MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Fluviicola taffensis DSM 16823 chromosome

Total Repeats: 3935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015321	CATTA	2	10	211	220	40 %	40 %	0 %	20 %	327402012
2	NC_015321	GAAAA	2	10	788	797	80 %	0 %	20 %	0 %	327402012
3	NC_015321	GAAAA	2	10	982	991	80 %	0 %	20 %	0 %	327402012
4	NC_015321	GAAAT	2	10	2834	2843	60 %	20 %	20 %	0 %	327402014
5	NC_015321	GTATA	2	10	3876	3885	40 %	40 %	20 %	0 %	327402014
6	NC_015321	TATAA	2	10	3918	3927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015321	AAATA	2	10	6272	6281	80 %	20 %	0 %	0 %	327402018
8	NC_015321	TTCTC	2	10	6714	6723	0 %	60 %	0 %	40 %	327402019
9	NC_015321	TCAAA	2	10	6970	6979	60 %	20 %	0 %	20 %	327402019
10	NC_015321	TTGAA	2	10	7907	7916	40 %	40 %	20 %	0 %	327402020
11	NC_015321	AATAA	2	10	10040	10049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015321	CTTTT	2	10	10468	10477	0 %	80 %	0 %	20 %	327402021
13	NC_015321	TTTTC	2	10	11308	11317	0 %	80 %	0 %	20 %	327402022
14	NC_015321	TTTTG	2	10	11422	11431	0 %	80 %	20 %	0 %	327402022
15	NC_015321	GAATC	2	10	11830	11839	40 %	20 %	20 %	20 %	327402022
16	NC_015321	AAAAC	2	10	13451	13460	80 %	0 %	0 %	20 %	327402023
17	NC_015321	TGGTG	2	10	13624	13633	0 %	40 %	60 %	0 %	327402023
18	NC_015321	TTGAT	2	10	13863	13872	20 %	60 %	20 %	0 %	327402023
19	NC_015321	GTGAT	2	10	14333	14342	20 %	40 %	40 %	0 %	327402024
20	NC_015321	TACCA	2	10	16634	16643	40 %	20 %	0 %	40 %	327402027
21	NC_015321	CGAAA	2	10	16719	16728	60 %	0 %	20 %	20 %	327402027
22	NC_015321	ATTCT	2	10	17791	17800	20 %	60 %	0 %	20 %	327402027
23	NC_015321	TTGTT	2	10	19708	19717	0 %	80 %	20 %	0 %	327402029
24	NC_015321	TCCCT	2	10	20266	20275	0 %	40 %	0 %	60 %	327402029
25	NC_015321	CAGAG	2	10	20873	20882	40 %	0 %	40 %	20 %	327402030
26	NC_015321	AGATT	2	10	21042	21051	40 %	40 %	20 %	0 %	327402030
27	NC_015321	ATGGG	2	10	24619	24628	20 %	20 %	60 %	0 %	327402033
28	NC_015321	TATGA	2	10	25576	25585	40 %	40 %	20 %	0 %	327402034
29	NC_015321	CTTTT	2	10	25630	25639	0 %	80 %	0 %	20 %	327402035
30	NC_015321	TGCAA	2	10	26504	26513	40 %	20 %	20 %	20 %	327402035
31	NC_015321	CAATT	2	10	27523	27532	40 %	40 %	0 %	20 %	327402036
32	NC_015321	ATTTG	2	10	28445	28454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015321	AATTT	2	10	28468	28477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015321	GATTC	2	10	29895	29904	20 %	40 %	20 %	20 %	327402040
35	NC_015321	ATTCA	2	10	30467	30476	40 %	40 %	0 %	20 %	327402040
36	NC_015321	AATCC	2	10	30871	30880	40 %	20 %	0 %	40 %	327402040
37	NC_015321	TCAAA	2	10	31258	31267	60 %	20 %	0 %	20 %	327402040
38	NC_015321	ATTTG	2	10	33768	33777	20 %	60 %	20 %	0 %	327402043
39	NC_015321	ATAAA	2	10	36721	36730	80 %	20 %	0 %	0 %	327402046
40	NC_015321	TCTTG	2	10	37547	37556	0 %	60 %	20 %	20 %	327402047
41	NC_015321	AAAAG	2	10	39394	39403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015321	TAATC	2	10	39726	39735	40 %	40 %	0 %	20 %	327402050
43	NC_015321	CCAAC	2	10	40931	40940	40 %	0 %	0 %	60 %	327402052
44	NC_015321	ATCCA	2	10	46716	46725	40 %	20 %	0 %	40 %	327402057
45	NC_015321	TGATT	2	10	48617	48626	20 %	60 %	20 %	0 %	327402058
46	NC_015321	CAAAA	2	10	48738	48747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015321	TTTTC	2	10	49689	49698	0 %	80 %	0 %	20 %	327402060
48	NC_015321	TAATT	2	10	50380	50389	40 %	60 %	0 %	0 %	327402061
