MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fluviicola taffensis DSM 16823 chromosome

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015321	GATTTA	2	12	4235	4246	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015321	AAATTA	2	12	26598	26609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015321	TATATT	2	12	57985	57996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015321	GGTTGT	2	12	158685	158696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015321	TCTTTT	2	12	186874	186885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015321	ATTATC	2	12	268031	268042	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015321	TTTGTT	2	12	286099	286110	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015321	TTTAAA	2	12	319411	319422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015321	TGTTTC	2	12	337527	337538	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015321	TAGAAT	2	12	387667	387678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015321	GTATTA	2	12	401439	401450	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015321	TGAATT	2	12	431132	431143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015321	GAAAAA	2	12	441591	441602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015321	TTTTCA	2	12	442334	442345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015321	TTCAAT	2	12	455256	455267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015321	AAATTA	2	12	459324	459335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015321	GATTTG	2	12	503418	503429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015321	CAATTC	2	12	532826	532837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015321	TCACTT	2	12	623691	623702	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015321	AGCAAC	2	12	674191	674202	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015321	ATTTTG	2	12	674435	674446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015321	CTTTTA	2	12	676482	676493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015321	AGCCAT	2	12	679490	679501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015321	AGAAAT	2	12	729603	729614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015321	TTTAGT	2	12	788992	789003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015321	TCAAAT	2	12	818931	818942	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015321	GTAAAA	2	12	825803	825814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015321	CCATCT	2	12	852304	852315	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015321	CAAACA	2	12	958160	958171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015321	AAAGCT	2	12	1010171	1010182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015321	TAAAAA	2	12	1019314	1019325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015321	CATTCA	2	12	1101940	1101951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015321	TAAAAT	2	12	1115466	1115477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015321	AGAACG	2	12	1134313	1134324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015321	AAAAAG	2	12	1146387	1146398	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015321	CTTTTT	2	12	1146419	1146430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015321	AAAAAG	2	12	1151667	1151678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015321	CTTTTT	2	12	1151699	1151710	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015321	AAAAAG	2	12	1154154	1154165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015321	TCTTTT	2	12	1154189	1154200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015321	AAAGAG	2	12	1184453	1184464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015321	TTTTGT	2	12	1184520	1184531	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015321	TAAAAA	2	12	1205743	1205754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015321	TCTACT	2	12	1218116	1218127	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015321	CAAAAC	2	12	1222018	1222029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015321	TATACC	2	12	1255724	1255735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015321	TTATTT	2	12	1304959	1304970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015321	AATTTA	2	12	1392208	1392219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015321	TTTTAA	2	12	1444908	1444919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015321	TAAATA	2	12	1492678	1492689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015321	AAAAAG	2	12	1515970	1515981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015321	TTCTCA	2	12	1539262	1539273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015321	TCACAC	2	12	1542492	1542503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015321	GTTTTC	2	12	1561890	1561901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015321	TACAAA	2	12	1604820	1604831	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015321	AAGTAA	2	12	1606441	1606452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015321	TCCATA	2	12	1685454	1685465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015321	AAATAC	2	12	1765205	1765216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015321	GTAAAA	2	12	1775006	1775017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015321	CAAAAA	2	12	1780238	1780249	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015321	GAATCG	2	12	1812141	1812152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015321	TAAAAT	2	12	1864603	1864614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015321	CAATAT	2	12	1867198	1867209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015321	TAAAGT	2	12	1879363	1879374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015321	TAAAAA	2	12	1895576	1895587	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015321	ACTTCG	2	12	1925808	1925819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015321	AGATTG	2	12	1930181	1930192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015321	ATAAAA	2	12	2023113	2023124	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015321	TTAAAA	2	12	2023238	2023249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015321	AACGAA	2	12	2185205	2185216	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015321	AAGTAT	2	12	2250479	2250490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015321	TTTTGA	2	12	2305174	2305185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015321	AGCAAC	2	12	2326169	2326180	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015321	TAGAAT	2	12	2439446	2439457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015321	TAATTT	2	12	2557340	2557351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015321	