MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Fluviicola taffensis DSM 16823 chromosome

Total Repeats: 1613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015321	CTTA	2	8	4346084	4346091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_015321	TTTC	2	8	4346179	4346186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_015321	GAAA	2	8	4350635	4350642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015321	GTTT	3	12	4353100	4353111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015321	TAGT	2	8	4353715	4353722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015321	GAAT	2	8	4355739	4355746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015321	GAAT	2	8	4355857	4355864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015321	GGAA	2	8	4356008	4356015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015321	TGCT	2	8	4356269	4356276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_015321	TAAT	2	8	4359132	4359139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015321	AGAA	2	8	4359356	4359363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015321	TAAA	2	8	4360514	4360521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015321	TTTA	2	8	4362048	4362055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015321	AATT	2	8	4369163	4369170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015321	AACA	2	8	4369177	4369184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_015321	AATT	2	8	4370647	4370654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015321	TAAA	2	8	4370753	4370760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015321	ATTA	2	8	4371740	4371747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015321	TAAA	2	8	4371801	4371808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015321	GTTT	2	8	4375684	4375691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015321	ACAA	2	8	4377467	4377474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_015321	TAAT	2	8	4377687	4377694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015321	AAAG	2	8	4386137	4386144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015321	ATTG	2	8	4388897	4388904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015321	AATC	2	8	4390589	4390596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_015321	TATT	2	8	4398800	4398807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015321	AATT	2	8	4399445	4399452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015321	ATTT	2	8	4405139	4405146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015321	CAAA	2	8	4405335	4405342	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_015321	CATT	2	8	4405506	4405513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_015321	AACA	2	8	4405544	4405551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_015321	TATT	2	8	4406088	4406095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015321	GTTT	2	8	4406389	4406396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015321	CCAA	2	8	4406401	4406408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_015321	TTTC	2	8	4406526	4406533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_015321	AATG	2	8	4406548	4406555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015321	GTTT	2	8	4406967	4406974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015321	ATTT	2	8	4407490	4407497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015321	TTCT	2	8	4408495	4408502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_015321	TTGA	2	8	4413430	4413437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015321	ATTT	2	8	4413574	4413581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015321	TGAA	2	8	4419721	4419728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015321	TGAT	2	8	4420653	4420660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015321	TTAT	2	8	4420676	4420683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015321	GATT	2	8	4421884	4421891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015321	TACT	2	8	4422898	4422905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_015321	TGAA	2	8	4427168	4427175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015321	ATTA	2	8	4444579	4444586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015321	CCTT	2	8	4445115	4445122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_015321	TTCC	2	8	4454719	4454726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_015321	ATTT	2	8	4454850	4454857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015321	TTCA	2	8	4459475	4459482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_015321	TTAA	2	8	4462177	4462184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015321	GTCA	2	8	4462226	4462233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_015321	ATAG	2	8	4475018	4475025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015321	TATT	2	8	4487475	4487482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015321	TGAA	2	8	4488055	4488062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015321	GATT	2	8	4490228	4490235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015321	CAGA	2	8	4490468	4490475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1561	NC_015321	CAAA	2	8	4495162	4495169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_015321	TGAT	2	8	4495279	4495286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015321	CCTT	2	8	4498400	4498407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_015321	AATG	2	8	4500661	4500668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015321	TATT	2	8	4504104	4504111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015321	GATT	2	8	4504258	4504265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015321	GCAG	2	8	4509116	4509123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_015321	TTGG	2	8	4509325	4509332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015321	TATT	2	8	4509998	4510005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015321	CTGA	2	8	4512551	4512558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_015321	AAAT	2	8	4512743	4512750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015321	AAGT	2	8	4512759	4512766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015321	CAAA	2	8	4512797	4512804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_015321	AATT	2	8	4516801	4516808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015321	ATTA	2	8	4521017	4521024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015321	TAGG	2	8	4521034	4521041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015321	ATGA	2	8	4530897	4530904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_015321	AATA	2	8	4532742	4532749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015321	CTGA	2	8	4537520	4537527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_015321	AAAG	2	8	4540955	4540962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015321	CAAT	2	8	4541312	4541319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_015321	GATT	2	8	4541450	4541457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015321	AAAC	2	8	4542308	4542315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1585	NC_015321	TTAA	2	8	4547078	4547085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_015321	TAAT	2	8	4567649	4567656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015321	TGAT	2	8	4570672	4570679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015321	TGAT	2	8	4575643	4575650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_015321	GAAG	2	8	4583122	4583129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015321	TATT	2	8	4587250	4587257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015321	AAAT	2	8	4590045	4590052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015321	TCAA	2	8	4606319	4606326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_015321	AAAC	2	8	4607178	4607185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_015321	GTAA	2	8	4607213	4607220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015321	TTTA	2	8	4610325	4610332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015321	ATTC	2	8	4612973	4612980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_015321	CTTT	2	8	4613596	4613603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_015321	TCGT	2	8	4617541	4617548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_015321	AATC	2	8	4620023	4620030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_015321	TAAT	2	8	4627299	4627306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015321	ACAA	2	8	4627404	4627411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_015321	TCAA	2	8	4628839	4628846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_015321	GAAA	2	8	4633321	4633328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.