MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	AT	4	8	504	511	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
2	NC_015319	TA	3	6	711	716	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
3	NC_015319	AT	3	6	999	1004	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
4	NC_015319	AT	3	6	1541	1546	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
5	NC_015319	TG	3	6	2811	2816	0 %	50 %	50 %	0 %	327399884
6	NC_015319	AC	3	6	2866	2871	50 %	0 %	0 %	50 %	327399885
7	NC_015319	AT	3	6	3686	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015319	AT	3	6	3710	3715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015319	TG	3	6	4249	4254	0 %	50 %	50 %	0 %	327399886
10	NC_015319	AT	3	6	4324	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	327399886
11	NC_015319	AT	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	327399887
12	NC_015319	AT	3	6	5798	5803	50 %	50 %	0 %	0 %	327399889
13	NC_015319	AT	3	6	6981	6986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015319	AG	3	6	7975	7980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015319	TG	3	6	8280	8285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015319	AT	3	6	8481	8486	50 %	50 %	0 %	0 %	327399894
17	NC_015319	TA	3	6	8757	8762	50 %	50 %	0 %	0 %	327399894
18	NC_015319	AT	3	6	9256	9261	50 %	50 %	0 %	0 %	327399894
19	NC_015319	AC	3	6	9344	9349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015319	TC	3	6	10496	10501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015319	TC	3	6	10550	10555	0 %	50 %	0 %	50 %	327399895
22	NC_015319	TA	3	6	11412	11417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015319	AG	3	6	12248	12253	50 %	0 %	50 %	0 %	327399898
24	NC_015319	GA	3	6	12297	12302	50 %	0 %	50 %	0 %	327399898
25	NC_015319	TA	3	6	13425	13430	50 %	50 %	0 %	0 %	327399900
26	NC_015319	AT	3	6	14378	14383	50 %	50 %	0 %	0 %	327399901
27	NC_015319	AT	3	6	14473	14478	50 %	50 %	0 %	0 %	327399901
28	NC_015319	GT	4	8	14895	14902	0 %	50 %	50 %	0 %	327399901
29	NC_015319	GC	3	6	15309	15314	0 %	0 %	50 %	50 %	327399902
30	NC_015319	TA	3	6	17807	17812	50 %	50 %	0 %	0 %	327399903
31	NC_015319	CT	3	6	18301	18306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015319	TA	3	6	19653	19658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015319	TA	3	6	19714	19719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015319	TA	3	6	20301	20306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015319	AT	3	6	20462	20467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015319	GA	3	6	20550	20555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015319	AT	3	6	21025	21030	50 %	50 %	0 %	0 %	327399907
38	NC_015319	AC	3	6	21932	21937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015319	AG	3	6	22126	22131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015319	AT	3	6	24237	24242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015319	AT	3	6	24273	24278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015319	AT	3	6	24306	24311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015319	TA	4	8	24325	24332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015319	TA	3	6	25446	25451	50 %	50 %	0 %	0 %	327399911
45	NC_015319	TA	3	6	27165	27170	50 %	50 %	0 %	0 %	327399913
46	NC_015319	AT	3	6	27194	27199	50 %	50 %	0 %	0 %	327399913
47	NC_015319	AT	3	6	29097	29102	50 %	50 %	0 %	0 %	327399915
48	NC_015319	AT	3	6	29353	29358	50 %	50 %	0 %	0 %	327399915
49	NC_015319	TA	3	6	29673	29678	50 %	50 %	0 %	0 %	327399915
50	NC_015319	TC	3	6	29730	29735	0 %	50 %	0 %	50 %	327399916
51	NC_015319	AT	3	6	29878	29883	50 %	50 %	0 %	0 %	327399916
52	NC_015319	TA	4	8	30121	30128	50 %	50 %	0 %	0 %	327399916
53	NC_015319	AC	3	6	30498	30503	50 %	0 %	0 %	50 %	327399916
54	NC_015319	TA	3	6	31062	31067	50 %	50 %	0 %	0 %	327399917
55	NC_015319	CT	3	6	31589	31594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015319	AT	3	6	31815	31820	50 %	50 %	0 %	0 %	327399918
57	NC_015319	AT	4	8	31949	31956	50 %	50 %	0 %	0 %	327399918
58	NC_015319	AG	3	6	32557	32562	50 %	0 %	50 %	0 %	327399918
59	NC_015319	AT	4	8	32563	32570	50 %	50 %	0 %	0 %	327399918
60	NC_015319	AT	3	6	33064	33069	50 %	50 %	0 %	0 %	327399919

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.