MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015320	GCTTC	2	10	6676	6685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015320	AGTTA	2	10	11003	11012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015320	CTTTT	2	10	16874	16883	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015320	CTGAA	2	10	26413	26422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015320	GTGTT	2	10	36594	36603	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015320	CAGGG	2	10	42032	42041	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015320	TTTAT	2	10	62067	62076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015320	ATTTT	2	10	81558	81567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015320	CTTTT	2	10	83497	83506	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015320	TAAGC	2	10	83543	83552	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015320	TTGAG	2	10	90468	90477	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015320	ACCTC	2	10	120324	120333	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015320	GAGCA	2	10	132973	132982	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015320	ACTTT	2	10	136877	136886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015320	GTTTT	2	10	137030	137039	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015320	AAATT	2	10	144760	144769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015320	TTTGA	2	10	171236	171245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015320	CCGTA	2	10	171642	171651	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015320	GGAAA	2	10	171742	171751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015320	CAGCC	2	10	171874	171883	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015320	ACCCC	2	10	193510	193519	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
22	NC_015320	AATTA	2	10	207027	207036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015320	ATTTT	2	10	214631	214640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015320	ATTCT	2	10	214816	214825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015320	AAATT	2	10	252017	252026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015320	GTTCT	2	10	253684	253693	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015320	ACCTG	2	10	266380	266389	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015320	AAAGC	2	10	277915	277924	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015320	GAGCA	2	10	283272	283281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015320	ATTTT	2	10	288836	288845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015320	ATTTT	2	10	301199	301208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015320	GCTAA	2	10	301238	301247	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015320	AACGT	2	10	304857	304866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015320	AAGGA	2	10	304995	305004	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015320	TAGAA	2	10	328208	328217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015320	CAAAA	2	10	346620	346629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015320	TAATA	2	10	347784	347793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015320	AGTAC	2	10	353663	353672	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015320	AAAGA	2	10	353847	353856	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015320	ATTTA	2	10	359587	359596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015320	AAAGT	2	10	361521	361530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015320	TGTTT	2	10	364018	364027	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015320	AATTA	2	10	371331	371340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015320	TATCT	2	10	384899	384908	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015320	TCTAT	2	10	398711	398720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015320	GAATC	2	10	408690	408699	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015320	GCAAA	2	10	412520	412529	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015320	TCAGA	2	10	413142	413151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015320	ATTTT	2	10	413966	413975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015320	ACCTT	2	10	414569	414578	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015320	CTTTT	2	10	421152	421161	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015320	ACCAA	2	10	423540	423549	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015320	TTATT	2	10	424329	424338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015320	GAATT	2	10	443475	443484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015320	ACTTC	2	10	470612	470621	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015320	CAATC	2	10	470875	470884	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015320	CTAAA	2	10	498801	498810	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015320	TTTTA	2	10	499723	499732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015320	TAAAA	2	10	511879	511888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015320	ACAGC	2	10	517625	517634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015320	ACCAG	2	10	551790	551799	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015320	TAATT	2	10	559182	559191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015320	TTTGT	2	10	562554	562563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015320	TATTT	2	10	582697	582706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015320	ATTAA	2	10	583397	583406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015320	ATTAT	2	10	592807	592816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015320	GAGTG	2	10	633196	633205	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015320	TCAAA	2	10	636166	636175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015320	GTGCA	2	10	636228	636237	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015320	GATGT	2	10	647165	647174	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015320	ATGGA	2	10	664938	664947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015320	ACAAT	2	10	666274	666283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015320	TTACT	2	10	668348	668357	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015320	TGCTC	2	10	687445	687454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015320	TACAA	2	10	689173	689182	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015320	CAAAT	2	10	714884	714893	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015320	GTGGG	2	10	719141	719150	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015320	ACAAA	2	10	719911	719920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015320	GCGAG	2	10	744548	744557	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015320	ATGAA	2	10	750949	750958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015320	GAGCT	2	10	756666	756675	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015320	GAGAA	2	10	759090	759099	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015320	CTTCT	2	10	762455	762464	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015320	GAGTG	2	10	764067	764076	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015320	GTAAT	2	10	773319	773328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015320	AGACG	2	10	779667	779676	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015320	AATTT	2	10	780935	