MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid2

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015322	AAAC	2	8	1051	1058	75 %	0 %	0 %	25 %	327399852
2	NC_015322	TTCC	2	8	2125	2132	0 %	50 %	0 %	50 %	327399853
3	NC_015322	ATAC	2	8	2182	2189	50 %	25 %	0 %	25 %	327399853
4	NC_015322	CTAC	2	8	2354	2361	25 %	25 %	0 %	50 %	327399853
5	NC_015322	TAAT	2	8	2897	2904	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
6	NC_015322	AATT	2	8	3253	3260	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
7	NC_015322	TGTA	2	8	3543	3550	25 %	50 %	25 %	0 %	327399853
8	NC_015322	TAAA	2	8	4239	4246	75 %	25 %	0 %	0 %	327399853
9	NC_015322	AAAC	2	8	4311	4318	75 %	0 %	0 %	25 %	327399853
10	NC_015322	TTAT	2	8	4418	4425	25 %	75 %	0 %	0 %	327399853
11	NC_015322	CTTT	2	8	5576	5583	0 %	75 %	0 %	25 %	327399854
12	NC_015322	GCAA	2	8	6004	6011	50 %	0 %	25 %	25 %	327399854
13	NC_015322	TCTT	2	8	6830	6837	0 %	75 %	0 %	25 %	327399855
14	NC_015322	CTTG	2	8	7035	7042	0 %	50 %	25 %	25 %	327399855
15	NC_015322	AATT	2	8	8319	8326	50 %	50 %	0 %	0 %	327399856
16	NC_015322	GAAT	2	8	8424	8431	50 %	25 %	25 %	0 %	327399856
17	NC_015322	AAGA	2	8	9319	9326	75 %	0 %	25 %	0 %	327399858
18	NC_015322	TAAA	2	8	10124	10131	75 %	25 %	0 %	0 %	327399861
19	NC_015322	CCAA	2	8	11486	11493	50 %	0 %	0 %	50 %	327399863
20	NC_015322	ATTA	2	8	11684	11691	50 %	50 %	0 %	0 %	327399863
21	NC_015322	TCGG	2	8	11790	11797	0 %	25 %	50 %	25 %	327399863
22	NC_015322	AAAG	2	8	11927	11934	75 %	0 %	25 %	0 %	327399863
23	NC_015322	CAAA	2	8	12039	12046	75 %	0 %	0 %	25 %	327399863
24	NC_015322	GGCT	2	8	12332	12339	0 %	25 %	50 %	25 %	327399864
25	NC_015322	ATAC	2	8	12460	12467	50 %	25 %	0 %	25 %	327399864
26	NC_015322	TAAA	2	8	12743	12750	75 %	25 %	0 %	0 %	327399864
27	NC_015322	AAAC	2	8	13392	13399	75 %	0 %	0 %	25 %	327399865
28	NC_015322	AAAT	2	8	14323	14330	75 %	25 %	0 %	0 %	327399866
29	NC_015322	AATC	2	8	14335	14342	50 %	25 %	0 %	25 %	327399866
30	NC_015322	TCTT	2	8	14393	14400	0 %	75 %	0 %	25 %	327399866
31	NC_015322	AATT	2	8	14596	14603	50 %	50 %	0 %	0 %	327399866
32	NC_015322	TTCT	2	8	14916	14923	0 %	75 %	0 %	25 %	327399866
33	NC_015322	CTGC	2	8	15010	15017	0 %	25 %	25 %	50 %	327399866
34	NC_015322	ACTG	2	8	15112	15119	25 %	25 %	25 %	25 %	327399866
35	NC_015322	ATTA	2	8	16137	16144	50 %	50 %	0 %	0 %	327399867
36	NC_015322	GCTT	2	8	16168	16175	0 %	50 %	25 %	25 %	327399867
37	NC_015322	ATTT	2	8	16349	16356	25 %	75 %	0 %	0 %	327399867
38	NC_015322	TCTT	2	8	16465	16472	0 %	75 %	0 %	25 %	327399867
39	NC_015322	ACTA	2	8	16698	16705	50 %	25 %	0 %	25 %	327399867
40	NC_015322	GTTT	2	8	16993	17000	0 %	75 %	25 %	0 %	327399867
41	NC_015322	CCAC	2	8	17017	17024	25 %	0 %	0 %	75 %	327399867
42	NC_015322	TCGA	2	8	17726	17733	25 %	25 %	25 %	25 %	327399869
43	NC_015322	TCTT	2	8	17988	17995	0 %	75 %	0 %	25 %	327399870
44	NC_015322	TTGA	2	8	19142	19149	25 %	50 %	25 %	0 %	327399871
45	NC_015322	TAAA	2	8	23066	23073	75 %	25 %	0 %	0 %	327399877

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.