MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015320	GAAG	2	8	7	14	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015320	TTTA	2	8	5215	5222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015320	GTAC	2	8	10982	10989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015320	GTAT	2	8	11034	11041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015320	CTCG	2	8	13990	13997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015320	TAAC	2	8	14905	14912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015320	TGGG	2	8	16156	16163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015320	TCAA	2	8	16794	16801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015320	CTTC	2	8	25716	25723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015320	ATCT	2	8	28301	28308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015320	AGGG	2	8	31239	31246	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015320	ATAC	2	8	42008	42015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015320	TTCT	2	8	51321	51328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015320	GTAT	2	8	52476	52483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015320	TTGC	2	8	53833	53840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015320	CTTT	2	8	55277	55284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015320	TAAA	2	8	59945	59952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015320	TGGA	2	8	60002	60009	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015320	GGAG	2	8	68160	68167	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015320	ACTG	2	8	73912	73919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015320	AAAT	2	8	74795	74802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015320	AAAT	2	8	75771	75778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015320	GCCA	2	8	79279	79286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015320	CTTT	2	8	79352	79359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015320	AAGC	2	8	79416	79423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015320	TACT	2	8	79554	79561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015320	CTTT	2	8	81996	82003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015320	CGTC	2	8	83394	83401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015320	GAAA	2	8	83735	83742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015320	GTTG	2	8	83821	83828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015320	TGGC	2	8	84265	84272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015320	GTTC	2	8	84463	84470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015320	AAGT	2	8	84626	84633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015320	TTAA	2	8	85206	85213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015320	GTCG	2	8	90153	90160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015320	TACA	2	8	90193	90200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015320	AGCC	2	8	107821	107828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015320	AAAT	2	8	120363	120370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015320	TAGT	2	8	120473	120480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015320	AAAT	2	8	121736	121743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015320	TATT	2	8	121880	121887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015320	AAAT	2	8	121888	121895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015320	GAGC	2	8	122636	122643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015320	TGTT	2	8	122669	122676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015320	ATAA	2	8	130163	130170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015320	TGAG	2	8	130212	130219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015320	TGCT	2	8	132564	132571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015320	AAAC	2	8	137391	137398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015320	TAAA	2	8	137423	137430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015320	TCCC	2	8	144696	144703	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_015320	GAAG	2	8	145700	145707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015320	TTAA	2	8	145745	145752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015320	CCTG	2	8	150354	150361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015320	ATTA	2	8	153834	153841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015320	TGCT	2	8	155856	155863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015320	TTAT	2	8	157409	157416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015320	CTGC	2	8	157434	157441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015320	GCCT	2	8	158548	158555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015320	TGCC	2	8	158654	158661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015320	AAAT	2	8	161781	161788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015320	TTCC	2	8	162835	162842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015320	GAAC	2	8	169498	169505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015320	CTAC	2	8	171324	171331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015320	GCTT	2	8	173870	173877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015320	TTGG	2	8	174729	174736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015320	AGTT	2	8	174741	174748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015320	GGCA	2	8	174767	174774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015320	ACGG	2	8	175201	175208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015320	AGCC	2	8	175345	175352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015320	ATGC	2	8	176742	176749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015320	AAAG	2	8	180084	180091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015320	TGAA	2	8	181030	181037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015320	TTAG	2	8	189158	189165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015320	AAGT	2	8	190750	190757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015320	GAAG	2	8	193434	193441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015320	AATG	2	8	194077	194084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015320	TTTA	2	8	197203	197210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015320	AAAT	2	8	197483	197490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015320	GTTT	2	8	197504	197511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015320	CGGG	2	8	197697	197704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015320	GCTG	2	8	198102	198109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015320	CCAG	2	8	201353	201360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015320	GAAG	3	12	206945	206956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015320	AGCA	2	8	217973	217980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015320	AGTA	2	8	221418	221425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015320	CTGA	2	8	227442	227449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015320	AGCA	2	8	227469	227476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015320	AATC	2	8	227946	227953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015320	AGAC	2	8	228093	228100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015320	TACT	2	8	228195	228202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015320	TTCT	2	8	229205	229212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015320	GAAA	2	8	229346	229353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015320	ATTA	2	8	234960	234967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015320	AAAG	2	8	235069	235076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015320	ATTA	2	8	240153	240160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015320	TTTA	2	8	244219	244226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015320	TTTG	2	8	245411	245418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015320	TATT	2	8	250062	250069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015320	TGTC	2	8	251961	251968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015320	AACA	2	8	251987	251994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015320	AACC	2	8	252041	252048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015320	AGTA	2	8	253557	253564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015320	AAAT	2	8	255333	255340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015320	