MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	AATT	2	8	151	158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015319	TCTA	2	8	2564	2571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015319	ATTT	2	8	3656	3663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015319	TATT	2	8	3731	3738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015319	TAAA	2	8	3852	3859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015319	CTTT	2	8	5578	5585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015319	ATTA	2	8	7429	7436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015319	TGTT	2	8	8191	8198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015319	TTTA	2	8	8243	8250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015319	TCAT	2	8	8306	8313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015319	CTAA	2	8	9545	9552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015319	TAAA	2	8	9795	9802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015319	TTCA	2	8	9828	9835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015319	TATT	2	8	9970	9977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015319	AATA	2	8	9985	9992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015319	TAGT	2	8	10070	10077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015319	TTAA	2	8	11451	11458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015319	ATTA	2	8	11712	11719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015319	CTTA	2	8	15179	15186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015319	TAAA	2	8	15197	15204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015319	TTAC	2	8	17918	17925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015319	ATCA	2	8	19544	19551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015319	TTCC	2	8	19695	19702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015319	ACTA	2	8	21991	21998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015319	TACT	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015319	ATTT	2	8	24289	24296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015319	AATA	2	8	24745	24752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015319	TTCG	2	8	26196	26203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015319	ATTT	2	8	26296	26303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.