MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Fluviicola taffensis DSM 16823 chromosome

Total Repeats: 1777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015321	CGAGAA	2	12	1306939	1306950	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	327403160
502	NC_015321	ATTTCC	2	12	1307196	1307207	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	327403160
503	NC_015321	TTCGCT	2	12	1309854	1309865	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	327403162
504	NC_015321	ATGGCA	2	12	1314302	1314313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327403166
505	NC_015321	CATCTG	2	12	1317173	1317184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327403168
506	NC_015321	CAATGT	2	12	1325753	1325764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327403174
507	NC_015321	TCTACT	2	12	1327299	1327310	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	327403176
508	NC_015321	AACAAT	2	12	1328970	1328981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	327403177
509	NC_015321	AACAGA	2	12	1332499	1332510	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	327403178
510	NC_015321	CCAAGC	2	12	1333366	1333377	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	327403179
511	NC_015321	AAAATT	2	12	1340292	1340303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327403186
512	NC_015321	CAGATG	2	12	1341077	1341088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327403187
513	NC_015321	GATCAA	2	12	1349659	1349670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403193
514	NC_015321	AAATTC	2	12	1350019	1350030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403194
515	NC_015321	TGAAAC	2	12	1354330	1354341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403197
516	NC_015321	CCTCTT	2	12	1354765	1354776	0 %	50 %	0 %	50 %	327403198
517	NC_015321	CCTGTT	2	12	1363525	1363536	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	327403204
518	NC_015321	AATCAG	2	12	1363925	1363936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403204
519	NC_015321	ATTTTC	2	12	1373499	1373510	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327403208
520	NC_015321	GGTTAT	2	12	1375164	1375175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	327403209
521	NC_015321	TTGAAT	2	12	1377538	1377549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	327403211
522	NC_015321	TTGGAC	2	12	1378328	1378339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327403211
523	NC_015321	TGGACT	2	12	1380721	1380732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327403212
524	NC_015321	AATTAC	2	12	1385530	1385541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403216
525	NC_015321	TTTGAT	2	12	1391013	1391024	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403220
526	NC_015321	TTTTCC	2	12	1392531	1392542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327403221
527	NC_015321	AAAAGG	2	12	1392896	1392907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403222
528	NC_015321	CTGGGG	2	12	1395253	1395264	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	327403225
529	NC_015321	ACTAAT	2	12	1398794	1398805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403230
530	NC_015321	GATTTT	2	12	1399701	1399712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403232
531	NC_015321	CAATGA	2	12	1402215	1402226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403233
532	NC_015321	AGACAA	2	12	1406098	1406109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	327403234
533	NC_015321	TTCTTT	2	12	1407454	1407465	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	327403236
534	NC_015321	GTATGA	2	12	1411728	1411739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327403240
535	NC_015321	AGCATT	2	12	1414531	1414542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327403242
536	NC_015321	TTATTG	2	12	1417194	1417205	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403246
537	NC_015321	CAACTT	2	12	1423780	1423791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327403253
538	NC_015321	GATGCG	2	12	1424115	1424126	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327403253
539	NC_015321	TACAAT	2	12	1425839	1425850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403255
540	NC_015321	TTCAAA	2	12	1426430	1426441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403256
541	NC_015321	AATACG	2	12	1428322	1428333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403257
542	NC_015321	AAACGC	2	12	1429032	1429043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	327403257
543	NC_015321	TAACTT	2	12	1432081	1432092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	327403260
544	NC_015321	TGAAGG	2	12	1435310	1435321	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	327403264
545	NC_015321	CAGATT	2	12	1437225	1437236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327403267
546	NC_015321	CAGCAA	2	12	1445570	1445581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	327403278
547	NC_015321	AACAGA	2	12	1445736	1445747	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	327403278
548	NC_015321	TTGGAA	2	12	1446087	1446098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327403278
549	NC_015321	GAAGCA	2	12	1446895	1446906	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	327403278
550	NC_015321	AAGGAA	2	12	1448359	1448370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403279
551	NC_015321	ATACGA	2	12	1448465	1448476	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403279
552	NC_015321	AAAAGA	2	12	1448660	1448671	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	327403279
553	NC_015321	TTGTCT	2	12	1449393	1449404	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	327403279
554	NC_015321	TAAATC	2	12	1449519	1449530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403280
555	NC_015321	TCTATT	2	12	1449642	1449653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327403280
