MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid2

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015322	AGA	2	6	1000	1005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399852
2	NC_015322	ATG	3	9	1131	1139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399852
3	NC_015322	AGA	3	9	1408	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399852
4	NC_015322	ATG	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399853
5	NC_015322	CAT	3	9	2070	2078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399853
6	NC_015322	CAA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399853
7	NC_015322	TTC	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399853
8	NC_015322	CTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399853
9	NC_015322	AAG	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399853
10	NC_015322	ACC	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399853
11	NC_015322	AAC	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399853
12	NC_015322	TAT	2	6	2955	2960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399853
13	NC_015322	TCT	2	6	2969	2974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399853
14	NC_015322	TAA	2	6	2987	2992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399853
15	NC_015322	ATC	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399853
16	NC_015322	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399853
17	NC_015322	ATT	2	6	3130	3135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399853
18	NC_015322	ATA	2	6	3145	3150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399853
19	NC_015322	CTT	2	6	3208	3213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399853
20	NC_015322	ATA	2	6	3232	3237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399853
21	NC_015322	CAC	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399853
22	NC_015322	TTA	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399853
23	NC_015322	TCT	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399853
24	NC_015322	ATC	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399853
25	NC_015322	AAT	2	6	3456	3461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399853
26	NC_015322	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399853
27	NC_015322	CTA	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399853
28	NC_015322	AGC	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399853
29	NC_015322	TAT	2	6	3786	3791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399853
30	NC_015322	ATT	2	6	3793	3798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399853
31	NC_015322	TTG	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399853
32	NC_015322	GGT	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399853
33	NC_015322	TTG	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399853
34	NC_015322	TGA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399853
35	NC_015322	TTA	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399853
36	NC_015322	TTG	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399853
37	NC_015322	GTT	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399853
38	NC_015322	AAT	2	6	4515	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399853
39	NC_015322	TCC	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399854
40	NC_015322	TTA	2	6	4639	4644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
41	NC_015322	TTA	2	6	4654	4659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
42	NC_015322	CAT	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
43	NC_015322	TCA	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
44	NC_015322	TCT	2	6	4909	4914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399854
45	NC_015322	CCG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327399854
46	NC_015322	TGC	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399854
47	NC_015322	GTT	2	6	5107	5112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399854
48	NC_015322	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399854
49	NC_015322	TAA	2	6	5165	5170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399854
50	NC_015322	TTG	2	6	5280	5285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399854
51	NC_015322	CAT	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
52	NC_015322	TCT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399854
53	NC_015322	ATT	2	6	5436	5441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
54	NC_015322	CAT	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
55	NC_015322	CTG	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399854
56	NC_015322	ATT	2	6	5568	5573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
57	NC_015322	ATT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
58	NC_015322	TCA	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
59	NC_015322	TAT	2	6	5808	5813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
60	NC_015322	ATA	2	6	5828	5833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399854
61	NC_015322	TTC	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399854
62	NC_015322	ATA	2	6	5937	5942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399854
63	NC_015322	ATT	2	6	6012	6017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
64	NC_015322	TAA	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399854
65	NC_015322	GCA	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399854
66	NC_015322	ATT	2	6	6288	6293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
67	NC_015322	TAG	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399854
68	NC_015322	TCA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
69	NC_015322	ATT	2	6	6447	6452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399854
70	NC_015322	CAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399854
71	NC_015322	TAA	2	6	6516	6521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399854
72	NC_015322	AAC	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399855
73	NC_015322	TTG	2	6	6679	6684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399855
74	NC_015322	GCT	2	6	6729	6734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399855
75	NC_015322	ATT	2	6	6742	6747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399855
76	NC_015322	TCT	2	6	6801	6806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399855
77	NC_015322	GAA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399855
78	NC_015322	CTT	2	6	6855	6860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399855
