MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	ACA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015319	TCT	2	6	143	148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015319	TAA	2	6	216	221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015319	TCA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015319	TTA	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015319	AAT	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015319	TAT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015319	TTA	3	9	434	442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
9	NC_015319	TAT	2	6	767	772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
10	NC_015319	ATT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
11	NC_015319	CTT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399881
12	NC_015319	ATG	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399881
13	NC_015319	CTA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399881
14	NC_015319	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
15	NC_015319	TTA	2	6	1063	1068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
16	NC_015319	CCA	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399881
17	NC_015319	TAA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
18	NC_015319	AAT	2	6	1251	1256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
19	NC_015319	CTA	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399881
20	NC_015319	GTA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399881
21	NC_015319	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399881
22	NC_015319	TAT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
23	NC_015319	TAA	2	6	1913	1918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
24	NC_015319	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015319	AAT	2	6	2019	2024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399882
26	NC_015319	TCT	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399882
27	NC_015319	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399882
28	NC_015319	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399882
29	NC_015319	CCT	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015319	ATT	2	6	2354	2359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015319	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399883
32	NC_015319	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399883
33	NC_015319	GTT	3	9	2495	2503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399883
34	NC_015319	TCA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015319	AAT	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015319	TAT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015319	GTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015319	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015319	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015319	TGA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399884
41	NC_015319	GTA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399885
42	NC_015319	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399885
43	NC_015319	GCT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399885
44	NC_015319	TAT	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399885
45	NC_015319	TTC	2	6	3273	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399885
46	NC_015319	GAA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399885
47	NC_015319	TAC	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399885
48	NC_015319	AAG	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399885
49	NC_015319	ATC	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399885
50	NC_015319	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399885
51	NC_015319	TAT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015319	GCT	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015319	AGG	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015319	GAA	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399886
55	NC_015319	GAT	3	9	3926	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
56	NC_015319	AAT	2	6	3994	3999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399886
57	NC_015319	ATG	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
58	NC_015319	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399886
59	NC_015319	CTA	2	6	4117	4122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399886
60	NC_015319	CCA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399886
61	NC_015319	GAT	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
62	NC_015319	TGA	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
63	NC_015319	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
64	NC_015319	GAT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
65	NC_015319	TGA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
66	NC_015319	ATT	3	9	4653	4661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399887
67	NC_015319	TAC	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399887
68	NC_015319	CGA	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399887
69	NC_015319	TGA	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
70	NC_015319	AGA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
71	NC_015319	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
72	NC_015319	TAG	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
73	NC_015319	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
74	NC_015319	AGG	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399887
75	NC_015319	GAT	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
76	NC_015319	TGA	2	6	5116	5121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
77	NC_015319	GAA	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
78	NC_015319	AAT	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399887
79	NC_015319	ATA	2	6	5373	5378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015319	ATT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399888
81	NC_015319	ATC	3	9	5476	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399888
82	NC_015319	GTT	2	6	5682	5687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399889
83	NC_015319	CAA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399889
84	NC_015319	ATC	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
85	NC_015319	ATC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
86	NC_015319	TAC	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
87	NC_015319	TAA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399889
88	NC_015319	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399890
89	NC_015319	ATC	2	6	5968	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399890
90	NC_015319	ATT	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399890
91	NC_015319	GTT	2	6	6050	6055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399890
92	NC_015319	TCC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015319	CTT	2	6	6150	6155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015319	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015319	TTA	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399891
96	NC_015319	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399892
97	NC_015319	CTT	2	6	6356	6361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399892
98	NC_015319	GCT	2	6	6405	6410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399892
99	NC_015319	GTA	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399892
100	NC_015319	TCT	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399892
101	NC_015319	AAT	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015319	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015319	TAC	2	6	7033	7038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015319	ATT	2	6	7189	7194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015319	GTT	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015319	TGG	2	6	7487	7492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399893
107	NC_015319	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399893
108	NC_015319	GAA	3	9	7589	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399893
109	NC_015319	ACA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399893
110	NC_015319	CTT	2	6	7901	7906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015319	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015319	ACA	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015319	TAT	2	6	8291	8296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015319	GTA	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015319	TAC	2	6	8420	8425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015319	TTA	2	6	8487	8492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399894
117	NC_015319	ATT	2	6	8571	8576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399894
118	NC_015319	AAT	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399894
119	NC_015319	TCT	2	6	8718	8723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399894
120	NC_015319	TAA	2	6	8824	8829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399894
121	NC_015319	GAT	2	6	8924	8929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399894
122	NC_015319	GTG	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399894
123	NC_015319	AAG	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399894
124	NC_015319	TTA	2	6	9208	9213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399894
125	NC_015319	TAC	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399894
126	NC_015319	AAT	2	6	9264	9269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399894
127	NC_015319	TTC	2	6	9363	9368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015319	AAT	2	6	9411	9416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015319	ATT	2	6	9505	9510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015319	CAA	2	6	9517	9522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015319	TTC	2	6	9619	9624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015319	TGA	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015319	CAT	2	6	9769	9774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015319	AAT	2	6	9837	9842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015319	CAT	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015319	GAA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015319	ATT	3	9	9999	10007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015319	ATT	2	6	10049	10054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015319	TAA	2	6	10184	10189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015319	ATC	2	6	10241	10246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015319	ATA	2	6	10253	10258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015319	TAA	2	6	10368	10373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015319	CAT	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399895
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157	NC_015319	ATA	2	6	11485	11490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015319	TTA	2	6	11507	11512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015319	GTG	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015319	GTT	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015319	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399898
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259	NC_015319	TCA	2	6	18868	18873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399905
260	NC_015319	ATG	2	6	18915	18920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399905
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262	NC_015319	ACC	2	6	19095	19100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399905
263	NC_015319	AAT	2	6	19119	19124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399905
264	NC_015319	TAT	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015319	TTA	2	6	19280	19285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015319	TAT	2	6	19307	19312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_015319	ATT	2	6	19487	19492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015319	CTG	2	6	19501	19506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_015319	TAT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015319	ATA	2	6	19640	19645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015319	CAA	2	6	19728	19733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_015319	ATT	2	6	19797	19802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015319	CAT	2	6	19925	19930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399906
274	NC_015319	TAT	2	6	20025	20030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399906
275	NC_015319	CTA	2	6	20033	20038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399906
276	NC_015319	GAC	2	6	20043	20048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399906
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280	NC_015319	ATG	2	6	20318	20323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015319	CTG	2	6	20360	20365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015319	CAT	2	6	20504	20509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_015319	ATG	2	6	20618	20623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_015319	CTT	2	6	21035	21040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399907
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286	NC_015319	TAT	2	6	21191	21196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399907
287	NC_015319	TCA	2	6	21294	21299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399907
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289	NC_015319	CTA	2	6	21334	21339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399907
290	NC_015319	ATA	2	6	21382	21387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
291	NC_015319	AAT	2	6	21392	21397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399907
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294	NC_015319	CTT	2	6	21469	21474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_015319	ATT	2	6	21492	21497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015319	TTA	2	6	21514	21519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_015319	CCT	2	6	21686	21691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_015319	TAT	2	6	21758	21763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015319	CAA	2	6	21866	21871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_015319	GAG	2	6	21914	21919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_015319	TAT	2	6	23940	23945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_015319	ATA	2	6	23970	23975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_015319	TAT	2	6	23976	23981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_015319	GAT	2	6	24248	24253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NC_015319	TAA	2	6	24511	24516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_015319	ATA	3	9	24689	24697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_015319	GTA	2	6	28779	28784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
388	NC_015319	ATA	2	6	28892	28897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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