556	NC_015321	TCCAGC	2	12	1457007	1457018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	327403288
557	NC_015321	TTTGAT	2	12	1458306	1458317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403288
558	NC_015321	CGCACA	2	12	1459392	1459403	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	327403289
559	NC_015321	GGTTTT	2	12	1460749	1460760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327403290
560	NC_015321	AAGGAA	2	12	1461074	1461085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403290
561	NC_015321	GATCCA	2	12	1462760	1462771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327403293
562	NC_015321	ATTGGT	2	12	1463451	1463462	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	327403294
563	NC_015321	CTGCGG	2	12	1465735	1465746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	327403294
564	NC_015321	AACTGG	2	12	1468587	1468598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327403296
565	NC_015321	CCCAAC	2	12	1469010	1469021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327403296
566	NC_015321	CATAAA	2	12	1469834	1469845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	327403297
567	NC_015321	ACGGAA	2	12	1470303	1470314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	327403297
568	NC_015321	GCGCCT	2	12	1470622	1470633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327403297
569	NC_015321	GCTTAT	2	12	1471958	1471969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327403299
570	NC_015321	TGCTCC	2	12	1477703	1477714	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	327403305
571	NC_015321	TTAAAA	2	12	1479508	1479519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327403306
572	NC_015321	AACTGA	2	12	1489089	1489100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403317
573	NC_015321	AAGAAA	2	12	1489226	1489237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	327403317
574	NC_015321	ATATTT	2	12	1489859	1489870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327403319
575	NC_015321	CTGAAT	2	12	1490992	1491003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327403319
576	NC_015321	ATAATT	2	12	1491020	1491031	50 %	50 %	0 %	0 %	327403319
577	NC_015321	TTTGGG	2	12	1493574	1493585	0 %	50 %	50 %	0 %	327403320
578	NC_015321	GAGCAA	2	12	1493869	1493880	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	327403320
579	NC_015321	TGAAAT	2	12	1495552	1495563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	327403321
580	NC_015321	TGTAAT	2	12	1498444	1498455	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	327403323
581	NC_015321	TTTCAT	2	12	1500366	1500377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327403323
582	NC_015321	TTTCGC	2	12	1501851	1501862	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	327403324
583	NC_015321	AAATCA	2	12	1502232	1502243	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	327403324
584	NC_015321	ACTTTT	2	12	1503710	1503721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327403325
585	NC_015321	TGGAAT	2	12	1510328	1510339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327403330
586	NC_015321	TCTTCA	2	12	1512529	1512540	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	327403333
587	NC_015321	TTGCAT	2	12	1512604	1512615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327403333
588	NC_015321	AAAAGG	2	12	1513923	1513934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403335
589	NC_015321	TGCCAT	2	12	1516173	1516184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327403337
590	NC_015321	CAAAAA	2	12	1521646	1521657	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	327403341
591	NC_015321	GATAAA	2	12	1527154	1527165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327403347
592	NC_015321	AATGAC	2	12	1536226	1536237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327403355
593	NC_015321	TAAACC	2	12	1537373	1537384	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	327403356
594	NC_015321	TTGCCC	2	12	1540082	1540093	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	327403357
595	NC_015321	TTTGGT	2	12	1540240	1540251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327403357
596	NC_015321	CATTTC	2	12	1540682	1540693	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	327403358
597	NC_015321	TCTTTG	2	12	1543524	1543535	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	327403361
598	NC_015321	TGCATT	2	12	1544552	1544563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327403361
599	NC_015321	TATTCC	2	12	1546134	1546145	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	327403363
600	NC_015321	CGTGAA	2	12	1547546	1547557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327403364
601	NC_015321	TACACT	2	12	1550499	1550510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327403366
602	NC_015321	TTGGTT	2	12	1555069	1555080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327403369
603	NC_015321	CATCGT	2	12	1556916	1556927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327403371
604	NC_015321	GTATTC	2	12	1557113	1557124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327403371
605	NC_015321	TGTAGT	2	12	1560307	1560318	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	327403374
606	NC_015321	CATAAT	2	12	1562418	1562429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327403376
607	NC_015321	ACTGTT	2	12	1562621	1562632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327403376
608	NC_015321	ATATCT	2	12	1563598	1563609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	327403377
609	NC_015321	CCTTTA	2	12	1566082	1566093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	327403381
610	NC_015321	TGTAAC	2	12	1566390	1566401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327403381
611	NC_015321	GATCAG	2	12	1566452	1566463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327403381
612	NC_015321	TTTGTA	2	12	1571035	1571046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403384
613	NC_015321	ATAAGA	2	12	1572748	1572759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327403386
