MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 1151

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015320	CTTCA	2	10	1668986	1668995	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1002	NC_015320	CTTCA	2	10	1669509	1669518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_015320	TGTCC	2	10	1671268	1671277	0 %	40 %	20 %	40 %	327401739
1004	NC_015320	ACTTT	2	10	1673340	1673349	20 %	60 %	0 %	20 %	327401741
1005	NC_015320	TTGCT	2	10	1673414	1673423	0 %	60 %	20 %	20 %	327401741
1006	NC_015320	GATAA	2	10	1674669	1674678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015320	AAACT	2	10	1677908	1677917	60 %	20 %	0 %	20 %	327401746
1008	NC_015320	AAGCA	2	10	1678773	1678782	60 %	0 %	20 %	20 %	327401747
1009	NC_015320	AAGGG	2	10	1678801	1678810	40 %	0 %	60 %	0 %	327401747
1010	NC_015320	GGTCT	2	10	1679920	1679929	0 %	40 %	40 %	20 %	327401748
1011	NC_015320	CATAC	2	10	1681230	1681239	40 %	20 %	0 %	40 %	327401750
1012	NC_015320	GGGCG	2	10	1684351	1684360	0 %	0 %	80 %	20 %	327401755
1013	NC_015320	ATCAA	2	10	1685753	1685762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_015320	CTTTT	2	10	1688971	1688980	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_015320	GAGAA	2	10	1691478	1691487	60 %	0 %	40 %	0 %	327401765
1016	NC_015320	CTTTC	2	10	1692372	1692381	0 %	60 %	0 %	40 %	327401766
1017	NC_015320	TCTTT	2	10	1692865	1692874	0 %	80 %	0 %	20 %	327401767
1018	NC_015320	CTATC	2	10	1692956	1692965	20 %	40 %	0 %	40 %	327401767
1019	NC_015320	ATAAA	2	10	1698444	1698453	80 %	20 %	0 %	0 %	327401772
1020	NC_015320	GAATC	2	10	1700230	1700239	40 %	20 %	20 %	20 %	327401773
1021	NC_015320	CTTAC	2	10	1700626	1700635	20 %	40 %	0 %	40 %	327401774
1022	NC_015320	AGCTC	2	10	1704093	1704102	20 %	20 %	20 %	40 %	327401777
1023	NC_015320	AGGAG	2	10	1705562	1705571	40 %	0 %	60 %	0 %	327401779
1024	NC_015320	TCCTG	2	10	1707580	1707589	0 %	40 %	20 %	40 %	327401784
1025	NC_015320	CCGTA	2	10	1708988	1708997	20 %	20 %	20 %	40 %	327401785
1026	NC_015320	AGGAA	2	10	1709936	1709945	60 %	0 %	40 %	0 %	327401786
1027	NC_015320	GATGC	2	10	1710850	1710859	20 %	20 %	40 %	20 %	327401787
1028	NC_015320	TAAAT	2	10	1714628	1714637	60 %	40 %	0 %	0 %	327401795
1029	NC_015320	TTCAG	2	10	1717576	1717585	20 %	40 %	20 %	20 %	327401799
1030	NC_015320	CAGTC	2	10	1717895	1717904	20 %	20 %	20 %	40 %	327401799
1031	NC_015320	GCGCT	2	10	1719782	1719791	0 %	20 %	40 %	40 %	327401801
1032	NC_015320	TCGCC	2	10	1720861	1720870	0 %	20 %	20 %	60 %	327401803
1033	NC_015320	GCAGG	2	10	1724828	1724837	20 %	0 %	60 %	20 %	327401810
1034	NC_015320	GCCTT	2	10	1727023	1727032	0 %	40 %	20 %	40 %	327401812
1035	NC_015320	GAAAT	2	10	1732318	1732327	60 %	20 %	20 %	0 %	327401819
1036	NC_015320	GAAGG	2	10	1733051	1733060	40 %	0 %	60 %	0 %	327401820
1037	NC_015320	ATGGA	2	10	1734605	1734614	40 %	20 %	40 %	0 %	327401820
