MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	CAATT	2	10	937	946	40 %	40 %	0 %	20 %	327399881
2	NC_015319	GTGAA	2	10	972	981	40 %	20 %	40 %	0 %	327399881
3	NC_015319	AAATA	2	10	1158	1167	80 %	20 %	0 %	0 %	327399881
4	NC_015319	TAAAT	2	10	2410	2419	60 %	40 %	0 %	0 %	327399883
5	NC_015319	CTTAA	2	10	3611	3620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015319	ATCCA	2	10	8995	9004	40 %	20 %	0 %	40 %	327399894
7	NC_015319	TTTTA	2	10	10454	10463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015319	ATATT	2	10	10797	10806	40 %	60 %	0 %	0 %	327399896
9	NC_015319	TTTAT	2	10	10871	10880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015319	CTTTT	2	10	13579	13588	0 %	80 %	0 %	20 %	327399900
11	NC_015319	TTTTG	2	10	13600	13609	0 %	80 %	20 %	0 %	327399900
12	NC_015319	ATTAC	2	10	15032	15041	40 %	40 %	0 %	20 %	327399901
13	NC_015319	TAATT	2	10	15220	15229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015319	AAAAT	2	10	16607	16616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015319	AGTCT	2	10	17932	17941	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015319	ATGCA	2	10	19181	19190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015319	ACTAC	2	10	20629	20638	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015319	TTGTT	2	10	23192	23201	0 %	80 %	20 %	0 %	327399910
19	NC_015319	GCTCT	2	10	23323	23332	0 %	40 %	20 %	40 %	327399910
20	NC_015319	GCTCT	2	10	23431	23440	0 %	40 %	20 %	40 %	327399910
21	NC_015319	TACAT	2	10	24066	24075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015319	TAATT	2	10	24147	24156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015319	AAATA	2	10	26518	26527	80 %	20 %	0 %	0 %	327399912
24	NC_015319	GATTA	2	10	27794	27803	40 %	40 %	20 %	0 %	327399913
25	NC_015319	TCTGA	2	10	27903	27912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015319	TTTCA	2	10	30789	30798	20 %	60 %	0 %	20 %	327399917
27	NC_015319	AACTA	2	10	31595	31604	60 %	20 %	0 %	20 %	327399918
28	NC_015319	AAAAT	2	10	31671	31680	80 %	20 %	0 %	0 %	327399918
29	NC_015319	GTATA	2	10	32502	32511	40 %	40 %	20 %	0 %	327399918
30	NC_015319	AAAAT	2	10	33186	33195	80 %	20 %	0 %	0 %	327399919
31	NC_015319	TACAA	2	10	33568	33577	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.