49	NC_015321	TAATC	2	10	52021	52030	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015321	CATTT	2	10	52988	52997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015321	AAATT	2	10	55396	55405	60 %	40 %	0 %	0 %	327402066
52	NC_015321	TCTTT	2	10	56422	56431	0 %	80 %	0 %	20 %	327402068
53	NC_015321	ATTCA	2	10	57041	57050	40 %	40 %	0 %	20 %	327402068
54	NC_015321	GAATT	2	10	57477	57486	40 %	40 %	20 %	0 %	327402069
55	NC_015321	AAACT	2	10	57819	57828	60 %	20 %	0 %	20 %	327402069
56	NC_015321	CTTGG	2	10	57842	57851	0 %	40 %	40 %	20 %	327402069
57	NC_015321	ATTGG	2	10	58690	58699	20 %	40 %	40 %	0 %	327402071
58	NC_015321	ATTCA	2	10	59394	59403	40 %	40 %	0 %	20 %	327402071
59	NC_015321	ATTCG	2	10	62296	62305	20 %	40 %	20 %	20 %	327402074
60	NC_015321	CCAAA	2	10	62741	62750	60 %	0 %	0 %	40 %	327402075
61	NC_015321	AACCA	2	10	64365	64374	60 %	0 %	0 %	40 %	327402076
62	NC_015321	TGTAT	2	10	65709	65718	20 %	60 %	20 %	0 %	327402078
63	NC_015321	AACAA	2	10	66166	66175	80 %	0 %	0 %	20 %	327402078
64	NC_015321	AAGAC	2	10	68764	68773	60 %	0 %	20 %	20 %	327402081
65	NC_015321	CAATT	2	10	72418	72427	40 %	40 %	0 %	20 %	327402082
66	NC_015321	ATTCA	2	10	73402	73411	40 %	40 %	0 %	20 %	327402082
67	NC_015321	TGTTT	2	10	74215	74224	0 %	80 %	20 %	0 %	327402083
68	NC_015321	ACAAT	2	10	74826	74835	60 %	20 %	0 %	20 %	327402084
69	NC_015321	ATTTT	2	10	74966	74975	20 %	80 %	0 %	0 %	327402084
70	NC_015321	ATGAA	2	10	75138	75147	60 %	20 %	20 %	0 %	327402084
71	NC_015321	ATTCG	2	10	75987	75996	20 %	40 %	20 %	20 %	327402085
72	NC_015321	AACGA	2	10	79053	79062	60 %	0 %	20 %	20 %	327402090
73	NC_015321	TTTTC	2	10	79709	79718	0 %	80 %	0 %	20 %	327402091
74	NC_015321	ATAAA	2	10	79817	79826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015321	TTTAA	2	10	80156	80165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015321	TTCAC	2	10	82019	82028	20 %	40 %	0 %	40 %	327402095
77	NC_015321	TGGGA	2	10	82513	82522	20 %	20 %	60 %	0 %	327402095
78	NC_015321	GAAAA	2	10	82728	82737	80 %	0 %	20 %	0 %	327402095
79	NC_015321	GAAAC	2	10	82832	82841	60 %	0 %	20 %	20 %	327402096
80	NC_015321	GCCTG	2	10	83947	83956	0 %	20 %	40 %	40 %	327402097
81	NC_015321	TGCAC	2	10	84508	84517	20 %	20 %	20 %	40 %	327402097
82	NC_015321	TTTTA	2	10	89179	89188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015321	TTCAA	2	10	90623	90632	40 %	40 %	0 %	20 %	327402098
84	NC_015321	TTGCT	2	10	91808	91817	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015321	CATTT	2	10	92880	92889	20 %	60 %	0 %	20 %	327402100
86	NC_015321	AATTA	2	10	93876	93885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015321	ATTCG	2	10	93895	93904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015321	CCAAA	2	10	97468	97477	60 %	0 %	0 %	40 %	327402107
89	NC_015321	ACTTC	2	10	99653	99662	20 %	40 %	0 %	40 %	327402109
90	NC_015321	AATAA	2	10	100336	100345	80 %	20 %	0 %	0 %	327402109
91	NC_015321	ACCTT	2	10	100411	100420	20 %	40 %	0 %	40 %	327402109
92	NC_015321	TCCAA	2	10	101120	101129	40 %	20 %	0 %	40 %	327402110
93	NC_015321	GAATG	2	10	103014	103023	40 %	20 %	40 %	0 %	327402112
94	NC_015321	CTCAT	2	10	104016	104025	20 %	40 %	0 %	40 %	327402112
95	NC_015321	CCATC	2	10	106255	106264	20 %	20 %	0 %	60 %	327402113
96	NC_015321	CAATC	2	10	107307	107316	40 %	20 %	0 %	40 %	327402113
97	NC_015321	TTCCA	2	10	112824	112833	20 %	40 %	0 %	40 %	327402117
98	NC_015321	GATTT	2	10	114796	114805	20 %	60 %	20 %	0 %	327402118
99	NC_015321	TAAAT	2	10	115129	115138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015321	ACCAA	2	10	116193	116202	60 %	0 %	0 %	40 %	327402119