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717	NC_015321	GGAAAA	2	12	1837346	1837357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403597
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719	NC_015321	ATGCCA	2	12	1838643	1838654	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327403598
720	NC_015321	TGGTGT	2	12	1839000	1839011	0 %	50 %	50 %	0 %	327403599
721	NC_015321	CTACAA	2	12	1839201	1839212	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	327403599
722	NC_015321	ATCCAT	2	12	1841234	1841245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327403600
723	NC_015321	AGCAAA	2	12	1842979	1842990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	327403603
724	NC_015321	AAGGAA	2	12	1845275	1845286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403606
725	NC_015321	ACGAAC	2	12	1846650	1846661	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	327403607
726	NC_015321	CAGGAA	2	12	1849464	1849475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	327403610
727	NC_015321	TGAATT	2	12	1857265	1857276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	327403614
728	NC_015321	ATTGAT	2	12	1864166	1864177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	327403617
729	NC_015321	TTTGAC	2	12	1865834	1865845	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327403619
730	NC_015321	AATCAA	2	12	1872169	1872180	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	327403624
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749	NC_015321	ATTTAA	2	12	1913613	1913624	50 %	50 %	0 %	0 %	327403662
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752	NC_015321	ACACCA	2	12	1929372	1929383	50 %	0 %	0 %	50 %	327403674
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821	NC_015321	TGATGC	2	12	2111267	2111278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327403821
822	NC_015321	AAATTA	2	12	2113085	2113096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327403823
823	NC_015321	TTTGAT	2	12	2113124	2113135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403823
824	NC_015321	AAAGAT	2	12	2116640	2116651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327403823
825	NC_015321	AATTTG	2	12	2130030	2130041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	327403833
826	NC_015321	ATTTTG	2	12	2130162	2130173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	327403833
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828	NC_015321	AATGAA	2	12	2135080	2135091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327403844
829	NC_015321	TGAAAT	2	12	2139258	2139269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	327403852
830	NC_015321	GAAAAA	2	12	2139355	2139366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	327403852
831	NC_015321	AAAGGA	2	12	2142766	2142777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327403854
832	NC_015321	AGAACA	2	12	2143314	2143325	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	327403854
833	NC_015321	TAAAAA	2	12	2144225	2144236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	327403855
834	NC_015321	CCAAAT	2	12	2144566	2144577	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	327403856
835	NC_015321	GGAATT	2	12	2149129	2149140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327403860
836	NC_015321	CAATTT	2	12	2152673	2152684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	327403863
837	NC_015321	TTATCT	2	12	2160736	2160747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327403871
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840	NC_015321	AATCGC	2	12	2165620	2165631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327403875
841	NC_015321	CTTTTT	2	12	2167433	2167444	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	327403877
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863	NC_015321	CAACCA	2	12	2211081	2211092	50 %	0 %	0 %	50 %	327403918
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930	NC_015321	GATGGA	2	12	2350412	2350423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	327404030
931	NC_015321	GATGGA	3	18	2350538	2350555	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	327404030
932	NC_015321	CGATTA	2	12	2352071	2352082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327404032
933	NC_015321	AAAGAT	2	12	2352114	2352125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327404032
934	NC_015321	TTTTCT	2	12	2352988	2352999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	327404032
935	NC_015321	TAGGAT	2	12	2355107	2355118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327404034
936	NC_015321	AACCTA	2	12	2356795	2356806	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	327404035
937	NC_015321	ATTTCT	2	12	2357448	2357459	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327404035
938	NC_015321	CTCCAG	2	12	2357548	2357559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	327404035
939	NC_015321	GTTCTG	2	12	2358430	2358441	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	327404035
940	NC_015321	TTGTTT	2	12	2359207	2359218	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	327404035
941	NC_015321	AATAAA	2	12	2362763	2362774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	327404039
942	NC_015321	TGGCAT	2	12	2363596	2363607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327404039
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944	NC_015321	TTGTCT	2	12	2366575	2366586	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	327404042
945	NC_015321	TGCAAC	2	12	2366610	2366621	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327404042
946	NC_015321	AGTTTA	2	12	2368053	2368064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	327404043
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974	NC_015321	CTTTTA	2	12	2433285	2433296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327404089
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