1038	NC_015320	AAGGC	2	10	1735634	1735643	40 %	0 %	40 %	20 %	327401822
1039	NC_015320	GCTTT	2	10	1736597	1736606	0 %	60 %	20 %	20 %	327401822
1040	NC_015320	GCTCG	2	10	1736817	1736826	0 %	20 %	40 %	40 %	327401822
1041	NC_015320	CCGTA	2	10	1738658	1738667	20 %	20 %	20 %	40 %	327401823
1042	NC_015320	GCTGA	2	10	1740397	1740406	20 %	20 %	40 %	20 %	327401824
1043	NC_015320	GGGTG	2	10	1740527	1740536	0 %	20 %	80 %	0 %	327401824
1044	NC_015320	GCTGT	2	10	1741049	1741058	0 %	40 %	40 %	20 %	327401825
1045	NC_015320	AGCAG	2	10	1742046	1742055	40 %	0 %	40 %	20 %	327401828
1046	NC_015320	GTACT	2	10	1742303	1742312	20 %	40 %	20 %	20 %	327401828
1047	NC_015320	GAGAG	2	10	1744600	1744609	40 %	0 %	60 %	0 %	327401830
1048	NC_015320	AGAGG	2	10	1745429	1745438	40 %	0 %	60 %	0 %	327401831
1049	NC_015320	CTGAA	2	10	1745582	1745591	40 %	20 %	20 %	20 %	327401832
1050	NC_015320	TGCGT	2	10	1748242	1748251	0 %	40 %	40 %	20 %	327401837
1051	NC_015320	ACCAA	2	10	1755334	1755343	60 %	0 %	0 %	40 %	327401846
1052	NC_015320	AAACG	2	10	1755657	1755666	60 %	0 %	20 %	20 %	327401846
1053	NC_015320	ACTTT	2	10	1755801	1755810	20 %	60 %	0 %	20 %	327401847
1054	NC_015320	TCTAT	2	10	1756289	1756298	20 %	60 %	0 %	20 %	327401847
1055	NC_015320	CTGTA	2	10	1757772	1757781	20 %	40 %	20 %	20 %	327401849
1056	NC_015320	CCAGG	2	10	1757808	1757817	20 %	0 %	40 %	40 %	327401849
1057	NC_015320	CTGTG	2	10	1759957	1759966	0 %	40 %	40 %	20 %	327401850
1058	NC_015320	AAAAT	2	10	1760391	1760400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015320	CAACG	2	10	1762104	1762113	40 %	0 %	20 %	40 %	327401852
1060	NC_015320	AGAGA	2	10	1762156	1762165	60 %	0 %	40 %	0 %	327401852
1061	NC_015320	TAAAA	2	10	1762257	1762266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015320	GAATA	2	10	1763394	1763403	60 %	20 %	20 %	0 %	327401854
1063	NC_015320	GACAG	2	10	1767658	1767667	40 %	0 %	40 %	20 %	327401858
1064	NC_015320	GGCTC	2	10	1767796	1767805	0 %	20 %	40 %	40 %	327401858
1065	NC_015320	TTTAT	2	10	1769008	1769017	20 %	80 %	0 %	0 %	327401860
1066	NC_015320	ACTTG	2	10	1771691	1771700	20 %	40 %	20 %	20 %	327401863
1067	NC_015320	CATCC	2	10	1772895	1772904	20 %	20 %	0 %	60 %	327401864
1068	NC_015320	AAATG	2	10	1777173	1777182	60 %	20 %	20 %	0 %	327401868
1069	NC_015320	GCATG	2	10	1777437	1777446	20 %	20 %	40 %	20 %	327401869
1070	NC_015320	TGGAC	2	10	1780760	1780769	20 %	20 %	40 %	20 %	327401873
1071	NC_015320	AATTT	2	10	1781146	1781155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015320	AGTTC	2	10	1781430	1781439	20 %	40 %	20 %	20 %	327401875
1073	NC_015320	TGAAG	2	10	1783659	1783668	40 %	20 %	40 %	0 %	327401876
1074	NC_015320	AGAAT	2	10	1783815	1783824	60 %	20 %	20 %	0 %	327401877
1075	NC_015320	CAGAG	2	10	1784276	1784285	40 %	0 %	40 %	20 %	327401878
