MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015320	TCTGC	2	10	782	791	0 %	40 %	20 %	40 %	327399921
2	NC_015320	CAACC	2	10	1965	1974	40 %	0 %	0 %	60 %	327399921
3	NC_015320	CCACA	2	10	3002	3011	40 %	0 %	0 %	60 %	327399921
4	NC_015320	TGAGC	2	10	4688	4697	20 %	20 %	40 %	20 %	327399921
5	NC_015320	GCCGA	2	10	5785	5794	20 %	0 %	40 %	40 %	327399922
6	NC_015320	CACAG	2	10	7642	7651	40 %	0 %	20 %	40 %	327399924
7	NC_015320	AACGT	2	10	8582	8591	40 %	20 %	20 %	20 %	327399925
8	NC_015320	AATGA	2	10	9142	9151	60 %	20 %	20 %	0 %	327399927
9	NC_015320	TGTAG	2	10	9234	9243	20 %	40 %	40 %	0 %	327399927
10	NC_015320	ATGTT	2	10	11090	11099	20 %	60 %	20 %	0 %	327399930
11	NC_015320	ACTAT	2	10	14792	14801	40 %	40 %	0 %	20 %	327399935
12	NC_015320	GAAAG	2	10	15212	15221	60 %	0 %	40 %	0 %	327399936
13	NC_015320	CCGTT	2	10	15515	15524	0 %	40 %	20 %	40 %	327399936
14	NC_015320	AGAGA	2	10	15527	15536	60 %	0 %	40 %	0 %	327399936
15	NC_015320	TGATT	2	10	17474	17483	20 %	60 %	20 %	0 %	327399940
16	NC_015320	TTGAG	2	10	19638	19647	20 %	40 %	40 %	0 %	327399942
17	NC_015320	AAAAT	2	10	26540	26549	80 %	20 %	0 %	0 %	327399949
18	NC_015320	GAAAA	2	10	29156	29165	80 %	0 %	20 %	0 %	327399951
19	NC_015320	GAGCG	2	10	31203	31212	20 %	0 %	60 %	20 %	327399953
20	NC_015320	TCAGA	2	10	37703	37712	40 %	20 %	20 %	20 %	327399957
21	NC_015320	GGATG	2	10	38945	38954	20 %	20 %	60 %	0 %	327399959
22	NC_015320	GTGGA	2	10	48387	48396	20 %	20 %	60 %	0 %	327399968
23	NC_015320	CCTGC	2	10	57353	57362	0 %	20 %	20 %	60 %	327399977
24	NC_015320	TCTCT	2	10	60519	60528	0 %	60 %	0 %	40 %	327399979
25	NC_015320	AAACA	2	10	63786	63795	80 %	0 %	0 %	20 %	327399982
26	NC_015320	TTGGA	2	10	65341	65350	20 %	40 %	40 %	0 %	327399984
27	NC_015320	TCTAT	2	10	69528	69537	20 %	60 %	0 %	20 %	327399990
28	NC_015320	AGAAA	2	10	71682	71691	80 %	0 %	20 %	0 %	327399992
29	NC_015320	ATTCC	2	10	72107	72116	20 %	40 %	0 %	40 %	327399993
30	NC_015320	GTATT	2	10	74948	74957	20 %	60 %	20 %	0 %	327399997
31	NC_015320	AGTTA	2	10	80873	80882	40 %	40 %	20 %	0 %	327400001
32	NC_015320	GCTGG	2	10	81096	81105	0 %	20 %	60 %	20 %	327400002
33	NC_015320	AACTT	2	10	82671	82680	40 %	40 %	0 %	20 %	327400005
34	NC_015320	CACGC	2	10	89354	89363	20 %	0 %	20 %	60 %	327400013
35	NC_015320	AGCGT	2	10	97162	97171	20 %	20 %	40 %	20 %	327400022
36	NC_015320	TGTCG	2	10	97948	97957	0 %	40 %	40 %	20 %	327400023
37	NC_015320	CGTTA	2	10	99419	99428	20 %	40 %	20 %	20 %	327400025
38	NC_015320	CTTGC	2	10	100030	100039	0 %	40 %	20 %	40 %	327400025
39	NC_015320	TTTGC	2	10	101897	101906	0 %	60 %	20 %	20 %	327400026
40	NC_015320	TGAGT	2	10	102002	102011	20 %	40 %	40 %	0 %	327400026