79	NC_015322	GAA	2	6	6924	6929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399855
80	NC_015322	TTC	2	6	6931	6936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399855
81	NC_015322	TTC	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399855
82	NC_015322	ATC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399855
83	NC_015322	CAT	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399855
84	NC_015322	ACA	2	6	8205	8210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399856
85	NC_015322	GTT	2	6	8446	8451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399856
86	NC_015322	AAG	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399856
87	NC_015322	AGT	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399856
88	NC_015322	TCA	2	6	8570	8575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399856
89	NC_015322	GGT	2	6	8589	8594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399856
90	NC_015322	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399856
91	NC_015322	GAT	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399856
92	NC_015322	AAT	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399856
93	NC_015322	GAA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399857
94	NC_015322	GTT	2	6	9055	9060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399857
95	NC_015322	GAC	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399857
96	NC_015322	GTT	2	6	9127	9132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399857
97	NC_015322	AAT	2	6	9143	9148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399857
98	NC_015322	CAG	2	6	9266	9271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399858
99	NC_015322	AAT	2	6	9416	9421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399858
100	NC_015322	TGC	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399859
101	NC_015322	ATT	2	6	10133	10138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399861
102	NC_015322	GAA	2	6	10173	10178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399861
103	NC_015322	AGA	2	6	10329	10334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399861
104	NC_015322	ATA	2	6	10466	10471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399861
105	NC_015322	CTA	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399861
106	NC_015322	TAC	2	6	10559	10564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399861
107	NC_015322	TTA	2	6	10768	10773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399862
108	NC_015322	GAA	2	6	10867	10872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399862
109	NC_015322	TTA	2	6	10880	10885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399862
110	NC_015322	TGC	2	6	10989	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399862
111	NC_015322	CAA	2	6	10999	11004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399862
112	NC_015322	CAC	2	6	11014	11019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399862
113	NC_015322	TGT	3	9	11022	11030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399862
114	NC_015322	GCT	2	6	11074	11079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399862
115	NC_015322	GAA	2	6	11455	11460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399863
116	NC_015322	TGA	2	6	11494	11499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399863
117	NC_015322	TGA	2	6	11662	11667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399863
118	NC_015322	GCT	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399863
119	NC_015322	CAA	2	6	11775	11780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399863
120	NC_015322	AAG	2	6	11864	11869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399863
121	NC_015322	CAT	2	6	11956	11961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399863
122	NC_015322	TGG	2	6	12068	12073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399863
123	NC_015322	TGT	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399863
124	NC_015322	GAC	2	6	12137	12142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399863
125	NC_015322	AAG	2	6	12223	12228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399863
126	NC_015322	TCA	2	6	12346	12351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399864
127	NC_015322	TAT	2	6	12373	12378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399864
128	NC_015322	AAC	2	6	12492	12497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399864
129	NC_015322	ACT	2	6	12544	12549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399864
130	NC_015322	TTC	2	6	12880	12885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399864
131	NC_015322	TAC	2	6	12889	12894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399864
132	NC_015322	ATG	2	6	12899	12904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399864
133	NC_015322	AGC	2	6	13017	13022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399864
134	NC_015322	AGA	2	6	13341	13346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399865
135	NC_015322	ATG	3	9	13472	13480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399865
136	NC_015322	AGA	3	9	13749	13757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399865
137	NC_015322	ATT	2	6	14281	14286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399866
138	NC_015322	CTT	2	6	14556	14561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399866
139	NC_015322	CTT	2	6	14876	14881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399866
140	NC_015322	TAT	2	6	14882	14887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399866
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143	NC_015322	TAT	2	6	15091	15096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399866
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155	NC_015322	CTT	3	9	15906	15914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399867
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161	NC_015322	TCT	2	6	16121	16126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399867
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231	NC_015322	CAA	2	6	23941	23946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399878
232	NC_015322	CAC	2	6	23956	23961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399878
233	NC_015322	TGT	3	9	23964	23972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399878
234	NC_015322	GCT	2	6	24016	24021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399878

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.