1076	NC_015320	ACGAA	2	10	1784896	1784905	60 %	0 %	20 %	20 %	327401879
1077	NC_015320	GCATC	2	10	1788953	1788962	20 %	20 %	20 %	40 %	327401883
1078	NC_015320	GAAAG	2	10	1789588	1789597	60 %	0 %	40 %	0 %	327401884
1079	NC_015320	GATGC	2	10	1792874	1792883	20 %	20 %	40 %	20 %	327401887
1080	NC_015320	GACTT	2	10	1793599	1793608	20 %	40 %	20 %	20 %	327401888
1081	NC_015320	TTCTC	2	10	1794038	1794047	0 %	60 %	0 %	40 %	327401888
1082	NC_015320	CCCGG	2	10	1796677	1796686	0 %	0 %	40 %	60 %	327401890
1083	NC_015320	AATTG	2	10	1796907	1796916	40 %	40 %	20 %	0 %	327401890
1084	NC_015320	TGGCA	2	10	1797749	1797758	20 %	20 %	40 %	20 %	327401892
1085	NC_015320	TGAGT	2	10	1800763	1800772	20 %	40 %	40 %	0 %	327401894
1086	NC_015320	ATTTT	2	10	1800806	1800815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015320	TTTTA	2	10	1800912	1800921	20 %	80 %	0 %	0 %	327401895
1088	NC_015320	TCCTT	2	10	1801266	1801275	0 %	60 %	0 %	40 %	327401895
1089	NC_015320	GAATG	2	10	1804785	1804794	40 %	20 %	40 %	0 %	327401897
1090	NC_015320	CTCTT	2	10	1808238	1808247	0 %	60 %	0 %	40 %	327401901
1091	NC_015320	GAATC	2	10	1808360	1808369	40 %	20 %	20 %	20 %	327401901
1092	NC_015320	GCCAT	2	10	1808694	1808703	20 %	20 %	20 %	40 %	327401902
1093	NC_015320	TCCGC	2	10	1808839	1808848	0 %	20 %	20 %	60 %	327401902
1094	NC_015320	AAGCG	2	10	1811178	1811187	40 %	0 %	40 %	20 %	327401905
1095	NC_015320	CTTTT	2	10	1811607	1811616	0 %	80 %	0 %	20 %	327401906
1096	NC_015320	TATAA	2	10	1811939	1811948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015320	CCCGC	2	10	1820283	1820292	0 %	0 %	20 %	80 %	327401914
1098	NC_015320	ATAAA	2	10	1822179	1822188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015320	TAATA	2	10	1822730	1822739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015320	TGCAA	2	10	1824324	1824333	40 %	20 %	20 %	20 %	327401923
1101	NC_015320	TGATT	2	10	1824598	1824607	20 %	60 %	20 %	0 %	327401924
1102	NC_015320	GAAGG	2	10	1824879	1824888	40 %	0 %	60 %	0 %	327401925
1103	NC_015320	AGATG	2	10	1825251	1825260	40 %	20 %	40 %	0 %	327401926
1104	NC_015320	GAAAA	2	10	1826548	1826557	80 %	0 %	20 %	0 %	327401929
1105	NC_015320	CGTTA	2	10	1827554	1827563	20 %	40 %	20 %	20 %	327401933
1106	NC_015320	AAGGT	2	10	1830141	1830150	40 %	20 %	40 %	0 %	327401938
1107	NC_015320	ACGTT	2	10	1830233	1830242	20 %	40 %	20 %	20 %	327401939
1108	NC_015320	AAATC	2	10	1831344	1831353	60 %	20 %	0 %	20 %	327401941
1109	NC_015320	TTCTA	2	10	1831456	1831465	20 %	60 %	0 %	20 %	327401942
1110	NC_015320	TCCAC	2	10	1832383	1832392	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1111	NC_015320	CAAAT	2	10	1833128	1833137	60 %	20 %	0 %	20 %	327401944
1112	NC_015320	AAGAG	2	10	1834143	1834152	60 %	0 %	40 %	0 %	327401945
1113	NC_015320	CGATA	2	10	1835538	1835547	40 %	20 %	20 %	20 %	327401945