41	NC_015320	GAGTT	2	10	102860	102869	20 %	40 %	40 %	0 %	327400028
42	NC_015320	TATCT	2	10	103230	103239	20 %	60 %	0 %	20 %	327400028
43	NC_015320	TGAGC	2	10	104373	104382	20 %	20 %	40 %	20 %	327400030
44	NC_015320	GAGTG	2	10	107060	107069	20 %	20 %	60 %	0 %	327400034
45	NC_015320	TCGAT	2	10	109584	109593	20 %	40 %	20 %	20 %	327400039
46	NC_015320	GAGAG	2	10	109876	109885	40 %	0 %	60 %	0 %	327400039
47	NC_015320	TCTGC	2	10	110013	110022	0 %	40 %	20 %	40 %	327400039
48	NC_015320	ACTCG	2	10	110242	110251	20 %	20 %	20 %	40 %	327400039
49	NC_015320	TCCAC	2	10	113531	113540	20 %	20 %	0 %	60 %	327400044
50	NC_015320	GCAGA	2	10	113617	113626	40 %	0 %	40 %	20 %	327400044
51	NC_015320	TCCTC	2	10	114620	114629	0 %	40 %	0 %	60 %	327400045
52	NC_015320	GGAGA	2	10	116765	116774	40 %	0 %	60 %	0 %	327400046
53	NC_015320	GGAAA	2	10	117003	117012	60 %	0 %	40 %	0 %	327400047
54	NC_015320	AGGAG	2	10	117329	117338	40 %	0 %	60 %	0 %	327400048
55	NC_015320	CGGAG	2	10	117520	117529	20 %	0 %	60 %	20 %	327400048
56	NC_015320	CCCTT	2	10	118071	118080	0 %	40 %	0 %	60 %	327400049
57	NC_015320	CTCTT	2	10	128212	128221	0 %	60 %	0 %	40 %	327400060
58	NC_015320	AAAAG	2	10	136676	136685	80 %	0 %	20 %	0 %	327400069
59	NC_015320	GCGCC	2	10	139102	139111	0 %	0 %	40 %	60 %	327400073
60	NC_015320	GCGAG	2	10	139239	139248	20 %	0 %	60 %	20 %	327400073
61	NC_015320	TCTGC	2	10	141012	141021	0 %	40 %	20 %	40 %	327400076
62	NC_015320	CGATG	2	10	142894	142903	20 %	20 %	40 %	20 %	327400079
63	NC_015320	TAACG	2	10	143420	143429	40 %	20 %	20 %	20 %	327400080
64	NC_015320	GAGAA	2	10	144592	144601	60 %	0 %	40 %	0 %	327400081
65	NC_015320	CATCC	2	10	147665	147674	20 %	20 %	0 %	60 %	327400084
66	NC_015320	TCGCT	2	10	148167	148176	0 %	40 %	20 %	40 %	327400085
67	NC_015320	CACTC	2	10	148420	148429	20 %	20 %	0 %	60 %	327400086
68	NC_015320	TTCGA	2	10	150551	150560	20 %	40 %	20 %	20 %	327400088
69	NC_015320	TGCGA	2	10	150944	150953	20 %	20 %	40 %	20 %	327400088
70	NC_015320	GTTTT	2	10	151256	151265	0 %	80 %	20 %	0 %	327400088
71	NC_015320	AGCGC	2	10	152475	152484	20 %	0 %	40 %	40 %	327400090
72	NC_015320	GAAGG	2	10	158366	158375	40 %	0 %	60 %	0 %	327400094
73	NC_015320	ACCAC	2	10	158465	158474	40 %	0 %	0 %	60 %	327400094
74	NC_015320	GGCAT	2	10	161207	161216	20 %	20 %	40 %	20 %	327400097
75	NC_015320	CCCCT	2	10	161516	161525	0 %	20 %	0 %	80 %	327400098
76	NC_015320	AACGG	2	10	168432	168441	40 %	0 %	40 %	20 %	327400103
77	NC_015320	TTTTC	2	10	170852	170861	0 %	80 %	0 %	20 %	327400105
78	NC_015320	TTTCG	2	10	173425	173434	0 %	60 %	20 %	20 %	327400106
79	NC_015320	CGTCC	2	10	180413	180422	0 %	20 %	20 %	60 %	327400116
