MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	ACTATT	2	12	684	695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	327399881
2	NC_015319	ACTTTT	2	12	10079	10090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015319	ACTTTT	2	12	10118	10129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015319	ACTTTT	2	12	10157	10168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015319	ACTTTT	2	12	10196	10207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015319	TCATTA	2	12	13713	13724	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015319	ATTGAA	2	12	15603	15614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	327399902
8	NC_015319	GCAATT	2	12	16209	16220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327399902
9	NC_015319	CCAATT	2	12	16293	16304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399902
10	NC_015319	TTTAAT	2	12	21744	21755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015319	TTAATT	2	12	22776	22787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015319	TGATCA	2	12	25289	25300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	327399911
13	NC_015319	CTTAAG	2	12	27922	27933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015319	AATTAT	2	12	29770	29781	50 %	50 %	0 %	0 %	327399916
15	NC_015319	TATTTT	2	12	30344	30355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	327399916
16	NC_015319	CTTTTT	2	12	31334	31345	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	327399917
17	NC_015319	ATAACT	2	12	31579	31590	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	327399917
18	NC_015319	ATATAA	2	12	32943	32954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399919
19	NC_015319	TTTCTC	2	12	33582	33593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.