1114	NC_015320	GCAAA	2	10	1837511	1837520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_015320	TCCAA	2	10	1841051	1841060	40 %	20 %	0 %	40 %	327401951
1116	NC_015320	AAATA	2	10	1845302	1845311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015320	GGACT	2	10	1846022	1846031	20 %	20 %	40 %	20 %	327401954
1118	NC_015320	ACAGA	2	10	1846271	1846280	60 %	0 %	20 %	20 %	327401954
1119	NC_015320	TGATC	2	10	1847273	1847282	20 %	40 %	20 %	20 %	327401956
1120	NC_015320	GAGTA	2	10	1856119	1856128	40 %	20 %	40 %	0 %	327401964
1121	NC_015320	GAAGA	2	10	1856244	1856253	60 %	0 %	40 %	0 %	327401964
1122	NC_015320	TGCCT	2	10	1857983	1857992	0 %	40 %	20 %	40 %	327401967
1123	NC_015320	CCACT	2	10	1858201	1858210	20 %	20 %	0 %	60 %	327401967
1124	NC_015320	GAAAG	2	10	1861614	1861623	60 %	0 %	40 %	0 %	327401969
1125	NC_015320	CCACT	2	10	1863032	1863041	20 %	20 %	0 %	60 %	327401971
1126	NC_015320	TGTGG	2	10	1865861	1865870	0 %	40 %	60 %	0 %	327401974
1127	NC_015320	TCCAT	2	10	1867221	1867230	20 %	40 %	0 %	40 %	327401976
1128	NC_015320	CTATT	2	10	1868463	1868472	20 %	60 %	0 %	20 %	327401977
1129	NC_015320	ACTCC	2	10	1869053	1869062	20 %	20 %	0 %	60 %	327401978
1130	NC_015320	TGGAT	2	10	1872237	1872246	20 %	40 %	40 %	0 %	327401980
1131	NC_015320	GAAGA	2	10	1873097	1873106	60 %	0 %	40 %	0 %	327401980
1132	NC_015320	AAAAT	2	10	1874767	1874776	80 %	20 %	0 %	0 %	327401982
1133	NC_015320	TCAAA	2	10	1878615	1878624	60 %	20 %	0 %	20 %	327401988
1134	NC_015320	GTGAA	2	10	1881729	1881738	40 %	20 %	40 %	0 %	327401991
1135	NC_015320	AGCTA	2	10	1882497	1882506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_015320	AACGA	2	10	1883060	1883069	60 %	0 %	20 %	20 %	327401992
1137	NC_015320	CCTTC	2	10	1883909	1883918	0 %	40 %	0 %	60 %	327401992
1138	NC_015320	TTTTA	2	10	1887139	1887148	20 %	80 %	0 %	0 %	327401995
1139	NC_015320	AATCC	2	10	1887764	1887773	40 %	20 %	0 %	40 %	327401996
1140	NC_015320	AAATC	2	10	1888624	1888633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1141	NC_015320	CAGTC	2	10	1889255	1889264	20 %	20 %	20 %	40 %	327401997
1142	NC_015320	GCAAT	2	10	1889940	1889949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1143	NC_015320	ATCGA	2	10	1892430	1892439	40 %	20 %	20 %	20 %	327402000
1144	NC_015320	TGAAG	2	10	1893227	1893236	40 %	20 %	40 %	0 %	327402000
1145	NC_015320	AGGGA	2	10	1894102	1894111	40 %	0 %	60 %	0 %	327402000
1146	NC_015320	TGCCA	2	10	1895027	1895036	20 %	20 %	20 %	40 %	327402003
1147	NC_015320	TGGTG	2	10	1895257	1895266	0 %	40 %	60 %	0 %	327402003
1148	NC_015320	TCCGC	2	10	1895528	1895537	0 %	20 %	20 %	60 %	327402003
1149	NC_015320	CGTCC	2	10	1897181	1897190	0 %	20 %	20 %	60 %	327402004
1150	NC_015320	TCGAG	2	10	1897294	1897303	20 %	20 %	40 %	20 %	327402004
1151	NC_015320	GAAGA	2	10	1899376	1899385	60 %	0 %	40 %	0 %	327402007

< Previous 1 23Next >