80	NC_015320	CATCA	2	10	180577	180586	40 %	20 %	0 %	40 %	327400116
81	NC_015320	CATCG	2	10	180699	180708	20 %	20 %	20 %	40 %	327400116
82	NC_015320	CCCTC	2	10	181904	181913	0 %	20 %	0 %	80 %	327400117
83	NC_015320	GGGAC	2	10	185642	185651	20 %	0 %	60 %	20 %	327400122
84	NC_015320	AAGGT	2	10	186780	186789	40 %	20 %	40 %	0 %	327400123
85	NC_015320	GAAAG	2	10	189450	189459	60 %	0 %	40 %	0 %	327400127
86	NC_015320	GCGTT	2	10	190498	190507	0 %	40 %	40 %	20 %	327400128
87	NC_015320	TTCTT	2	10	190528	190537	0 %	80 %	0 %	20 %	327400128
88	NC_015320	TTCTT	2	10	191727	191736	0 %	80 %	0 %	20 %	327400131
89	NC_015320	GAGCT	2	10	196243	196252	20 %	20 %	40 %	20 %	327400137
90	NC_015320	CATGG	2	10	196996	197005	20 %	20 %	40 %	20 %	327400137
91	NC_015320	TCTGT	2	10	201964	201973	0 %	60 %	20 %	20 %	327400144
92	NC_015320	GACTG	2	10	202552	202561	20 %	20 %	40 %	20 %	327400146
93	NC_015320	ACGAG	2	10	202595	202604	40 %	0 %	40 %	20 %	327400146
94	NC_015320	AGTGG	2	10	207461	207470	20 %	20 %	60 %	0 %	327400153
95	NC_015320	CTTCG	2	10	209475	209484	0 %	40 %	20 %	40 %	327400155
96	NC_015320	GCTTT	2	10	210152	210161	0 %	60 %	20 %	20 %	327400155
97	NC_015320	TGGTA	2	10	212857	212866	20 %	40 %	40 %	0 %	327400157
98	NC_015320	CAGCT	2	10	215197	215206	20 %	20 %	20 %	40 %	327400160
99	NC_015320	TGGAT	2	10	219032	219041	20 %	40 %	40 %	0 %	327400165
100	NC_015320	TGCTG	2	10	220593	220602	0 %	40 %	40 %	20 %	327400167
101	NC_015320	GCAAA	2	10	224175	224184	60 %	0 %	20 %	20 %	327400172
102	NC_015320	TTTTC	2	10	224458	224467	0 %	80 %	0 %	20 %	327400172
103	NC_015320	ATTGA	2	10	224640	224649	40 %	40 %	20 %	0 %	327400172
104	NC_015320	TCTGG	2	10	226002	226011	0 %	40 %	40 %	20 %	327400174
105	NC_015320	AAAAT	2	10	226142	226151	80 %	20 %	0 %	0 %	327400174
106	NC_015320	GCTGC	2	10	227805	227814	0 %	20 %	40 %	40 %	327400175
107	NC_015320	CCAGT	2	10	231538	231547	20 %	20 %	20 %	40 %	327400180
108	NC_015320	TCGAT	2	10	233268	233277	20 %	40 %	20 %	20 %	327400181
109	NC_015320	CTTCT	2	10	235401	235410	0 %	60 %	0 %	40 %	327400184
110	NC_015320	GCTCA	2	10	235635	235644	20 %	20 %	20 %	40 %	327400184
111	NC_015320	TTCAG	2	10	237512	237521	20 %	40 %	20 %	20 %	327400187
112	NC_015320	GGAGT	2	10	238521	238530	20 %	20 %	60 %	0 %	327400187
113	NC_015320	GCAAA	2	10	239874	239883	60 %	0 %	20 %	20 %	327400189
114	NC_015320	CTCGA	2	10	243095	243104	20 %	20 %	20 %	40 %	327400193
115	NC_015320	CTGAT	2	10	243789	243798	20 %	40 %	20 %	20 %	327400194
116	NC_015320	CTTCC	2	10	245004	245013	0 %	40 %	0 %	60 %	327400195
117	NC_015320	GAGAA	2	10	248852	248861	60 %	0 %	40 %	0 %	327400199
