MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fluviicola taffensis DSM 16823 chromosome

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015321	TATAA	2	10	3918	3927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015321	AATAA	2	10	10040	10049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015321	ATTTG	2	10	28445	28454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015321	AATTT	2	10	28468	28477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015321	AAAAG	2	10	39394	39403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015321	CAAAA	2	10	48738	48747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015321	TAATC	2	10	52021	52030	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015321	CATTT	2	10	52988	52997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015321	ATAAA	2	10	79817	79826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015321	TTTAA	2	10	80156	80165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015321	TTTTA	2	10	89179	89188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015321	TTGCT	2	10	91808	91817	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015321	AATTA	2	10	93876	93885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015321	ATTCG	2	10	93895	93904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015321	TAAAT	2	10	115129	115138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015321	CTAAT	2	10	118114	118123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015321	CATTT	2	10	118204	118213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015321	ATATT	2	10	122748	122757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015321	TAAAA	2	10	133059	133068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015321	TTAAA	2	10	133099	133108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015321	AAATG	2	10	133213	133222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015321	AATTG	2	10	147115	147124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015321	TCGAT	2	10	149528	149537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015321	CTTTT	2	10	153377	153386	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015321	TAGTG	2	10	160642	160651	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015321	ATTGA	2	10	164926	164935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015321	CACAA	2	10	166443	166452	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015321	TGCAG	2	10	168552	168561	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015321	AGAAA	2	10	168714	168723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015321	GAATT	2	10	168866	168875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015321	GCTTT	2	10	188523	188532	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015321	AGGAT	2	10	205673	205682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015321	TAAAT	2	10	259527	259536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015321	TTCAA	2	10	288288	288297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015321	CAAAA	2	10	288526	288535	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015321	TCATC	2	10	293165	293174	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015321	GCGTC	2	10	327764	327773	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015321	TAAAA	2	10	346522	346531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015321	AACTA	2	10	349347	349356	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015321	TAAGA	2	10	355823	355832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015321	TGAAG	2	10	359642	359651	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015321	TAAAA	2	10	359718	359727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015321	CTATT	2	10	401502	401511	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015321	ATTTA	2	10	409294	409303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015321	TTGGA	2	10	426626	426635	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015321	TCGAA	2	10	427584	427593	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015321	GGAGT	2	10	430638	430647	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015321	ATTCA	2	10	440541	440550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015321	GTTAA	2	10	441675	441684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015321	ACAAA	2	10	445497	445506	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015321	CTGTT	2	10	445635	445644	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015321	AACCT	2	10	449321	449330	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015321	TTAAT	2	10	449353	449362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015321	ACGAA	2	10	451995	452004	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015321	GCGTA	2	10	457067	457076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015321	TTTTA	2	10	457418	457427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015321	TCATT	2	10	473965	473974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015321	GTTCT	2	10	478398	478407	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015321	TCTTT	2	10	503192	503201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015321	TGAAT	2	10	503231	503240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015321	GACTA	2	10	509788	509797	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015321	TAAGT	2	10	537427	537436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015321	GAAAC	2	10	550856	550865	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015321	TAAAG	2	10	573311	573320	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015321	GACGC	2	10	596974	596983	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015321	AAAAC	2	10	599126	599135	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015321	AAATA	2	10	605083	605092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015321	TTAAT	2	10	617708	617717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015321	AAACA	2	10	622490	622499	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015321	AAATA	2	10	626564	626573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015321	TGCTC	2	10	627632	627641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015321	CTATT	2	10	648024	648033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015321	TTTAC	2	10	654559	654568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015321	CTTTG	2	10	659777	659786	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015321	CACAA	2	10	660734	660743	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015321	AACTA	2	10	668342	668351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015321	AATAA	2	10	676685	676694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015321	ACCAA	2	10	693510	693519	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015321	TTTAT	2	10	693707	693716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015321	AATAA	2	10	695229	695238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015321	GGATA	2	10	737360	737369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015321	TAAAA	2	10	739074	739083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015321	CTAAA	2	10	749173	749182	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015321	GATTT	2	10	778040	778049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015321	AAAAT	2	10	779814	779823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015321	ACCCA	2	10	782591	782600	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_015321	ATTTA	2	10	822808	822817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015321	TTTTC	2	10	846168	846177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015321	CAATC	2	10	854831	854840	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015321	CTTTT	2	10	857518	857527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015321	TGCTT	2	10	865702	865711	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015321	TTAAA	2	10	870853	870862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015321	GCGTC	2	10	882439	882448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015321	GATCT	2	10	892643	892652	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015321	TCAAA	2	10	893829	893838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015321	TCCCT	2	10	895128	895137	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_015321	TTTAA	2	10	903926	903935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015321	AGATT	2	10	911654	911663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015321	ATTTT	2	10	