MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015322	AC	3	6	155	160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015322	TA	3	6	492	497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015322	TC	3	6	770	775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015322	CG	3	6	790	795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015322	AG	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015322	GA	3	6	1560	1565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015322	CT	3	6	2876	2881	0 %	50 %	0 %	50 %	327399853
8	NC_015322	TA	3	6	3219	3224	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
9	NC_015322	TA	3	6	3861	3866	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
10	NC_015322	AT	3	6	4153	4158	50 %	50 %	0 %	0 %	327399853
11	NC_015322	TA	3	6	5507	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	327399854
12	NC_015322	AT	3	6	5955	5960	50 %	50 %	0 %	0 %	327399854
13	NC_015322	AT	3	6	6256	6261	50 %	50 %	0 %	0 %	327399854
14	NC_015322	AT	3	6	6496	6501	50 %	50 %	0 %	0 %	327399854
15	NC_015322	AT	3	6	7925	7930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015322	TA	3	6	8546	8551	50 %	50 %	0 %	0 %	327399856
17	NC_015322	AT	3	6	8762	8767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015322	AT	3	6	8885	8890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015322	GA	3	6	8919	8924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015322	AC	3	6	9839	9844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015322	GC	3	6	9924	9929	0 %	0 %	50 %	50 %	327399861
22	NC_015322	GC	4	8	10261	10268	0 %	0 %	50 %	50 %	327399861
23	NC_015322	TA	3	6	10360	10365	50 %	50 %	0 %	0 %	327399861
24	NC_015322	AT	3	6	12286	12291	50 %	50 %	0 %	0 %	327399863
25	NC_015322	AC	3	6	12496	12501	50 %	0 %	0 %	50 %	327399864
26	NC_015322	TA	3	6	12833	12838	50 %	50 %	0 %	0 %	327399864
27	NC_015322	TC	3	6	13111	13116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015322	CG	3	6	13131	13136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015322	AG	3	6	13895	13900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015322	GA	3	6	13901	13906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015322	TA	3	6	14204	14209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015322	AT	3	6	15822	15827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015322	TA	3	6	17099	17104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015322	AT	4	8	19399	19406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015322	TA	3	6	19434	19439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015322	TA	3	6	19538	19543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015322	TA	3	6	19555	19560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015322	AT	3	6	19682	19687	50 %	50 %	0 %	0 %	327399872
39	NC_015322	TA	3	6	19838	19843	50 %	50 %	0 %	0 %	327399872
40	NC_015322	AT	3	6	20118	20123	50 %	50 %	0 %	0 %	327399872
41	NC_015322	AT	3	6	20483	20488	50 %	50 %	0 %	0 %	327399872
42	NC_015322	TA	3	6	20662	20667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015322	TA	3	6	20754	20759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015322	TA	3	6	20771	20776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015322	AT	3	6	21147	21152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015322	AT	3	6	21169	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015322	TG	3	6	21266	21271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015322	AT	3	6	21811	21816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015322	GA	3	6	21846	21851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015322	AT	3	6	22078	22083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015322	AC	3	6	22781	22786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015322	GC	3	6	22866	22871	0 %	0 %	50 %	50 %	327399877
53	NC_015322	GC	4	8	23203	23210	0 %	0 %	50 %	50 %	327399877
54	NC_015322	TA	3	6	23302	23307	50 %	50 %	0 %	0 %	327399877
55	NC_015322	AT	3	6	25229	25234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.