118	NC_015320	GAAGA	2	10	249604	249613	60 %	0 %	40 %	0 %	327400199
119	NC_015320	AAGGA	2	10	252676	252685	60 %	0 %	40 %	0 %	327400203
120	NC_015320	GAGAG	2	10	254240	254249	40 %	0 %	60 %	0 %	327400204
121	NC_015320	TTCCG	2	10	256378	256387	0 %	40 %	20 %	40 %	327400207
122	NC_015320	GTATC	2	10	256956	256965	20 %	40 %	20 %	20 %	327400207
123	NC_015320	ACAGG	2	10	258887	258896	40 %	0 %	40 %	20 %	327400211
124	NC_015320	ACCTT	2	10	259108	259117	20 %	40 %	0 %	40 %	327400211
125	NC_015320	GGAAG	2	10	260327	260336	40 %	0 %	60 %	0 %	327400213
126	NC_015320	TAAGA	2	10	260464	260473	60 %	20 %	20 %	0 %	327400213
127	NC_015320	CAAGG	2	10	270428	270437	40 %	0 %	40 %	20 %	327400223
128	NC_015320	ATTTC	2	10	272832	272841	20 %	60 %	0 %	20 %	327400225
129	NC_015320	AAAGA	2	10	273563	273572	80 %	0 %	20 %	0 %	327400225
130	NC_015320	GCTCA	2	10	277234	277243	20 %	20 %	20 %	40 %	327400231
131	NC_015320	GTCCA	2	10	277561	277570	20 %	20 %	20 %	40 %	327400231
132	NC_015320	CCTCT	2	10	278076	278085	0 %	40 %	0 %	60 %	327400232
133	NC_015320	TCCAT	2	10	278477	278486	20 %	40 %	0 %	40 %	327400232
134	NC_015320	GAAAG	2	10	283551	283560	60 %	0 %	40 %	0 %	327400236
135	NC_015320	TTTAC	2	10	286372	286381	20 %	60 %	0 %	20 %	327400237
136	NC_015320	TGTGG	2	10	286985	286994	0 %	40 %	60 %	0 %	327400238
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138	NC_015320	GTCAG	2	10	290785	290794	20 %	20 %	40 %	20 %	327400241
139	NC_015320	ATATC	2	10	292592	292601	40 %	40 %	0 %	20 %	327400243
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141	NC_015320	GCCTT	2	10	296730	296739	0 %	40 %	20 %	40 %	327400250
142	NC_015320	TTCAT	2	10	296741	296750	20 %	60 %	0 %	20 %	327400250
143	NC_015320	AACAG	2	10	302739	302748	60 %	0 %	20 %	20 %	327400256
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145	NC_015320	TCCAG	2	10	308295	308304	20 %	20 %	20 %	40 %	327400262
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147	NC_015320	GTCTG	2	10	311185	311194	0 %	40 %	40 %	20 %	327400267
148	NC_015320	TCCTG	2	10	316025	316034	0 %	40 %	20 %	40 %	327400272
149	NC_015320	TCTAC	2	10	319497	319506	20 %	40 %	0 %	40 %	327400276
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152	NC_015320	TCCTG	2	10	325386	325395	0 %	40 %	20 %	40 %	327400282
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155	NC_015320	TGCTT	2	10	330823	330832	0 %	60 %	20 %	20 %	327400290
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157	NC_015320	GAAGA	2	10	331661	331670	60 %	0 %	40 %	0 %	327400290
158	NC_015320	AGAGA	2	10	332629	332638	60 %	0 %	40 %	0 %	327400293
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162	NC_015320	CCTCC	2	10	339445	339454	0 %	20 %	0 %	80 %	327400299