913387	913396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015321	CAGCG	2	10	933662	933671	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015321	ACTTC	2	10	952165	952174	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015321	TTGTA	2	10	957776	957785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015321	TTTTA	2	10	968463	968472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015321	TTTGA	2	10	977799	977808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015321	TTCAT	2	10	994221	994230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015321	TTATT	2	10	1017134	1017143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015321	TAATC	2	10	1028444	1028453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015321	GATGC	2	10	1035095	1035104	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015321	ATTGA	2	10	1036218	1036227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015321	AAAGC	2	10	1036884	1036893	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015321	AAAGC	2	10	1036927	1036936	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015321	AAAGC	2	10	1036970	1036979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015321	AAAAT	2	10	1037105	1037114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015321	TAAAA	2	10	1053986	1053995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015321	ATTTA	2	10	1057905	1057914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015321	AAACA	2	10	1057966	1057975	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015321	ATAAA	2	10	1068988	1068997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015321	GCTTT	2	10	1093663	1093672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015321	TCATT	2	10	1096299	1096308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015321	GGTTA	2	10	1111499	1111508	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015321	TAAAA	2	10	1125143	1125152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015321	AAAGA	2	10	1126380	1126389	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015321	GTTCT	2	10	1142014	1142023	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015321	AAAAT	2	10	1189815	1189824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015321	CCAAT	2	10	1195652	1195661	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015321	AGCAA	2	10	1195764	1195773	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015321	TAACC	3	15	1203349	1203363	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015321	ATTTA	2	10	1234139	1234148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015321	TTCGA	2	10	1256433	1256442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015321	AACAA	2	10	1256629	1256638	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015321	GCAAT	2	10	1268318	1268327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015321	CTTTG	2	10	1286479	1286488	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015321	TCCAA	2	10	1303534	1303543	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015321	TGTTT	2	10	1308734	1308743	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015321	ATCAA	2	10	1308744	1308753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015321	TAAAA	2	10	1322036	1322045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015321	ATTTT	2	10	1323902	1323911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015321	CGAAA	2	10	1353210	1353219	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015321	ACTGA	2	10	1355800	1355809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015321	AGAAC	2	10	1371415	1371424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015321	TTTTC	2	10	1381798	1381807	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015321	TATTC	2	10	1382324	1382333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015321	TAAAT	2	10	1388231	1388240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015321	CAAAA	2	10	1401675	1401684	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015321	TTTCA	2	10	1409634	1409643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015321	AAAAT	2	10	1414891	1414900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015321	ATCAT	2	10	1429980	1429989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015321	TAAAA	2	10	1435599	1435608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015321	GAATT	2	10	1439037	1439046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015321	CAATC	2	10	1445467	1445476	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_015321	AAAAT	2	10	1479922	1479931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_015321	TTTCA	2	10	1534935	1534944	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_015321	TTTTA	2	10	1586541	1586550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015321	TAAAC	2	10	1592527	1592536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_015321	GAATT	2	10	1635910	1635919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015321	AAAAC	2	10	1635968	1635977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_015321	TAACT	2	10	1653379	1653388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_015321	TCTTA	2	10	2868481	2868490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_015321	ATTGA	2	10	2880037	2880046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015321	TTAAC	2	10	2881795	2881804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_015321	TCTAA	2	10	2882583	2882592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_015321	TTGAA	2	10	2899969	2899978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015321	GGATT	2	10	2933826	2933835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015321	ATAAA	2	10	2937571	2937580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015321	CTATT	2	10	2960300	2960309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_015321	GAATG	2	10	2964279	2964288	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015321	TTTTA	2	10	2976069	2976078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015321	TTATT	2	10	2976116	2976125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015321	AGCGC	2	10	2979851	2979860	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
281	NC_015321	TAGTT	2	10	2984867	2984876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015321	CAAGA	2	10	2986848	2986857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_015321	CATGT	2	10	2995724	2995733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
284	NC_015321	GGATT	2	10	3022094	3022103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015321	TAAAA	2	10	3022240	3022249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015321	CATGT	2	10	3023135	3023144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_015321	GAAAA	2	10	3023776	3023785	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_015321	TTTGT	2	10	3035318	3035327	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015321	GGTTT	2	10	3046363	3046372	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_015321	ATAAA	2	10	4442523	4442532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_015321	ATTTT	2	10	4487509	4487518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015321	TTCGT	2	10	4490148	4490157	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_015321	CTGTT	2	10	4490656	4490665	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
466	NC_015321	CAAAT	2	10	4495373	4495382	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
467	NC_015321	TAAAG	2	10	4503065	4503074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_015321	CTAAA	2	10	4509352	4509361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
470	NC_015321	AACAG	2	10	4541326	4541335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
471	NC_015321	TGGAG	2	10	4561018	4561027	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015321	TTAGA	2	10	4567915	4567924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015321	TTCAA	2	10	4570658	4570667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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477	NC_015321	CACTT	2	10	4594258	4594267	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
478	NC_015321	CTAAA	2	10	4605122	4605131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
479	NC_015321	TTAAA	2	10	4611685	4611694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_015321	GGCAA	2	10	4612998	4613007	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
481	NC_015321	ATTCT	2	10	4621175	4621184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.