780944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015320	TTCAG	2	10	782705	782714	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015320	GAAAA	2	10	795742	795751	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015320	CTTTT	2	10	796743	796752	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015320	AAAAG	2	10	798211	798220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015320	ATGCC	2	10	798279	798288	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015320	TATCA	2	10	801293	801302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015320	GGAAA	2	10	801575	801584	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015320	TTCAT	2	10	847295	847304	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015320	AAATT	2	10	850309	850318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015320	GAATT	2	10	885489	885498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015320	AAAAC	2	10	901048	901057	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015320	TTTTA	2	10	902517	902526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015320	ATTGC	2	10	902585	902594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015320	ATTAT	2	10	913652	913661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015320	CCGAT	2	10	934062	934071	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015320	CTTTT	2	10	951415	951424	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015320	ATTAA	2	10	951639	951648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015320	TCATC	2	10	953248	953257	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015320	GTTTC	2	10	954243	954252	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015320	CCTAC	2	10	981713	981722	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_015320	TTGAA	2	10	981732	981741	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015320	AAAAT	2	10	981939	981948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015320	GCTAT	2	10	987737	987746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015320	TTGTT	2	10	1010610	1010619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015320	GAAGA	2	10	1011486	1011495	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015320	TAATT	2	10	1016280	1016289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015320	TAAAA	2	10	1018041	1018050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015320	ATTTG	2	10	1037692	1037701	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015320	AAATT	2	10	1052293	1052302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015320	TTTGA	2	10	1056526	1056535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015320	ATTTT	2	10	1065994	1066003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015320	ACGGG	2	10	1094047	1094056	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015320	AAGAA	2	10	1105822	1105831	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015320	TTCAG	2	10	1119639	1119648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015320	AAATA	2	10	1120070	1120079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015320	TAATT	2	10	1124671	1124680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015320	AAGAA	2	10	1131040	1131049	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015320	AAATG	2	10	1159372	1159381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015320	TAAAT	2	10	1159460	1159469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015320	AAAAT	2	10	1165169	1165178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015320	ATTAT	2	10	1172008	1172017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015320	TAAAT	2	10	1188309	1188318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015320	AGCCA	2	10	1207760	1207769	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015320	GACTC	2	10	1207787	1207796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_015320	TATAA	2	10	1209684	1209693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015320	GCGAT	2	10	1213402	1213411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015320	AGGGA	2	10	1228186	1228195	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015320	AAATA	2	10	1228290	1228299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015320	GAAGA	2	10	1259109	1259118	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015320	AAGGA	2	10	1259408	1259417	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015320	TCTGC	2	10	1268984	1268993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015320	GAAAG	2	10	1275887	1275896	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015320	AAAAT	2	10	1286243	1286252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015320	ACTTA	2	10	1346768	1346777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015320	TTTTA	2	10	1347822	1347831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015320	ATTTT	2	10	1349293	1349302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015320	TTTAA	2	10	1352374	1352383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015320	TTCAT	2	10	1383383	1383392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015320	GATAA	2	10	1383708	1383717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015320	AATGG	2	10	1388440	1388449	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015320	AAGGA	2	10	1396243	1396252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015320	GAGTG	2	10	1396894	1396903	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015320	CAAAG	2	10	1397457	1397466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015320	GTTGC	2	10	1398434	1398443	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015320	CTCCC	2	10	1398553	1398562	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
153	NC_015320	TTAAA	2	10	1415138	1415147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015320	AAAAT	2	10	1455120	1455129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015320	GCTCC	2	10	1499918	1499927	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_015320	ATTTT	2	10	1509633	1509642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015320	AGTAA	2	10	1515874	1515883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015320	AAAAT	2	10	1517833	1517842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015320	CAAAA	2	10	1520117	1520126	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_015320	GGGTG	2	10	1569754	1569763	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015320	TTGGA	2	10	1579726	1579735	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015320	ATTTT	2	10	1612353	1612362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015320	CCGTA	2	10	1616854	1616863	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_015320	AAAAT	2	10	1760391	1760400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_015320	AATTT	2	10	1781146	1781155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_015320	TAATA	2	10	1822730	1822739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015320	TCCAC	2	10	1832383	1832392	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
180	NC_015320	GCAAA	2	10	1837511	1837520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
181	NC_015320	AAATA	2	10	1845302	1845311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015320	AGCTA	2	10	1882497	1882506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_015320	AAATC	2	10	1888624	1888633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_015320	GCAAT	2	10	1889940	1889949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.