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167	NC_015320	TCTCC	2	10	342923	342932	0 %	40 %	0 %	60 %	327400305
168	NC_015320	GAAGA	2	10	345492	345501	60 %	0 %	40 %	0 %	327400309
169	NC_015320	GCGAT	2	10	348348	348357	20 %	20 %	40 %	20 %	327400315
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172	NC_015320	GAATG	2	10	350964	350973	40 %	20 %	40 %	0 %	327400318
173	NC_015320	ATGGG	2	10	351507	351516	20 %	20 %	60 %	0 %	327400318
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177	NC_015320	TAGTA	2	10	358469	358478	40 %	40 %	20 %	0 %	327400326
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197	NC_015320	TTTGC	2	10	400674	400683	0 %	60 %	20 %	20 %	327400373
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230	NC_015320	TTTCG	2	10	460161	460170	0 %	60 %	20 %	20 %	327400434
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233	NC_015320	CCACT	2	10	469259	469268	20 %	20 %	0 %	60 %	327400443
234	NC_015320	GGGAT	2	10	471504	471513	20 %	20 %	60 %	0 %	327400444
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236	NC_015320	GGAGA	2	10	472963	472972	40 %	0 %	60 %	0 %	327400445
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244	NC_015320	ATTTT	2	10	479326	479335	20 %	80 %	0 %	0 %	327400454
245	NC_015320	GTATT	2	10	480771	480780	20 %	60 %	20 %	0 %	327400455
246	NC_015320	CAACC	2	10	483583	483592	40 %	0 %	0 %	60 %	327400458
247	NC_015320	GAGAA	2	10	485354	485363	60 %	0 %	40 %	0 %	327400460
248	NC_015320	CTTGG	2	10	487145	487154	0 %	40 %	40 %	20 %	327400462
249	NC_015320	CATCC	2	10	488634	488643	20 %	20 %	0 %	60 %	327400464
250	NC_015320	CTTTA	2	10	489063	489072	20 %	60 %	0 %	20 %	327400464
251	NC_015320	ACTTT	2	10	491548	491557	20 %	60 %	0 %	20 %	327400466
252	NC_015320	ACAGA	2	10	493205	493214	60 %	0 %	20 %	20 %	327400467
253	NC_015320	CAGAA	2	10	494442	494451	60 %	0 %	20 %	20 %	327400467
254	NC_015320	AAAAG	2	10	495473	495482	80 %	0 %	20 %	0 %	327400469
255	NC_015320	GAAAA	2	10	499117	499126	80 %	0 %	20 %	0 %	327400475
256	NC_015320	AAGCG	2	10	500691	500700	40 %	0 %	40 %	20 %	327400477
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258	NC_015320	AGGGA	2	10	506472	506481	40 %	0 %	60 %	0 %	327400482
259	NC_015320	TTCCA	2	10	508201	508210	20 %	40 %	0 %	40 %	327400484
260	NC_015320	ACTCG	2	10	510790	510799	20 %	20 %	20 %	40 %	327400487
261	NC_015320	ACGCA	2	10	513207	513216	40 %	0 %	20 %	40 %	327400490
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263	NC_015320	ATGCT	2	10	518584	518593	20 %	40 %	20 %	20 %	327400496
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