MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	TTA	3	9	434	442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
2	NC_015319	TAT	2	6	767	772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
3	NC_015319	ATT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
4	NC_015319	CTT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399881
5	NC_015319	ATG	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399881
6	NC_015319	CTA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399881
7	NC_015319	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
8	NC_015319	TTA	2	6	1063	1068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
9	NC_015319	CCA	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399881
10	NC_015319	TAA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
11	NC_015319	AAT	2	6	1251	1256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
12	NC_015319	CTA	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399881
13	NC_015319	GTA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399881
14	NC_015319	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399881
15	NC_015319	TAT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
16	NC_015319	TAA	2	6	1913	1918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
17	NC_015319	AAT	2	6	2019	2024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399882
18	NC_015319	TCT	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399882
19	NC_015319	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399882
20	NC_015319	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399882
21	NC_015319	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399883
22	NC_015319	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399883
23	NC_015319	GTT	3	9	2495	2503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399883
24	NC_015319	TGA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399884
25	NC_015319	GTA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399885
26	NC_015319	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399885
27	NC_015319	GCT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399885
28	NC_015319	TAT	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399885
29	NC_015319	TTC	2	6	3273	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399885
30	NC_015319	GAA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399885
31	NC_015319	TAC	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399885
32	NC_015319	AAG	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399885
33	NC_015319	ATC	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399885
34	NC_015319	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399885
35	NC_015319	GAA	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399886
36	NC_015319	GAT	3	9	3926	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
37	NC_015319	AAT	2	6	3994	3999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399886
38	NC_015319	ATG	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
39	NC_015319	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399886
40	NC_015319	CTA	2	6	4117	4122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399886
41	NC_015319	CCA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399886
42	NC_015319	GAT	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
43	NC_015319	TGA	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
44	NC_015319	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
45	NC_015319	GAT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
46	NC_015319	TGA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
47	NC_015319	ATT	3	9	4653	4661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399887
48	NC_015319	TAC	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399887
49	NC_015319	CGA	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399887
50	NC_015319	TGA	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
51	NC_015319	AGA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
52	NC_015319	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
53	NC_015319	TAG	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
54	NC_015319	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
55	NC_015319	AGG	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399887
56	NC_015319	GAT	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
57	NC_015319	TGA	2	6	5116	5121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
58	NC_015319	GAA	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
59	NC_015319	AAT	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399887
60	NC_015319	ATT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399888
61	NC_015319	ATC	3	9	5476	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399888
62	NC_015319	GTT	2	6	5682	5687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399889
63	NC_015319	CAA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399889
64	NC_015319	ATC	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
65	NC_015319	ATC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
66	NC_015319	TAC	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
67	NC_015319	TAA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399889
68	NC_015319	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399890
69	NC_015319	ATC	2	6	5968	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399890
70	NC_015319	ATT	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399890
71	NC_015319	GTT	2	6	6050	6055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399890
72	NC_015319	TTA	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399891
73	NC_015319	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399892
74	NC_015319	CTT	2	6	6356	6361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399892
75	NC_015319	GCT	2	6	6405	6410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399892
76	NC_015319	GTA	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399892
77	NC_015319	TCT	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399892
78	NC_015319	TGG	2	6	7487	7492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399893
79	NC_015319	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399893
80	NC_015319	GAA	3	9	7589	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399893
81	NC_015319	ACA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399893
82	NC_015319	TTA	2	6	8487	8492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399894
83	NC_015319	ATT	2	6	8571	8576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399894
84	NC_015319	AAT	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399894
85	NC_015319	TCT	2	6	8718	8723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399894
86	NC_015319	TAA	2	6	8824	8829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399894
87	NC_015319	GAT	2	6	8924	8929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399894
88	NC_015319	GTG	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399894
89	NC_015319	AAG	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399894
90	NC_015319	TTA	2	6	9208	9213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399894
91	NC_015319	TAC	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399894
92	NC_015319	AAT	2	6	9264	9269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399894
93	NC_015319	CAT	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399895
94	NC_015319	TAA	2	6	10633	10638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399896
95	NC_015319	ATT	2	6	10686	10691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399896
96	NC_015319	ATA	2	6	10821	10826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399896
97	NC_015319	GTT	2	6	11091	11096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399897
98	NC_015319	AAG	2	6	11162	11167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399897
99	NC_015319	ATA	2	6	11221	11226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399897
100	NC_015319	GTT	2	6	11302	11307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399897
101	NC_015319	CAA	2	6	11329	11334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399897
102	NC_015319	TAA	2	6	11345	11350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399897
103	NC_015319	CAA	3	9	11361	11369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399897
104	NC_015319	AAT	2	6	11380	11385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399897
105	NC_015319	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399898
106	NC_015319	CAT	2	6	11847	11852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399898
107	NC_015319	ATA	2	6	11881	11886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399898
108	NC_015319	AAT	2	6	11989	11994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399898
109	NC_015319	CTT	2	6	12018	12023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399898
110	NC_015319	CAA	2	6	12102	12107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399898
111	NC_015319	CAC	2	6	12415	12420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399899
112	NC_015319	AAT	2	6	12461	12466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399899
113	NC_015319	CTC	2	6	12467	12472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399899
114	NC_015319	ATT	2	6	12516	12521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399899
115	NC_015319	TAC	2	6	12761	12766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399899
116	NC_015319	CAA	2	6	12817	12822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399900
117	NC_015319	CAT	2	6	12849	12854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399900
118	NC_015319	CAA	2	6	12870	12875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399900
119	NC_015319	CCA	3	9	12977	12985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399900
120	NC_015319	TTG	2	6	12993	12998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399900
121	NC_015319	CTA	2	6	13005	13010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399900
122	NC_015319	ATG	2	6	13028	13033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399900
123	NC_015319	GTA	2	6	13059	13064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399900
124	NC_015319	AGC	2	6	13105	13110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399900
125	NC_015319	ATC	2	6	13195	13200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399900
126	NC_015319	TAA	2	6	13270	13275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399900
127	NC_015319	ATT	2	6	13289	13294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399900
128	NC_015319	AGC	2	6	13324	13329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399900
129	NC_015319	CAT	2	6	13389	13394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399900
130	NC_015319	TTA	2	6	13395	13400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399900
131	NC_015319	ACT	2	6	13553	13558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399900
132	NC_015319	GTC	2	6	13568	13573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399900
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139	NC_015319	CAT	2	6	13990	13995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399901
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151	NC_015319	TAA	2	6	14703	14708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399901
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163	NC_015319	CAA	2	6	15805	15810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399902
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.