ATTT	2	8	258307	258314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015320	ATTT	2	8	273834	273841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015320	ACGT	2	8	282407	282414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015320	GGAA	2	8	282433	282440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015320	AAGG	2	8	282889	282896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015320	GAAC	2	8	283253	283260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015320	AATA	2	8	283282	283289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015320	AATT	2	8	299569	299576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015320	AAAC	2	8	300470	300477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015320	TAAT	2	8	301324	301331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015320	TAAT	2	8	301516	301523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015320	ATTT	2	8	304683	304690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015320	TATT	2	8	304697	304704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015320	TGGA	2	8	304744	304751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015320	GGAT	2	8	306264	306271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015320	TAAA	2	8	308612	308619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015320	AACT	2	8	319976	319983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015320	TCAA	2	8	336668	336675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015320	TTAT	2	8	336731	336738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015320	TCTA	2	8	336739	336746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015320	ATTA	2	8	338095	338102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015320	TATT	2	8	343085	343092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015320	TTGC	2	8	350300	350307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015320	GGGT	2	8	350331	350338	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015320	AAGG	2	8	352936	352943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015320	AAGA	2	8	353821	353828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015320	ATAG	2	8	353876	353883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015320	TAAT	2	8	359675	359682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015320	AAAG	2	8	361593	361600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015320	ATTT	2	8	368736	368743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015320	ATTT	2	8	371316	371323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015320	AAAT	2	8	385528	385535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015320	ATTT	2	8	385972	385979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015320	GATG	2	8	386376	386383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015320	GGAC	2	8	386459	386466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015320	AAGG	2	8	392823	392830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015320	ACTC	2	8	398559	398566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015320	ATGA	2	8	398816	398823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015320	AAGA	2	8	400943	400950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015320	TTTA	2	8	409917	409924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015320	TTTG	2	8	411015	411022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015320	TAAA	2	8	411681	411688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015320	GCTT	2	8	413234	413241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015320	AATT	2	8	413382	413389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015320	CTTT	2	8	413414	413421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015320	AAGT	2	8	414117	414124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015320	TGAT	2	8	414634	414641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015320	TGCA	2	8	414781	414788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015320	TGCC	2	8	414906	414913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015320	AATC	2	8	417883	417890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_015320	TGTT	2	8	418115	418122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015320	AAGC	2	8	422081	422088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_015320	CCCA	2	8	426345	426352	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
162	NC_015320	GGCA	2	8	437981	437988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_015320	TATG	2	8	438146	438153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015320	TCCT	2	8	470236	470243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_015320	TTAA	2	8	500540	500547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_015320	ATTA	2	8	644239	644246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_015320	AATT	2	8	644253	644260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_015320	GCAG	2	8	1397032	1397039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
446	NC_015320	GCAC	2	8	1397162	1397169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
447	NC_015320	CAGG	2	8	1398069	1398076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_015320	TATC	3	12	1417470	1417481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
452	NC_015320	TCTA	2	8	1432403	1432410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
453	NC_015320	GCAA	2	8	1436924	1436931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
454	NC_015320	CATG	2	8	1447602	1447609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
455	NC_015320	AATT	2	8	1456294	1456301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_015320	AAAT	2	8	1484768	1484775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_015320	GACT	2	8	1505928	1505935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
461	NC_015320	TAAA	2	8	1510692	1510699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_015320	GAGG	2	8	1529469	1529476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015320	GGAT	2	8	1529817	1529824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_015320	CCGG	2	8	1545705	1545712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_015320	CAAA	2	8	1547318	1547325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
466	NC_015320	GGGA	2	8	1547335	1547342	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
467	NC_015320	CCCG	2	8	1547613	1547620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
468	NC_015320	CTGG	2	8	1549637	1549644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
469	NC_015320	TATC	2	8	1549907	1549914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
470	NC_015320	CTAA	2	8	1556450	1556457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
471	NC_015320	TTTC	2	8	1558024	1558031	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
472	NC_015320	GAGT	2	8	1558092	1558099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_015320	AAGC	2	8	1589019	1589026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
475	NC_015320	AAAT	2	8	1598411	1598418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_015320	TTGG	2	8	1636907	1636914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015320	GAAG	2	8	1640518	1640525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015320	TATT	2	8	1640628	1640635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015320	TAAG	2	8	1641297	1641304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_015320	CGGG	2	8	1642368	1642375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015320	TATT	2	8	1653859	1653866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015320	GATA	3	12	1653995	1654006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_015320	GCAG	2	8	1665254	1665261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_015320	TGAA	2	8	1665500	1665507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015320	TTTC	2	8	1665564	1665571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
491	NC_015320	GCTC	2	8	1667198	1667205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_015320	TCGT	2	8	1669297	1669304	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_015320	AGGG	2	8	1678040	1678047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_015320	GTAA	2	8	1685845	1685852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_015320	TACT	2	8	1696444	1696451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_015320	TCTT	2	8	1697723	1697730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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