GTCTTC	2	12	2570332	2570343	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015321	GAATTT	2	12	2624758	2624769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015321	AGTTGG	2	12	2643449	2643460	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015321	TTGTTT	2	12	2650785	2650796	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015321	TAAATG	2	12	2662750	2662761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015321	TTAAAA	2	12	2747771	2747782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015321	GTAAAA	2	12	2752136	2752147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015321	AAGCGA	2	12	2755367	2755378	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015321	GTTTTT	2	12	2785410	2785421	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015321	CATTTC	2	12	2797097	2797108	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015321	GTAAAA	2	12	2875724	2875735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015321	AAGCGA	2	12	2878805	2878816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015321	TATAAA	2	12	2889633	2889644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015321	AATAAA	2	12	2912296	2912307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015321	AAAAAG	2	12	2928521	2928532	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015321	ACATTT	2	12	3007823	3007834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015321	ATCAAA	2	12	3021041	3021052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015321	AAACGA	2	12	3022313	3022324	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015321	TGAATG	2	12	3087119	3087130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015321	ATTAAA	2	12	3105327	3105338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015321	TTTTTC	2	12	3123485	3123496	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015321	AAAAAG	2	12	3138323	3138334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015321	CAAAAA	2	12	3166009	3166020	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015321	CTTTTC	2	12	3351652	3351663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015321	TTTTGG	2	12	3356170	3356181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015321	TAATTT	2	12	3356216	3356227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015321	AAATCA	2	12	3416349	3416360	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015321	TTCGTA	2	12	3477488	3477499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015321	ACTTTT	2	12	3485000	3485011	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015321	GATAGA	2	12	3493072	3493083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015321	GAATAT	2	12	3519371	3519382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015321	AAACTT	2	12	3540967	3540978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015321	TTTAGT	2	12	3554767	3554778	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015321	ATTTTT	2	12	3554822	3554833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015321	ACAAAA	2	12	3602271	3602282	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015321	TGTGTT	2	12	3602523	3602534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015321	ACATCA	2	12	3603507	3603518	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015321	TGTAAG	2	12	3723850	3723861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015321	TGGAAA	2	12	3745993	3746004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015321	TCCTTT	2	12	3763788	3763799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015321	TAAAAA	2	12	3816779	3816790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015321	ATTTCT	2	12	3840850	3840861	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015321	ATCAAT	2	12	3845759	3845770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015321	AAAATA	2	12	3850164	3850175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015321	AATCGA	2	12	3897184	3897195	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015321	AATTTC	2	12	3937790	3937801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015321	TAAAAA	2	12	3943331	3943342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015321	TTTCTC	2	12	4033252	4033263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015321	CAAACA	2	12	4095070	4095081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015321	AAGAGG	2	12	4131080	4131091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015321	TCAAAA	2	12	4138675	4138686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015321	TTTTTC	2	12	4157084	4157095	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015321	TGAAAA	2	12	4168622	4168633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015321	TTTCTA	2	12	4177159	4177170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015321	TTGAAT	2	12	4189755	4189766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015321	TTTGCA	2	12	4214736	4214747	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015321	GGTTGT	2	12	4220921	4220932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015321	TACACA	2	12	4225537	4225548	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015321	GGTTGT	2	12	4226694	4226705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015321	GGTTGT	2	12	4228926	4228937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015321	TCAGTG	2	12	4248054	4248065	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015321	GGTTGT	2	12	4257364	4257375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015321	AGGAAG	2	12	4258386	4258397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015321	GCCGAA	2	12	4264505	4264516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015321	AAAATC	2	12	4278582	4278593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_015321	GATCGT	2	12	4286936	4286947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_015321	GATCGT	2	12	4287232	4287243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_015321	TACACA	2	12	4299900	4299911	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015321	AATTAA	2	12	4376588	4376599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015321	TAATTC	2	12	4396437	4396448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_015321	TACAAA	2	12	4406884	4406895	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015321	GTTTTG	2	12	4408726	4408737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015321	GAATTT	2	12	4411357	4411368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015321	AATTTT	2	12	4421862	4421873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015321	TTCATT	2	12	4482723	4482734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_015321	TTTTTA	2	12	4512823	4512834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.