MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid2

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015322	ATAC	2	8	119	126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015322	TAAA	2	8	402	409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015322	AAAC	2	8	1051	1058	75 %	0 %	0 %	25 %	327399852
4	NC_015322	TTCC	2	8	2125	2132	0 %	50 %	0 %	50 %	327399853
5	NC_015322	ATAC	2	8	2182	2189	50 %	25 %	0 %	25 %	327399853
6	NC_015322	CTAC	2	8	2354	2361	25 %	25 %	0 %	50 %	327399853
7	NC_015322	TAAT	2	8	2897	2904	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
8	NC_015322	AATT	2	8	3253	3260	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
9	NC_015322	TGTA	2	8	3543	3550	25 %	50 %	25 %	0 %	327399853
10	NC_015322	TAAA	2	8	4239	4246	75 %	25 %	0 %	0 %	327399853
11	NC_015322	AAAC	2	8	4311	4318	75 %	0 %	0 %	25 %	327399853
12	NC_015322	TTAT	2	8	4418	4425	25 %	75 %	0 %	0 %	327399853
13	NC_015322	CTTT	2	8	5576	5583	0 %	75 %	0 %	25 %	327399854
14	NC_015322	GCAA	2	8	6004	6011	50 %	0 %	25 %	25 %	327399854
15	NC_015322	TCTT	2	8	6830	6837	0 %	75 %	0 %	25 %	327399855
16	NC_015322	CTTG	2	8	7035	7042	0 %	50 %	25 %	25 %	327399855
17	NC_015322	GCCC	2	8	7398	7405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015322	AATG	2	8	7508	7515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015322	CTGC	2	8	7648	7655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015322	AATT	2	8	8319	8326	50 %	50 %	0 %	0 %	327399856
21	NC_015322	GAAT	2	8	8424	8431	50 %	25 %	25 %	0 %	327399856
22	NC_015322	AGAA	2	8	9153	9160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015322	AAGA	2	8	9319	9326	75 %	0 %	25 %	0 %	327399858
24	NC_015322	TAAA	2	8	10124	10131	75 %	25 %	0 %	0 %	327399861
25	NC_015322	AATT	2	8	11191	11198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015322	TGCC	2	8	11203	11210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015322	CCAA	2	8	11486	11493	50 %	0 %	0 %	50 %	327399863
28	NC_015322	ATTA	2	8	11684	11691	50 %	50 %	0 %	0 %	327399863
29	NC_015322	TCGG	2	8	11790	11797	0 %	25 %	50 %	25 %	327399863
30	NC_015322	AAAG	2	8	11927	11934	75 %	0 %	25 %	0 %	327399863
31	NC_015322	CAAA	2	8	12039	12046	75 %	0 %	0 %	25 %	327399863
32	NC_015322	GGCT	2	8	12332	12339	0 %	25 %	50 %	25 %	327399864
33	NC_015322	ATAC	2	8	12460	12467	50 %	25 %	0 %	25 %	327399864
34	NC_015322	TAAA	2	8	12743	12750	75 %	25 %	0 %	0 %	327399864
35	NC_015322	AAAC	2	8	13392	13399	75 %	0 %	0 %	25 %	327399865
36	NC_015322	AAAT	2	8	14323	14330	75 %	25 %	0 %	0 %	327399866
37	NC_015322	AATC	2	8	14335	14342	50 %	25 %	0 %	25 %	327399866
38	NC_015322	TCTT	2	8	14393	14400	0 %	75 %	0 %	25 %	327399866
39	NC_015322	AATT	2	8	14596	14603	50 %	50 %	0 %	0 %	327399866
40	NC_015322	TTCT	2	8	14916	14923	0 %	75 %	0 %	25 %	327399866
41	NC_015322	CTGC	2	8	15010	15017	0 %	25 %	25 %	50 %	327399866
42	NC_015322	ACTG	2	8	15112	15119	25 %	25 %	25 %	25 %	327399866
43	NC_015322	ATTA	2	8	16137	16144	50 %	50 %	0 %	0 %	327399867
44	NC_015322	GCTT	2	8	16168	16175	0 %	50 %	25 %	25 %	327399867
45	NC_015322	ATTT	2	8	16349	16356	25 %	75 %	0 %	0 %	327399867
46	NC_015322	TCTT	2	8	16465	16472	0 %	75 %	0 %	25 %	327399867
47	NC_015322	ACTA	2	8	16698	16705	50 %	25 %	0 %	25 %	327399867
48	NC_015322	GTTT	2	8	16993	17000	0 %	75 %	25 %	0 %	327399867
49	NC_015322	CCAC	2	8	17017	17024	25 %	0 %	0 %	75 %	327399867
50	NC_015322	TCGA	2	8	17726	17733	25 %	25 %	25 %	25 %	327399869
51	NC_015322	TCTT	2	8	17988	17995	0 %	75 %	0 %	25 %	327399870
52	NC_015322	TTGA	2	8	19142	19149	25 %	50 %	25 %	0 %	327399871
53	NC_015322	CTTT	2	8	19281	19288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015322	TAAT	2	8	19366	19373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015322	TTAT	2	8	19417	19424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015322	TATT	2	8	19521	19528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015322	AATT	2	8	19569	19576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015322	ATTG	2	8	20637	20644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015322	TAAA	2	8	20674	20681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015322	TAAA	2	8	20783	20790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015322	AGGC	2	8	21330	21337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015322	GAAA	2	8	21414	21421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015322	TTTA	2	8	21624	21631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015322	AAGA	2	8	21698	21705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015322	AGAA	2	8	22084	22091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015322	TAAA	2	8	23066	23073	75 %	25 %	0 %	0 %	327399877
67	NC_015322	AATT	2	8	24133	24140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015322	TGCC	2	8	24145	24152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015322	CCAA	2	8	24428	24435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015322	ATTA	2	8	24626	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015322	TCGG	2	8	24732	24739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015322	AAAG	2	8	24870	24877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015322	CAAA	2	8	24982	24989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015322	GGCT	2	8	25275	25282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.