101	NC_015321	CTAAT	2	10	118114	118123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015321	CATTT	2	10	118204	118213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015321	GGAAT	2	10	118787	118796	40 %	20 %	40 %	0 %	327402122
104	NC_015321	GATTG	2	10	120503	120512	20 %	40 %	40 %	0 %	327402124
105	NC_015321	CCATC	2	10	120689	120698	20 %	20 %	0 %	60 %	327402124
106	NC_015321	ATATT	2	10	122748	122757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015321	ACCAA	2	10	122894	122903	60 %	0 %	0 %	40 %	327402125
108	NC_015321	CCATT	2	10	123209	123218	20 %	40 %	0 %	40 %	327402126
109	NC_015321	GTTTT	2	10	123375	123384	0 %	80 %	20 %	0 %	327402127
110	NC_015321	TGCTC	2	10	123689	123698	0 %	40 %	20 %	40 %	327402127
111	NC_015321	TTCAT	2	10	125049	125058	20 %	60 %	0 %	20 %	327402129
112	NC_015321	ATTTT	2	10	126621	126630	20 %	80 %	0 %	0 %	327402130
113	NC_015321	CAATC	2	10	127332	127341	40 %	20 %	0 %	40 %	327402131
114	NC_015321	TCATT	2	10	127610	127619	20 %	60 %	0 %	20 %	327402131
115	NC_015321	ATTCA	2	10	127782	127791	40 %	40 %	0 %	20 %	327402131
116	NC_015321	TGTCT	2	10	129985	129994	0 %	60 %	20 %	20 %	327402132
117	NC_015321	ATCGA	2	10	130764	130773	40 %	20 %	20 %	20 %	327402132
118	NC_015321	TCCAA	2	10	131397	131406	40 %	20 %	0 %	40 %	327402133
119	NC_015321	ATAAA	2	10	132674	132683	80 %	20 %	0 %	0 %	327402134
120	NC_015321	TAAAA	2	10	133059	133068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015321	TTAAA	2	10	133099	133108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015321	AAATG	2	10	133213	133222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015321	CCAAC	2	10	133707	133716	40 %	0 %	0 %	60 %	327402135
124	NC_015321	TTTGG	2	10	134629	134638	0 %	60 %	40 %	0 %	327402136
125	NC_015321	CTTTC	2	10	134871	134880	0 %	60 %	0 %	40 %	327402136
126	NC_015321	TCAAA	2	10	137550	137559	60 %	20 %	0 %	20 %	327402139
127	NC_015321	TATTT	2	10	139266	139275	20 %	80 %	0 %	0 %	327402141
128	NC_015321	ATGGA	2	10	139969	139978	40 %	20 %	40 %	0 %	327402142
129	NC_015321	GTAAA	2	10	142277	142286	60 %	20 %	20 %	0 %	327402145
130	NC_015321	ATGCG	2	10	142934	142943	20 %	20 %	40 %	20 %	327402146
131	NC_015321	GGAAT	2	10	143350	143359	40 %	20 %	40 %	0 %	327402146
132	NC_015321	TGGTT	2	10	143835	143844	0 %	60 %	40 %	0 %	327402146
133	NC_015321	AAAAT	2	10	145596	145605	80 %	20 %	0 %	0 %	327402146
134	NC_015321	TATTT	2	10	146322	146331	20 %	80 %	0 %	0 %	327402147
135	NC_015321	AATTG	2	10	147115	147124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015321	TAGTT	2	10	148312	148321	20 %	60 %	20 %	0 %	327402148
137	NC_015321	TCGAT	2	10	149528	149537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015321	GGAAC	2	10	150770	150779	40 %	0 %	40 %	20 %	327402150
139	NC_015321	CTTTT	2	10	153377	153386	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015321	TCAGA	2	10	154517	154526	40 %	20 %	20 %	20 %	327402151
141	NC_015321	ATCCA	2	10	157042	157051	40 %	20 %	0 %	40 %	327402154
142	NC_015321	ATAAC	2	10	159435	159444	60 %	20 %	0 %	20 %	327402157
143	NC_015321	ATTTA	2	10	160087	160096	40 %	60 %	0 %	0 %	327402158
144	NC_015321	TAGTG	2	10	160642	160651	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015321	TATTG	2	10	161783	161792	20 %	60 %	20 %	0 %	327402160
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147	NC_015321	ATGTG	2	10	163592	163601	20 %	40 %	40 %	0 %	327402162
148	NC_015321	AACAA	2	10	164199	164208	80 %	0 %	0 %	20 %	327402163
149	NC_015321	CTTGC	2	10	164294	164303	0 %	40 %	20 %	40 %	327402163
