10	478930	478939	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015376	GGCCC	2	10	500922	500931	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_015376	ACGCG	2	10	505661	505670	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015376	CGCGG	2	10	517362	517371	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015376	AGGGA	2	10	517418	517427	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015376	TTTTG	2	10	519290	519299	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015376	CCGGC	2	10	522206	522215	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_015376	GCGCG	2	10	524445	524454	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015376	TGCAG	2	10	524600	524609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015376	GGGCA	2	10	525068	525077	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015376	AAGCC	2	10	527024	527033	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015376	TTTCC	2	10	527074	527083	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015376	CGGCG	2	10	533554	533563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_015376	GACGC	2	10	547397	547406	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015376	GGCGC	2	10	557922	557931	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015376	ATCGC	2	10	558015	558024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015376	GGCGC	2	10	558025	558034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015376	GGCGG	3	15	565156	565170	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015376	GTGCC	2	10	568885	568894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015376	TTTCC	2	10	570203	570212	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015376	GCATG	2	10	572559	572568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015376	TCGTG	2	10	588041	588050	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015376	GGGAG	2	10	589599	589608	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015376	GAAGC	2	10	590639	590648	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015376	CTCAT	2	10	591598	591607	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015376	ACGCG	2	10	592155	592164	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015376	CATCG	2	10	594262	594271	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015376	TGGAT	2	10	596223	596232	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015376	CGGGC	2	10	604586	604595	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_015376	TCGTT	2	10	604800	604809	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015376	GCAGC	2	10	616623	616632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015376	CGGCG	2	10	620546	620555	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015376	GGCGC	2	10	622427	622436	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015376	GGCGC	2	10	622487	622496	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015376	TTCGG	2	10	625458	625467	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015376	GCCGG	2	10	627263	627272	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015376	CGGCG	2	10	633817	633826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015376	TGGTC	2	10	635164	635173	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015376	TCCGG	2	10	635622	635631	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015376	GAATT	2	10	635689	635698	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015376	CGCGC	2	10	637116	637125	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_015376	GCCGC	2	10	652212	652221	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_015376	CGGCG	2	10	658899	658908	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015376	GTTTT	2	10	675803	675812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015376	ATTGC	2	10	676935	676944	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015376	AAAAC	2	10	694086	694095	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_015376	GCGCG	2	10	700654	700663	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_015376	TCGGC	2	10	702257	702266	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_015376	AGGCG	2	10	702470	702479	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015376	GGCCC	2	10	707584	707593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
153	NC_015376	GGGAC	2	10	707613	707622	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015376	GCCCG	2	10	712577	712586	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
155	NC_015376	GTCTT	2	10	719313	719322	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_015376	TCGTG	2	10	721537	721546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_015376	GGGAG	2	10	723095	723104	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015376	GAAGC	2	10	724135	724144	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_015376	CTCAT	2	10	725094	725103	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_015376	ACGCG	2	10	725651	725660	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_015376	CGCGC	2	10	730491	730500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
162	NC_015376	GGGCA	2	10	740342	740351	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
163	NC_015376	CGGCG	2	10	747921	747930	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
164	NC_015376	CATCG	2	10	751289	751298	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_015376	CCGAG	2	10	751340	751349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_015376	GCGCC	2	10	753184	753193	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
167	NC_015376	TAGGG	2	10	755567	755576	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015376	CCGGC	2	10	760036	760045	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
169	NC_015376	TCGCG	2	10	769578	769587	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
170	NC_015376	GCGCG	2	10	772156	772165	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
171	NC_015376	ACGGC	2	10	774920	774929	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
172	NC_015376	CGATC	2	10	775052	775061	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_015376	CGGCG	2	10	793071	793080	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
174	NC_015376	CCGCG	2	10	795047	795056	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
175	NC_015376	CGCTT	2	10	797392	797401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_015376	GCCGC	2	10	853800	853809	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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186	NC_015376	TGGCG	2	10	875829	875838	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_015376	GCGCC	2	10	878717	878726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
188	NC_015376	CGCGC	2	10	886682	886691	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
189	NC_015376	GCAGC	2	10	886834	886843	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_015376	CGCTG	2	10	909531	909540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_015376	GCGAA	2	10	910029	910038	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_015376	TGGCT	2	10	910592	910601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_015376	GCCTT	2	10	920571	920580	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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202	NC_015376	AGCCT	2	10	947122	947131	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
203	NC_015376	ATCGC	2	10	947177	947186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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263	NC_015376	CCCGG	2	10	1183308	1183317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
264	NC_015376	CCCGC	2	10	1183704	1183713	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
265	NC_015376	GGACA	2	10	1183719	1183728	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_015376	GTTCG	2	10	1186935	1186944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_015376	CGCGG	2	10	1215820	1215829	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
270	NC_015376	GTGCG	2	10	1223292	1223301	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
271	NC_015376	CAGGG	2	10	1225510	1225519	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
272	NC_015376	AGCCC	2	10	1225653	1225662	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
273	NC_015376	CCGGC	2	10	1226097	1226106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_015376	CTTCG	2	10	1226107	1226116	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
275	NC_015376	TTGCA	2	10	1227469	1227478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_015376	TCGTT	2	10	1227586	1227595	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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278	NC_015376	CAGCC	2	10	1235461	1235470	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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280	NC_015376	ACCAG	2	10	1244037	1244046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_015376	CGCGA	2	10	1244761	1244770	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
282	NC_015376	GCCGG	2	10	1249030	1249039	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015376	CCGCG	2	10	1249657	1249666	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
284	NC_015376	GCGTG	2	10	1254575	1254584	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
285	NC_015376	CAGCC	2	10	1257292	1257301	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
286	NC_015376	TTCGC	2	10	1257328	1257337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_015376	CGGGC	2	10	1258590	1258599	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_015376	GGCGC	2	10	1268123	1268132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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464	NC_015376	GCCGG	2	10	1999658	1999667	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
465	NC_015376	CGCGT	2	10	2002409	2002418	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_015376	CGGGA	2	10	2099739	2099748	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
488	NC_015376	GGGCG	2	10	2099769	2099778	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_015376	TCCTT	2	10	2171145	2171154	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

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