MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid2

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015322	AGGTT	2	10	1491	1500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015322	CTGAT	2	10	1581	1590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015322	AAATC	2	10	2367	2376	60 %	20 %	0 %	20 %	327399853
4	NC_015322	TCTCA	2	10	2734	2743	20 %	40 %	0 %	40 %	327399853
5	NC_015322	ATTTT	2	10	3869	3878	20 %	80 %	0 %	0 %	327399853
6	NC_015322	CTTTC	2	10	5608	5617	0 %	60 %	0 %	40 %	327399854
7	NC_015322	TATCG	2	10	6077	6086	20 %	40 %	20 %	20 %	327399854
8	NC_015322	ATTTG	2	10	6845	6854	20 %	60 %	20 %	0 %	327399855
9	NC_015322	TTCTC	2	10	6959	6968	0 %	60 %	0 %	40 %	327399855
10	NC_015322	ATCTC	2	10	7067	7076	20 %	40 %	0 %	40 %	327399855
11	NC_015322	TTTTA	2	10	7665	7674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015322	ATTCC	2	10	8375	8384	20 %	40 %	0 %	40 %	327399856
13	NC_015322	AATTC	2	10	8558	8567	40 %	40 %	0 %	20 %	327399856
14	NC_015322	TTCCC	2	10	9462	9471	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015322	CATTG	2	10	9745	9754	20 %	40 %	20 %	20 %	327399860
16	NC_015322	ACATT	2	10	10233	10242	40 %	40 %	0 %	20 %	327399861
17	NC_015322	AGGTT	2	10	13832	13841	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015322	CTGAT	2	10	13922	13931	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015322	ATTTT	2	10	14234	14243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015322	ATTAC	2	10	16852	16861	40 %	40 %	0 %	20 %	327399867
21	NC_015322	GAAGC	2	10	17255	17264	40 %	0 %	40 %	20 %	327399868
22	NC_015322	ATATT	2	10	17316	17325	40 %	60 %	0 %	0 %	327399868
23	NC_015322	TAAAA	2	10	17741	17750	80 %	20 %	0 %	0 %	327399869
24	NC_015322	TTGTT	2	10	18224	18233	0 %	80 %	20 %	0 %	327399870
25	NC_015322	TTTTC	2	10	18346	18355	0 %	80 %	0 %	20 %	327399870
26	NC_015322	AATTT	2	10	18949	18958	40 %	60 %	0 %	0 %	327399871
27	NC_015322	TTTGA	2	10	21214	21223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015322	ATGTG	2	10	21342	21351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015322	AGAAA	2	10	21720	21729	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015322	TTCCC	2	10	22403	22412	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015322	CATTG	2	10	22687	22696	20 %	40 %	20 %	20 %	327399876
32	NC_015322	ACATT	2	10	23175	23184	40 %	40 %	0 %	20 %	327399877

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.