150	NC_015321	ATTGA	2	10	164926	164935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015321	GTTTG	2	10	165092	165101	0 %	60 %	40 %	0 %	327402164
152	NC_015321	CACAA	2	10	166443	166452	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_015321	AACTA	2	10	166453	166462	60 %	20 %	0 %	20 %	327402165
154	NC_015321	CATTT	2	10	167499	167508	20 %	60 %	0 %	20 %	327402165
155	NC_015321	ACTCC	2	10	167746	167755	20 %	20 %	0 %	60 %	327402166
156	NC_015321	TGCAG	2	10	168552	168561	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_015321	AGAAA	2	10	168714	168723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015321	GAATT	2	10	168866	168875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015321	AACGA	2	10	169079	169088	60 %	0 %	20 %	20 %	327402167
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161	NC_015321	TTGGT	2	10	172379	172388	0 %	60 %	40 %	0 %	327402172
162	NC_015321	TGGAA	2	10	172439	172448	40 %	20 %	40 %	0 %	327402172
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164	NC_015321	TTCTA	2	10	174956	174965	20 %	60 %	0 %	20 %	327402175
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167	NC_015321	TCAAA	2	10	176775	176784	60 %	20 %	0 %	20 %	327402179
168	NC_015321	ATCAA	2	10	177500	177509	60 %	20 %	0 %	20 %	327402179
169	NC_015321	ATTTC	2	10	181796	181805	20 %	60 %	0 %	20 %	327402185
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172	NC_015321	GCTTG	2	10	185137	185146	0 %	40 %	40 %	20 %	327402188
173	NC_015321	TTTTC	2	10	185346	185355	0 %	80 %	0 %	20 %	327402189
174	NC_015321	GCTTT	2	10	188523	188532	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_015321	CGCTT	2	10	189411	189420	0 %	40 %	20 %	40 %	327402193
176	NC_015321	CTTTT	2	10	189447	189456	0 %	80 %	0 %	20 %	327402193
177	NC_015321	GATTT	2	10	190130	190139	20 %	60 %	20 %	0 %	327402193
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179	NC_015321	TCAAG	2	10	191855	191864	40 %	20 %	20 %	20 %	327402195
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185	NC_015321	AAATC	2	10	197780	197789	60 %	20 %	0 %	20 %	327402201
186	NC_015321	CCAAT	2	10	198764	198773	40 %	20 %	0 %	40 %	327402202
187	NC_015321	CAAAT	2	10	198991	199000	60 %	20 %	0 %	20 %	327402202
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190	NC_015321	GATTA	2	10	200604	200613	40 %	40 %	20 %	0 %	327402205
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196	NC_015321	TTGGT	2	10	206305	206314	0 %	60 %	40 %	0 %	327402213
197	NC_015321	TCACC	2	10	207331	207340	20 %	20 %	0 %	60 %	327402214
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199	NC_015321	ATTTT	2	10	210262	210271	20 %	80 %	0 %	0 %	327402216
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242	NC_015321	TAAAT	2	10	259527	259536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015321	TCATT	2	10	261271	261280	20 %	60 %	0 %	20 %	327402258
244	NC_015321	TGTAT	2	10	261922	261931	20 %	60 %	20 %	0 %	327402258
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266	NC_015321	TTCCA	2	10	283573	283582	20 %	40 %	0 %	40 %	327402277
267	NC_015321	AAATG	2	10	285420	285429	60 %	20 %	20 %	0 %	327402279
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401	NC_015321	TAATT	2	10	417922	417931	40 %	60 %	0 %	0 %	327402391
402	NC_015321	ATCCC	2	10	419810	419819	20 %	20 %	0 %	60 %	327402392
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435	NC_015321	TACAT	2	10	449553	449562	40 %	40 %	0 %	20 %	327402412
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